More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4893 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4893  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
330 aa  669    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709624  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.85 
 
 
346 aa  325  9e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3075  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  46.48 
 
 
347 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4997  alcohol dehydrogenase  47.72 
 
 
348 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1380  alcohol dehydrogenase  47.11 
 
 
348 aa  311  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378076  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1073  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  46.5 
 
 
351 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1089  alcohol dehydrogenase  46.5 
 
 
351 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25524  normal  0.164937 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0219  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.54 
 
 
350 aa  308  6.999999999999999e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0322  alcohol dehydrogenase  48.62 
 
 
347 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.65143  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1221  alcohol dehydrogenase  44.95 
 
 
343 aa  304  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4901  alcohol dehydrogenase  45.54 
 
 
360 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3962  alcohol dehydrogenase  45.15 
 
 
351 aa  299  5e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1334  alcohol dehydrogenase  46.04 
 
 
344 aa  298  8e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.51 
 
 
346 aa  296  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.539752  normal  0.655263 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2090  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.88 
 
 
351 aa  291  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000167964 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1091  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  47.4 
 
 
342 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5564  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.12 
 
 
346 aa  288  8e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175264  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2366  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.46 
 
 
347 aa  286  4e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.0010665  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3239  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  45.59 
 
 
356 aa  286  5e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4415  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.73 
 
 
345 aa  281  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4548  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.73 
 
 
355 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00643704 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.38 
 
 
351 aa  281  1e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000634163  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5816  alcohol dehydrogenase  42.99 
 
 
346 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.136095 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2034  hypothetical protein  44.34 
 
 
346 aa  280  3e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1928  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.34 
 
 
370 aa  280  3e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0194  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  44.04 
 
 
345 aa  278  7e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1112  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.39 
 
 
351 aa  278  9e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.257407  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1100  alcohol dehydrogenase  48.75 
 
 
299 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0318515  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2112  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.51 
 
 
350 aa  278  1e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0323338  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1860  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.21 
 
 
346 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3657  alcohol dehydrogenase  43.73 
 
 
347 aa  276  3e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal  0.2926 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1565  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.29 
 
 
349 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.965017  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0753  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.29 
 
 
346 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574599  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1234  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  43.29 
 
 
346 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1718  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.29 
 
 
346 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0709  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.29 
 
 
346 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470076  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1160  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  43.29 
 
 
346 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2432  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.29 
 
 
346 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1713  alcohol dehydrogenase  44.34 
 
 
343 aa  273  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  44.04 
 
 
346 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0924  putative zinc-dependent alcohol dehydrogenase (oxidoreductase)  42.2 
 
 
345 aa  272  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.175832  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  43.73 
 
 
346 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.73 
 
 
345 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0642635 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5892  alcohol dehydrogenase  43.29 
 
 
346 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032769  normal  0.939128 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  39.43 
 
 
352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2137  alcohol dehydrogenase  36.19 
 
 
351 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0423941 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0010  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.09 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.133832  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0669  alcohol dehydrogenase  35.6 
 
 
374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.704397  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0203  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
357 aa  179  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0325811 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.29 
 
 
382 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.14 
 
 
384 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3346  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.2 
 
 
357 aa  176  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.34 
 
 
385 aa  176  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  hitchhiker  0.00205277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.97 
 
 
385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3669  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.2 
 
 
386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.949441  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07420  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  32.82 
 
 
357 aa  173  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3465  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.84 
 
 
366 aa  172  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.901244  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  31.82 
 
 
422 aa  172  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.57 
 
 
384 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.56 
 
 
388 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.17 
 
 
354 aa  172  9e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2536  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
357 aa  172  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.563542  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3032  alcohol dehydrogenase  33.74 
 
 
357 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4212  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32 
 
 
376 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000750849  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4753  alcohol dehydrogenase  31.82 
 
 
402 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209038  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0265  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.44 
 
 
371 aa  169  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.901967  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08406  Alcohol dehydrogenase (Eurofung)  31.53 
 
 
350 aa  169  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2916  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  31.72 
 
 
492 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843639  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2064  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  32.83 
 
 
357 aa  169  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1755  alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 
403 aa  169  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3514  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
373 aa  169  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2760  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.72 
 
 
425 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1142  alcohol dehydrogenase  31.72 
 
 
417 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.517956  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04540  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02810)  32.83 
 
 
355 aa  169  8e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.825375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3148  alcohol dehydrogenase  32.48 
 
 
382 aa  169  8e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.539421  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4130  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.45 
 
 
343 aa  169  8e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 
415 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.56 
 
 
410 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.46 
 
 
410 aa  168  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.86 
 
 
382 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.2 
 
 
405 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3663  hypothetical protein  32.8 
 
 
394 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184617  normal  0.501234 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3114  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.28 
 
 
377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3104  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  32.53 
 
 
394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.345929  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3833  alcohol dehydrogenase  32.53 
 
 
394 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24597  normal  0.375314 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5660  alcohol dehydrogenase  31.81 
 
 
401 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1392  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.81 
 
 
401 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2124  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.28 
 
 
377 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.770168  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6437  alcohol dehydrogenase  31.81 
 
 
401 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.632433  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  31.61 
 
 
384 aa  165  8e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3145  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.99 
 
 
377 aa  165  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2657  alcohol dehydrogenase  31.39 
 
 
388 aa  165  8e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0835  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29 
 
 
396 aa  165  8e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.202579 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4441  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.81 
 
 
384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204388  normal  0.287337 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6027  alcohol dehydrogenase  31.81 
 
 
401 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2838  alcohol dehydrogenase, glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  31.99 
 
 
377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.409585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3133  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.99 
 
 
377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1320  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.43 
 
 
384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106118  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2512  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 
346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.881464  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0967  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.72 
 
 
366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.635093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>