More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4415 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0194  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  91.86 
 
 
345 aa  650    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4415  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
345 aa  698    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4548  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
355 aa  699    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00643704 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  78.2 
 
 
346 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  77.62 
 
 
346 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5564  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  77.91 
 
 
346 aa  551  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175264  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5816  alcohol dehydrogenase  76.38 
 
 
346 aa  550  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.136095 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1860  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  77.03 
 
 
346 aa  547  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5892  alcohol dehydrogenase  76.38 
 
 
346 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032769  normal  0.939128 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1565  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  76.16 
 
 
349 aa  535  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.965017  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0709  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  74.42 
 
 
346 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0753  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  74.42 
 
 
346 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574599  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2432  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  74.42 
 
 
346 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1718  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  74.42 
 
 
346 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3657  alcohol dehydrogenase  72.97 
 
 
347 aa  527  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal  0.2926 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1160  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  74.42 
 
 
346 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1234  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  74.42 
 
 
346 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  72.17 
 
 
345 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0642635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0924  putative zinc-dependent alcohol dehydrogenase (oxidoreductase)  71.59 
 
 
345 aa  511  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.175832  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1928  zinc-binding alcohol dehydrogenase  71.88 
 
 
370 aa  513  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2034  hypothetical protein  68.6 
 
 
346 aa  499  1e-140  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1334  alcohol dehydrogenase  69.39 
 
 
344 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  64.53 
 
 
346 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  64.53 
 
 
346 aa  473  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.539752  normal  0.655263 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0322  alcohol dehydrogenase  65.51 
 
 
347 aa  464  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.65143  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2366  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.51 
 
 
347 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.0010665  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3075  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  59.83 
 
 
347 aa  423  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1221  alcohol dehydrogenase  58.84 
 
 
343 aa  420  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1091  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  57.68 
 
 
342 aa  409  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2090  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.14 
 
 
351 aa  403  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000167964 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3962  alcohol dehydrogenase  56.41 
 
 
351 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1713  alcohol dehydrogenase  57.97 
 
 
343 aa  391  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  52.75 
 
 
351 aa  384  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000634163  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1380  alcohol dehydrogenase  55.2 
 
 
348 aa  383  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378076  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1073  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  53.62 
 
 
351 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1089  alcohol dehydrogenase  53.62 
 
 
351 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25524  normal  0.164937 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4997  alcohol dehydrogenase  54.05 
 
 
348 aa  371  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4901  alcohol dehydrogenase  53.91 
 
 
360 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2112  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  54.62 
 
 
350 aa  369  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0323338  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3239  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  52.91 
 
 
356 aa  361  1e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1112  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.71 
 
 
351 aa  349  4e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.257407  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1100  alcohol dehydrogenase  56.71 
 
 
299 aa  345  6e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0318515  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0219  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.45 
 
 
350 aa  336  5e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  45.66 
 
 
352 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4893  alcohol dehydrogenase  43.73 
 
 
330 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709624  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2137  alcohol dehydrogenase  41.88 
 
 
351 aa  255  6e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0423941 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0010  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.71 
 
 
346 aa  231  1e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.133832  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1356  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  38.42 
 
 
366 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3188  alcohol dehydrogenase  36.56 
 
 
366 aa  225  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0265  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.65 
 
 
371 aa  225  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.901967  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2064  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  38.66 
 
 
357 aa  222  7e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0203  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.54 
 
 
357 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0325811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3032  alcohol dehydrogenase  38.44 
 
 
357 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0669  alcohol dehydrogenase  37.82 
 
 
374 aa  220  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.704397  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3514  alcohol dehydrogenase  38.53 
 
 
373 aa  219  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3346  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.1 
 
 
357 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07420  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  38.1 
 
 
357 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5645  alcohol dehydrogenase  36.41 
 
 
357 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.419975 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.69 
 
 
354 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.83 
 
 
384 aa  215  8e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3465  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.69 
 
 
366 aa  215  8e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.901244  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.56 
 
 
384 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2008  alcohol dehydrogenase protein  34.88 
 
 
364 aa  213  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1049  alcohol dehydrogenase  37.18 
 
 
366 aa  212  9e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.050805 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0967  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.18 
 
 
366 aa  212  9e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.635093  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3460  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.69 
 
 
354 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00073426  hitchhiker  0.00463895 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2536  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.82 
 
 
357 aa  209  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.563542  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5660  alcohol dehydrogenase  35.73 
 
 
401 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36660  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  35.22 
 
 
415 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000975221  normal  0.705006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3852  alcohol dehydrogenase  34.69 
 
 
365 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3669  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.6 
 
 
386 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.949441  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1320  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.1 
 
 
384 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106118  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4017  alcohol dehydrogenase  34.6 
 
 
382 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.530875 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6027  alcohol dehydrogenase  44.23 
 
 
401 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1392  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44.23 
 
 
401 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6437  alcohol dehydrogenase  44.23 
 
 
401 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.632433  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24840  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  42.32 
 
 
444 aa  205  9e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5432  alcohol dehydrogenase  34.96 
 
 
401 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250505  normal  0.150153 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04540  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02810)  34.94 
 
 
355 aa  204  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.825375 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5217  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.79 
 
 
384 aa  203  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.97 
 
 
382 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08406  Alcohol dehydrogenase (Eurofung)  35.75 
 
 
350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  34.25 
 
 
384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  33.68 
 
 
415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2240  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.31 
 
 
355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0360217 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.92 
 
 
410 aa  200  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  34.05 
 
 
422 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.67 
 
 
410 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4352  alcohol dehydrogenase  34.62 
 
 
354 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.71 
 
 
385 aa  200  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1778  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.79 
 
 
382 aa  199  6e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.080092  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.5 
 
 
387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3112  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  34.54 
 
 
388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.152698  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2760  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  43.08 
 
 
425 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1142  alcohol dehydrogenase  43.08 
 
 
417 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.517956  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3368  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.88 
 
 
384 aa  196  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2916  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  43.08 
 
 
492 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843639  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2641  alcohol dehydrogenase  34.53 
 
 
396 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0246923  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4441  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.97 
 
 
384 aa  193  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204388  normal  0.287337 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4753  alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 
402 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209038  normal  0.806258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>