More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1078 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1078  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 		 345 aa  697    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3964  zinc-binding alcohol dehydrogenase  69.68 
 
 		 344 aa  488  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0950  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.93 
 
 		 347 aa  292  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0831  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.35 
 
 		 347 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0234  alcohol dehydrogenase  43.8 
 
 		 346 aa  289  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1808  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.47 
 
 		 357 aa  289  6e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0584  alcohol dehydrogenase  44.8 
 
 		 346 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1718  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.64 
 
 		 346 aa  277  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0196  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.19 
 
 		 357 aa  269  5e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0040  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.91 
 
 		 346 aa  268  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.992723  normal  0.309585 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04785  alcohol dehydrogenase  45.59 
 
 		 343 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0629663  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2867  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.53 
 
 		 361 aa  266  2.9999999999999995e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1502  alcohol dehydrogenase  42.94 
 
 		 349 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0812422 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1680  alcohol dehydrogenase  42.49 
 
 		 349 aa  261  8e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0885  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.63 
 
 		 351 aa  256  3e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3786  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.29 
 
 		 365 aa  253  4.0000000000000004e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22500  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  43.84 
 
 		 350 aa  251  1e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.773326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3048  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.13 
 
 		 355 aa  249  6e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07850  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  44.31 
 
 		 344 aa  247  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0919  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.07 
 
 		 351 aa  246  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2363  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.06 
 
 		 353 aa  245  8e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0345  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.93 
 
 		 353 aa  239  4e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1696  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.62 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.558664  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  41.98 
 
 		 338 aa  236  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  0.242197 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4805  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.94 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.983858 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4903  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.93 
 
 		 338 aa  228  8e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2836  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.19 
 
 		 353 aa  226  6e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.205929  decreased coverage  0.00273511 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3663  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.75 
 
 		 348 aa  224  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.305727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1690  alcohol dehydrogenase  43.29 
 
 		 335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.036718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1713  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  42.99 
 
 		 335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1759  alcohol dehydrogenase  42.99 
 
 		 335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6280  alcohol dehydrogenase  43.85 
 
 		 363 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00748066  normal  0.0353239 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4297  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.69 
 
 		 342 aa  217  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143353  normal  0.283215 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12757  alcohol dehydrogenase  39.4 
 
 		 340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0547  alcohol dehydrogenase  32.97 
 
 		 361 aa  172  5e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.986986 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1454  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.94 
 
 		 371 aa  159  7e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1424  alcohol dehydrogenase  38.76 
 
 		 360 aa  159  7e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.350206 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2224  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.88 
 
 		 381 aa  153  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  41.51 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0698  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.72 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.86 
 
 		 337 aa  146  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  34.98 
 
 		 364 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  34.72 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  34.72 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3239  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  33.13 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.08 
 
 		 336 aa  143  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.43 
 
 		 354 aa  143  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  32.65 
 
 		 352 aa  142  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  38.29 
 
 		 344 aa  142  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  34.13 
 
 		 354 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.06 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 		 365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.83 
 
 		 354 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  38.52 
 
 		 344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  34.69 
 
 		 342 aa  139  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.72 
 
 		 368 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  29.78 
 
 		 350 aa  139  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  36.67 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1073  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.27 
 
 		 351 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.25 
 
 		 356 aa  138  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1089  alcohol dehydrogenase  31.27 
 
 		 351 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25524  normal  0.164937 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  37.55 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3075  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.35 
 
 		 347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1496  alcohol dehydrogenase  35.94 
 
 		 342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000183073  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1328  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.83 
 
 		 390 aa  137  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975088  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1380  alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 		 348 aa  136  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378076  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3881  alcohol dehydrogenase  29.4 
 
 		 391 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0212673 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1334  alcohol dehydrogenase  31.58 
 
 		 344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  31.2 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  36.57 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  32.84 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1016  alcohol dehydrogenase  29.55 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0764  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.55 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  30.46 
 
 		 350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 		 362 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  31.82 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  35.69 
 
 		 344 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  31.87 
 
 		 342 aa  133  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.8 
 
 		 343 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  35.42 
 
 		 344 aa  132  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0720  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.43 
 
 		 342 aa  132  7.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.597384 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1270  alcohol dehydrogenase class III  32.77 
 
 		 359 aa  132  9e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.303714  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4997  alcohol dehydrogenase  31.48 
 
 		 348 aa  132  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3224  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.85 
 
 		 357 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0127  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.39 
 
 		 345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  31.2 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1980  alcohol dehydrogenase  32.11 
 
 		 360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  32.37 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.95 
 
 		 335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  35.51 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  36.06 
 
 		 344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4801  alcohol dehydrogenase  30.39 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0751128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2089  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.74 
 
 		 385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.45 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1391  alcohol dehydrogenase  40.18 
 
 		 362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.487045 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0503  alcohol dehydrogenase  30.5 
 
 		 362 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472686 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  36.46 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  29.71 
 
 		 356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 		 373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3657  alcohol dehydrogenase  31.9 
 
 		 347 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal  0.2926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>