More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0194 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0194  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  100 
 
 		 345 aa  699    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4415  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  91.86 
 
 		 345 aa  650    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4548  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  91.86 
 
 		 355 aa  651    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00643704 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  77.84 
 
 		 346 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  76.97 
 
 		 346 aa  557  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5564  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  77.55 
 
 		 346 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5816  alcohol dehydrogenase  76.09 
 
 		 346 aa  549  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.136095 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5892  alcohol dehydrogenase  75.51 
 
 		 346 aa  546  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032769  normal  0.939128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1860  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  75.8 
 
 		 346 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3657  alcohol dehydrogenase  73.26 
 
 		 347 aa  526  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal  0.2926 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1565  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  74.34 
 
 		 349 aa  523  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.965017  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1160  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  73.47 
 
 		 346 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0709  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  73.47 
 
 		 346 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470076  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  72.67 
 
 		 345 aa  518  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0642635 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1234  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  73.47 
 
 		 346 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2432  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  73.47 
 
 		 346 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1718  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  73.47 
 
 		 346 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0753  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  73.47 
 
 		 346 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574599  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0924  putative zinc-dependent alcohol dehydrogenase (oxidoreductase)  72.59 
 
 		 345 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.175832  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1928  zinc-binding alcohol dehydrogenase  72.59 
 
 		 370 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1334  alcohol dehydrogenase  70.26 
 
 		 344 aa  502  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2034  hypothetical protein  67.64 
 
 		 346 aa  492  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  65.51 
 
 		 346 aa  478  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.539752  normal  0.655263 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  64.64 
 
 		 346 aa  478  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0322  alcohol dehydrogenase  65.89 
 
 		 347 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.65143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2366  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.23 
 
 		 347 aa  422  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.0010665  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3075  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  59.42 
 
 		 347 aa  420  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1221  alcohol dehydrogenase  58.89 
 
 		 343 aa  418  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2090  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.29 
 
 		 351 aa  408  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000167964 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1091  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  57.14 
 
 		 342 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3962  alcohol dehydrogenase  57.31 
 
 		 351 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1713  alcohol dehydrogenase  58.02 
 
 		 343 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1073  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  55.81 
 
 		 351 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1089  alcohol dehydrogenase  55.81 
 
 		 351 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25524  normal  0.164937 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  53.2 
 
 		 351 aa  383  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000634163  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4901  alcohol dehydrogenase  55.81 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1380  alcohol dehydrogenase  55.23 
 
 		 348 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378076  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2112  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  56.23 
 
 		 350 aa  372  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0323338  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4997  alcohol dehydrogenase  54.36 
 
 		 348 aa  371  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3239  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  53.35 
 
 		 356 aa  363  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1100  alcohol dehydrogenase  58.39 
 
 		 299 aa  352  7e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0318515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1112  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.87 
 
 		 351 aa  349  4e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.257407  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0219  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.73 
 
 		 350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  47.59 
 
 		 352 aa  311  1e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4893  alcohol dehydrogenase  44.04 
 
 		 330 aa  278  7e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2137  alcohol dehydrogenase  43.66 
 
 		 351 aa  263  4.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423941 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0010  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.17 
 
 		 346 aa  236  3e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.133832  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0203  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.42 
 
 		 357 aa  228  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0325811 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0265  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.66 
 
 		 371 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.901967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3188  alcohol dehydrogenase  36.93 
 
 		 366 aa  225  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0669  alcohol dehydrogenase  39.36 
 
 		 374 aa  225  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.704397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1356  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  39.44 
 
 		 366 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3514  alcohol dehydrogenase  39.53 
 
 		 373 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3032  alcohol dehydrogenase  39.19 
 
 		 357 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2064  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  39.36 
 
 		 357 aa  220  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3669  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.97 
 
 		 386 aa  219  7.999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.949441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5645  alcohol dehydrogenase  37.9 
 
 		 357 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.419975 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07420  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  38.19 
 
 		 357 aa  215  9e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3346  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.78 
 
 		 357 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4017  alcohol dehydrogenase  35.15 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530875 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3465  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.62 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.901244  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.09 
 
 		 354 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2008  alcohol dehydrogenase protein  35.98 
 
 		 364 aa  211  1e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.13 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2536  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.04 
 
 		 357 aa  209  5e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.563542  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0967  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.75 
 
 		 366 aa  209  6e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.635093  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1049  alcohol dehydrogenase  37.75 
 
 		 366 aa  209  6e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.050805 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5660  alcohol dehydrogenase  34.96 
 
 		 401 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.79 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.87 
 
 		 384 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3460  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.09 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00073426  hitchhiker  0.00463895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36660  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  34.2 
 
 		 415 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000975221  normal  0.705006 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08406  Alcohol dehydrogenase (Eurofung)  36.8 
 
 		 350 aa  206  4e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5217  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.06 
 
 		 384 aa  206  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.42 
 
 		 385 aa  206  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.6 
 
 		 384 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.31 
 
 		 410 aa  205  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1392  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34 
 
 		 401 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6437  alcohol dehydrogenase  34 
 
 		 401 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.632433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3852  alcohol dehydrogenase  36.29 
 
 		 365 aa  205  9e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6027  alcohol dehydrogenase  42.69 
 
 		 401 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.82 
 
 		 410 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24840  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  41.44 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  33.78 
 
 		 422 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.25 
 
 		 382 aa  203  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3368  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.43 
 
 		 384 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5432  alcohol dehydrogenase  34.19 
 
 		 401 aa  203  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250505  normal  0.150153 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1778  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.79 
 
 		 382 aa  202  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.080092  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2760  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  43.46 
 
 		 425 aa  202  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3112  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  34.47 
 
 		 388 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.152698  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1142  alcohol dehydrogenase  43.46 
 
 		 417 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.517956  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4441  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.06 
 
 		 384 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204388  normal  0.287337 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2916  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.27 
 
 		 492 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843639  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04540  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02810)  34.51 
 
 		 355 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.825375 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1320  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.14 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106118  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  34.52 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 		 415 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2641  alcohol dehydrogenase  34.99 
 
 		 396 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0246923  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06010  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  37.64 
 
 		 351 aa  199  5e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4753  alcohol dehydrogenase  34.1 
 
 		 402 aa  199  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209038  normal  0.806258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>