More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0570 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
346 aa  700    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0322  alcohol dehydrogenase  75 
 
 
347 aa  547  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.65143  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1334  alcohol dehydrogenase  72.01 
 
 
344 aa  522  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  70.93 
 
 
345 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0642635 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  69.65 
 
 
346 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.539752  normal  0.655263 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1928  zinc-binding alcohol dehydrogenase  70.64 
 
 
370 aa  513  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0924  putative zinc-dependent alcohol dehydrogenase (oxidoreductase)  69.97 
 
 
345 aa  512  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.175832  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2034  hypothetical protein  69.48 
 
 
346 aa  511  1e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5564  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  68.22 
 
 
346 aa  509  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175264  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3657  alcohol dehydrogenase  69.77 
 
 
347 aa  508  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal  0.2926 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  67.35 
 
 
346 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1860  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  66.47 
 
 
346 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5816  alcohol dehydrogenase  64.72 
 
 
346 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.136095 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  66.18 
 
 
346 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5892  alcohol dehydrogenase  66.18 
 
 
346 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032769  normal  0.939128 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0753  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  65.6 
 
 
346 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574599  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0709  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  65.6 
 
 
346 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1234  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  65.6 
 
 
346 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2432  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  65.6 
 
 
346 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1565  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  65.31 
 
 
349 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.965017  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1160  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  65.6 
 
 
346 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1718  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  65.6 
 
 
346 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1221  alcohol dehydrogenase  66.28 
 
 
343 aa  486  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4548  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  64.53 
 
 
355 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00643704 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4415  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  64.53 
 
 
345 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0194  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  64.64 
 
 
345 aa  478  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1091  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  63.37 
 
 
342 aa  458  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3075  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  59.08 
 
 
347 aa  460  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3962  alcohol dehydrogenase  61.71 
 
 
351 aa  451  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1713  alcohol dehydrogenase  65.99 
 
 
343 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2366  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  61.56 
 
 
347 aa  450  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.0010665  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2090  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  60.97 
 
 
351 aa  445  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000167964 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  60.52 
 
 
351 aa  442  1e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000634163  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2112  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  61.67 
 
 
350 aa  429  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0323338  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1380  alcohol dehydrogenase  55.65 
 
 
348 aa  419  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378076  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4997  alcohol dehydrogenase  54.49 
 
 
348 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1073  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  53.47 
 
 
351 aa  401  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1089  alcohol dehydrogenase  53.47 
 
 
351 aa  401  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25524  normal  0.164937 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1112  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.83 
 
 
351 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.257407  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4901  alcohol dehydrogenase  51.3 
 
 
360 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3239  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  49.57 
 
 
356 aa  368  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1100  alcohol dehydrogenase  57.05 
 
 
299 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0318515  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0219  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.15 
 
 
350 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  48.55 
 
 
352 aa  330  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4893  alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 
330 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709624  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2137  alcohol dehydrogenase  42.17 
 
 
351 aa  271  8.000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0423941 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.96 
 
 
354 aa  245  8e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0010  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.07 
 
 
346 aa  242  5e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.133832  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5645  alcohol dehydrogenase  37.25 
 
 
357 aa  238  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.419975 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0203  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.82 
 
 
357 aa  235  9e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0325811 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1356  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  36.93 
 
 
366 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3346  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.38 
 
 
357 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0669  alcohol dehydrogenase  38.38 
 
 
374 aa  229  5e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.704397  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3465  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.41 
 
 
366 aa  228  9e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.901244  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3188  alcohol dehydrogenase  35.52 
 
 
366 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07420  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  36.52 
 
 
357 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0265  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.68 
 
 
371 aa  226  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.901967  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2008  alcohol dehydrogenase protein  36.09 
 
 
364 aa  226  4e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3032  alcohol dehydrogenase  37.6 
 
 
357 aa  225  9e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2240  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.05 
 
 
355 aa  224  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0360217 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0967  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.14 
 
 
366 aa  225  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.635093  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1049  alcohol dehydrogenase  36.14 
 
 
366 aa  225  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.050805 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3460  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.87 
 
 
354 aa  223  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00073426  hitchhiker  0.00463895 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3514  alcohol dehydrogenase  36.93 
 
 
373 aa  223  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3852  alcohol dehydrogenase  35.05 
 
 
365 aa  223  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.5 
 
 
384 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2064  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  36.87 
 
 
357 aa  222  9e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4352  alcohol dehydrogenase  36.44 
 
 
354 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.25 
 
 
387 aa  219  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.23 
 
 
384 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.22 
 
 
385 aa  218  8.999999999999998e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.67 
 
 
410 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2536  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
357 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.563542  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.16 
 
 
410 aa  216  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1320  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.85 
 
 
384 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106118  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3669  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.42 
 
 
386 aa  212  9e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.949441  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.14 
 
 
382 aa  209  6e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1308  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.69 
 
 
353 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277534  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2300  alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 
388 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  hitchhiker  0.00000777829 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2149  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.85 
 
 
386 aa  207  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.406335  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08406  Alcohol dehydrogenase (Eurofung)  34.39 
 
 
350 aa  207  3e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4017  alcohol dehydrogenase  34.42 
 
 
382 aa  207  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.530875 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4753  alcohol dehydrogenase  34.87 
 
 
402 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209038  normal  0.806258 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04540  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02810)  35.67 
 
 
355 aa  206  6e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.825375 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2916  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.1 
 
 
492 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843639  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1142  alcohol dehydrogenase  34.1 
 
 
417 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.517956  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2760  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.1 
 
 
425 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5432  alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
401 aa  205  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250505  normal  0.150153 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2481  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.28 
 
 
387 aa  205  9e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4498  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.13 
 
 
389 aa  205  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1016  alcohol dehydrogenase  33.68 
 
 
390 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1392  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.9 
 
 
401 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5660  alcohol dehydrogenase  33.68 
 
 
401 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6437  alcohol dehydrogenase  32.9 
 
 
401 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.632433  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2124  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.56 
 
 
377 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.770168  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.36 
 
 
389 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6027  alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 
401 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  32.97 
 
 
422 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2641  alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 
396 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0246923  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.63 
 
 
405 aa  203  3e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>