More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6280 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6280  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
363 aa  708    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00748066  normal  0.0353239 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  70.42 
 
 
338 aa  459  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  0.242197 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0234  alcohol dehydrogenase  55.74 
 
 
346 aa  401  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0040  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  56.82 
 
 
346 aa  400  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.992723  normal  0.309585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1718  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.54 
 
 
346 aa  397  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271059  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4903  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  64.23 
 
 
338 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0584  alcohol dehydrogenase  59.58 
 
 
346 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1502  alcohol dehydrogenase  60.68 
 
 
349 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0812422 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1680  alcohol dehydrogenase  58.97 
 
 
349 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0950  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.51 
 
 
347 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0831  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.09 
 
 
347 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903746  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22500  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  57.02 
 
 
350 aa  357  9.999999999999999e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.773326  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3663  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  59.17 
 
 
348 aa  355  5e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.305727  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1713  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  57.06 
 
 
335 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1759  alcohol dehydrogenase  57.06 
 
 
335 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1690  alcohol dehydrogenase  58.05 
 
 
335 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.036718  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4297  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.33 
 
 
342 aa  341  1e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143353  normal  0.283215 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4805  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.2 
 
 
351 aa  335  1e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.983858 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04785  alcohol dehydrogenase  57.49 
 
 
343 aa  333  3e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0629663  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2836  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.1 
 
 
353 aa  316  4e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.205929  decreased coverage  0.00273511 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12757  alcohol dehydrogenase  47.65 
 
 
340 aa  296  4e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07850  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  48.86 
 
 
344 aa  281  9e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0885  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.73 
 
 
351 aa  272  6e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0919  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.71 
 
 
351 aa  261  1e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1696  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.76 
 
 
344 aa  257  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.558664  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3786  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.18 
 
 
365 aa  258  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1078  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.85 
 
 
345 aa  256  4e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2867  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.09 
 
 
361 aa  249  5e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0196  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.69 
 
 
357 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3048  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.62 
 
 
355 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1808  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.79 
 
 
357 aa  242  6e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0345  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.99 
 
 
353 aa  242  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2363  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.95 
 
 
353 aa  232  7.000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3964  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.17 
 
 
344 aa  228  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.55 
 
 
341 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  36.55 
 
 
341 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  36.26 
 
 
357 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.26 
 
 
341 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.26 
 
 
341 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.26 
 
 
341 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0547  alcohol dehydrogenase  32.12 
 
 
361 aa  170  3e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.67 
 
 
341 aa  169  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.95 
 
 
342 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  36.73 
 
 
342 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.73 
 
 
342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  36.73 
 
 
342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  36.11 
 
 
340 aa  165  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  36.42 
 
 
342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.58 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  34.63 
 
 
344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0743  alcohol dehydrogenase  33.77 
 
 
366 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  35.64 
 
 
342 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  35.64 
 
 
342 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  32.47 
 
 
349 aa  157  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.31 
 
 
344 aa  157  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.31 
 
 
344 aa  157  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.1 
 
 
341 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.71 
 
 
368 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5201  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.44 
 
 
361 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  34.32 
 
 
342 aa  155  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1980  alcohol dehydrogenase  32.61 
 
 
360 aa  155  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  34.58 
 
 
341 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  34.98 
 
 
341 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.78 
 
 
368 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.32 
 
 
336 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  33.54 
 
 
344 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  36.73 
 
 
342 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  36.51 
 
 
341 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.74 
 
 
343 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.96 
 
 
337 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  35.42 
 
 
343 aa  153  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 
344 aa  153  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 
344 aa  153  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3870  alcohol dehydrogenase  36.73 
 
 
338 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  34.01 
 
 
341 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  41.23 
 
 
344 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.44 
 
 
342 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3009  alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
361 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.39042  normal  0.310098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.1 
 
 
336 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  38.16 
 
 
347 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  39.3 
 
 
348 aa  149  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  33.02 
 
 
337 aa  149  7e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.46 
 
 
353 aa  149  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  34.56 
 
 
344 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.26 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  33.03 
 
 
344 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1391  alcohol dehydrogenase  36.04 
 
 
362 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.487045 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2224  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.22 
 
 
381 aa  146  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  42.47 
 
 
341 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  36.27 
 
 
342 aa  145  9e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.77 
 
 
337 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2883  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.78 
 
 
383 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0752  alcohol dehydrogenase  35.86 
 
 
341 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027127  normal  0.0151897 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.31 
 
 
342 aa  144  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
343 aa  144  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1424  alcohol dehydrogenase  32.88 
 
 
360 aa  143  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.350206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  36.4 
 
 
344 aa  143  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3065  alcohol dehydrogenase  36.2 
 
 
338 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.58 
 
 
336 aa  142  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1837  alcohol dehydrogenase  30.47 
 
 
379 aa  142  8e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.245686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>