More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4903 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4903  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
338 aa  654    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0234  alcohol dehydrogenase  54.34 
 
 
346 aa  398  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1718  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.38 
 
 
346 aa  395  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271059  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0040  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  56.36 
 
 
346 aa  393  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.992723  normal  0.309585 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0950  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.2 
 
 
347 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  61.36 
 
 
338 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  0.242197 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0584  alcohol dehydrogenase  57.23 
 
 
346 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0831  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.34 
 
 
347 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903746  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1502  alcohol dehydrogenase  58.09 
 
 
349 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0812422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6280  alcohol dehydrogenase  63.38 
 
 
363 aa  378  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00748066  normal  0.0353239 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4297  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  67.58 
 
 
342 aa  380  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143353  normal  0.283215 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1680  alcohol dehydrogenase  55.49 
 
 
349 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1713  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  61.76 
 
 
335 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1759  alcohol dehydrogenase  61.76 
 
 
335 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1690  alcohol dehydrogenase  62.07 
 
 
335 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.036718  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04785  alcohol dehydrogenase  54.52 
 
 
343 aa  347  2e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0629663  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22500  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  59.18 
 
 
350 aa  346  4e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.773326  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3663  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.56 
 
 
348 aa  325  9e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.305727  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07850  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  56.93 
 
 
344 aa  317  2e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4805  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.04 
 
 
351 aa  317  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.983858 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2836  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  60.6 
 
 
353 aa  317  3e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.205929  decreased coverage  0.00273511 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0919  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.43 
 
 
351 aa  294  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2867  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.47 
 
 
361 aa  288  1e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1808  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.86 
 
 
357 aa  287  2e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12757  alcohol dehydrogenase  47.16 
 
 
340 aa  287  2e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3786  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.4 
 
 
365 aa  286  4e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0885  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.94 
 
 
351 aa  285  7e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1696  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.21 
 
 
344 aa  276  3e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.558664  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0345  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.63 
 
 
353 aa  258  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3048  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.13 
 
 
355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0196  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.21 
 
 
357 aa  253  5.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1078  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.93 
 
 
345 aa  252  8.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2363  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.37 
 
 
353 aa  247  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3964  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.19 
 
 
344 aa  239  4e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0547  alcohol dehydrogenase  35.16 
 
 
361 aa  194  1e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.74 
 
 
336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.97 
 
 
342 aa  173  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.66 
 
 
342 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.07 
 
 
337 aa  166  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  39.86 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_27980  alcohol dehydrogenase  35.84 
 
 
348 aa  163  4.0000000000000004e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  38.97 
 
 
340 aa  162  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.64 
 
 
341 aa  162  8.000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5201  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.19 
 
 
361 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  39.31 
 
 
342 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.8 
 
 
357 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.8 
 
 
341 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.8 
 
 
341 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.8 
 
 
341 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0743  alcohol dehydrogenase  33.7 
 
 
366 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  36.42 
 
 
344 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  38.14 
 
 
341 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  39.19 
 
 
342 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.8 
 
 
341 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  38.85 
 
 
342 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.8 
 
 
341 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  34.82 
 
 
349 aa  159  5e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.49 
 
 
341 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  39.66 
 
 
342 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
362 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.83 
 
 
343 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  37.11 
 
 
342 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  37.9 
 
 
344 aa  157  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  38.97 
 
 
342 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.97 
 
 
342 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  38.97 
 
 
342 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  39.32 
 
 
344 aa  156  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 
344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  39.19 
 
 
344 aa  156  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.9 
 
 
336 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.54 
 
 
336 aa  155  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  37.72 
 
 
342 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.27 
 
 
353 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.74 
 
 
341 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.48 
 
 
344 aa  153  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.48 
 
 
344 aa  153  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1270  alcohol dehydrogenase class III  34.62 
 
 
359 aa  153  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.303714  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  34.13 
 
 
336 aa  152  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_68558  alcohol dehydrogenase  35.15 
 
 
348 aa  152  8e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.02064  normal  0.599595 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  38.14 
 
 
341 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 
344 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  35.42 
 
 
341 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  37.34 
 
 
344 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3009  alcohol dehydrogenase  31.73 
 
 
361 aa  150  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.39042  normal  0.310098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0752  alcohol dehydrogenase  36.61 
 
 
341 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027127  normal  0.0151897 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.82 
 
 
335 aa  150  3e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  35.82 
 
 
342 aa  150  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3324  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.57 
 
 
344 aa  149  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000796968  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  38.01 
 
 
347 aa  149  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  39.41 
 
 
348 aa  149  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  36.98 
 
 
344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  43.32 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  35.4 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1424  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.350206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.45 
 
 
336 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.77 
 
 
342 aa  146  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3870  alcohol dehydrogenase  40 
 
 
338 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2090  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.43 
 
 
351 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000167964 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.43 
 
 
368 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  29.61 
 
 
350 aa  144  3e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>