More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4879 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 		 346 aa  709    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.539752  normal  0.655263 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1334  alcohol dehydrogenase  74.64 
 
 		 344 aa  536  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  74.42 
 
 		 345 aa  521  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0642635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0924  putative zinc-dependent alcohol dehydrogenase (oxidoreductase)  72.59 
 
 		 345 aa  518  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.175832  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0322  alcohol dehydrogenase  70.35 
 
 		 347 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.65143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  69.65 
 
 		 346 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5816  alcohol dehydrogenase  70.26 
 
 		 346 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.136095 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1928  zinc-binding alcohol dehydrogenase  70.35 
 
 		 370 aa  511  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3657  alcohol dehydrogenase  70.64 
 
 		 347 aa  507  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal  0.2926 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5564  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  69.1 
 
 		 346 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175264  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2034  hypothetical protein  67.73 
 
 		 346 aa  502  1e-141  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  68.22 
 
 		 346 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  68.8 
 
 		 346 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5892  alcohol dehydrogenase  67.64 
 
 		 346 aa  498  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032769  normal  0.939128 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0709  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  69.1 
 
 		 346 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1234  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  69.1 
 
 		 346 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2432  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  69.1 
 
 		 346 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1160  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  69.1 
 
 		 346 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1860  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  67.64 
 
 		 346 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0753  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  69.1 
 
 		 346 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574599  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1718  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  69.1 
 
 		 346 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1565  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  68.51 
 
 		 349 aa  491  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.965017  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0194  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  65.51 
 
 		 345 aa  478  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4548  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  64.53 
 
 		 355 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00643704 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4415  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  64.53 
 
 		 345 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3075  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  61.96 
 
 		 347 aa  464  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1221  alcohol dehydrogenase  61.92 
 
 		 343 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1091  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  61.05 
 
 		 342 aa  437  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1713  alcohol dehydrogenase  63.37 
 
 		 343 aa  437  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2112  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  61.78 
 
 		 350 aa  420  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0323338  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2366  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.2 
 
 		 347 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.0010665  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3962  alcohol dehydrogenase  56.86 
 
 		 351 aa  415  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  57.06 
 
 		 351 aa  414  1e-114  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000634163  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2090  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.26 
 
 		 351 aa  414  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000167964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1073  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  56.36 
 
 		 351 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1089  alcohol dehydrogenase  56.36 
 
 		 351 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25524  normal  0.164937 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1380  alcohol dehydrogenase  55.65 
 
 		 348 aa  408  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378076  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4901  alcohol dehydrogenase  53.31 
 
 		 360 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4997  alcohol dehydrogenase  54.49 
 
 		 348 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1112  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  59.26 
 
 		 351 aa  395  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.257407  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3239  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  52.17 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1100  alcohol dehydrogenase  60.07 
 
 		 299 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0318515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0219  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.01 
 
 		 350 aa  365  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  45.71 
 
 		 352 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4893  alcohol dehydrogenase  44.51 
 
 		 330 aa  296  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2137  alcohol dehydrogenase  41.03 
 
 		 351 aa  255  9e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423941 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0010  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.79 
 
 		 346 aa  248  7e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.133832  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5645  alcohol dehydrogenase  39.11 
 
 		 357 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.419975 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07420  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  39.04 
 
 		 357 aa  229  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0265  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.75 
 
 		 371 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.901967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0203  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.38 
 
 		 357 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0325811 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3669  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.68 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.949441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3188  alcohol dehydrogenase  37.16 
 
 		 366 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0669  alcohol dehydrogenase  37.99 
 
 		 374 aa  222  6e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.704397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3514  alcohol dehydrogenase  37.68 
 
 		 373 aa  222  7e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.45 
 
 		 385 aa  221  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3346  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.1 
 
 		 357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1356  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  37.2 
 
 		 366 aa  219  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.87 
 
 		 387 aa  219  7e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.41 
 
 		 410 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3465  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.07 
 
 		 366 aa  218  8.999999999999998e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.901244  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3032  alcohol dehydrogenase  37.33 
 
 		 357 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289929  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08406  Alcohol dehydrogenase (Eurofung)  36.57 
 
 		 350 aa  216  4e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.41 
 
 		 410 aa  216  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.69 
 
 		 384 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2064  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  37.82 
 
 		 357 aa  216  7e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0967  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.81 
 
 		 366 aa  215  8e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.635093  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1049  alcohol dehydrogenase  36.81 
 
 		 366 aa  215  8e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.050805 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.6 
 
 		 382 aa  214  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36660  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  35.14 
 
 		 415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000975221  normal  0.705006 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.34 
 
 		 354 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.94 
 
 		 405 aa  213  2.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2149  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.7 
 
 		 386 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.406335  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.33 
 
 		 384 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3852  alcohol dehydrogenase  36.09 
 
 		 365 aa  212  7e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2008  alcohol dehydrogenase protein  35.16 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4017  alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 		 382 aa  209  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530875 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 		 415 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1320  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.33 
 
 		 384 aa  208  9e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106118  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.29 
 
 		 388 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0575  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.85 
 
 		 389 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0139  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.08 
 
 		 401 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4441  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.53 
 
 		 384 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204388  normal  0.287337 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4498  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.59 
 
 		 389 aa  206  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2481  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.28 
 
 		 387 aa  206  4e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0122  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.45 
 
 		 401 aa  206  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.566245 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1016  alcohol dehydrogenase  33.08 
 
 		 390 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24840  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  33.67 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  33.86 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.74 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0764  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.82 
 
 		 390 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3665  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.99 
 
 		 388 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.698913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2300  alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 		 388 aa  202  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  hitchhiker  0.00000777829 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3527  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.22 
 
 		 411 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129082  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3368  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.51 
 
 		 384 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  32.89 
 
 		 422 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1328  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.31 
 
 		 390 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975088  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4753  alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209038  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5445  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 		 390 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.430041  normal  0.349478 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.74 
 
 		 393 aa  200  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>