More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1778 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1778  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
382 aa  788    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.080092  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  82.72 
 
 
382 aa  666    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  79.58 
 
 
382 aa  653    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3148  alcohol dehydrogenase  77.51 
 
 
382 aa  627  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.539421  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4017  alcohol dehydrogenase  66.75 
 
 
382 aa  535  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.530875 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4441  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  61.26 
 
 
384 aa  508  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204388  normal  0.287337 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5217  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  59.95 
 
 
384 aa  503  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3368  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  62.04 
 
 
384 aa  500  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1507  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  59.74 
 
 
382 aa  486  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3669  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.92 
 
 
386 aa  458  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.949441  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  57.26 
 
 
384 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.85 
 
 
384 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.33 
 
 
384 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1320  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.96 
 
 
384 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106118  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2149  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.38 
 
 
386 aa  341  2e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.406335  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.01 
 
 
389 aa  335  9e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.9 
 
 
388 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4212  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.33 
 
 
376 aa  330  3e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000750849  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0065  alcohol dehydrogenase  45.9 
 
 
386 aa  328  7e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2300  alcohol dehydrogenase  43.19 
 
 
388 aa  327  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  hitchhiker  0.00000777829 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.73 
 
 
392 aa  325  7e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3187  alcohol dehydrogenase  43.73 
 
 
389 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  46.04 
 
 
405 aa  325  8.000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5561  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.71 
 
 
389 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210102  normal  0.0249106 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.49 
 
 
387 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  42.6 
 
 
398 aa  318  7.999999999999999e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.609837  decreased coverage  0.000185041 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4057  alcohol dehydrogenase  43.11 
 
 
433 aa  317  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.788461  normal  0.848638 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2370  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.94 
 
 
389 aa  316  4e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0165  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.05 
 
 
389 aa  315  8e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0575  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.85 
 
 
389 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4498  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.48 
 
 
389 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1223  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 
390 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417243 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.08 
 
 
392 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.62 
 
 
393 aa  313  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2429  alcohol dehydrogenase  41.58 
 
 
400 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0410446  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3970  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.84 
 
 
400 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2984  alcohol dehydrogenase  41.33 
 
 
400 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.29856  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0754  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44.36 
 
 
388 aa  309  4e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0748  alcohol dehydrogenase  44.36 
 
 
388 aa  309  4e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57534  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0768  alcohol dehydrogenase  44.36 
 
 
388 aa  309  4e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.87513  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.69 
 
 
385 aa  308  6.999999999999999e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2860  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.92 
 
 
389 aa  308  8e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.489026  normal  0.707248 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3112  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  41.13 
 
 
388 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.152698  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3527  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.65 
 
 
411 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129082  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2481  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.62 
 
 
387 aa  306  3e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5445  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.56 
 
 
390 aa  305  6e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.430041  normal  0.349478 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0166  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  42.39 
 
 
395 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912922  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0139  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43 
 
 
401 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.48 
 
 
391 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0728  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase (glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase) (fdh) (faldh)  41.18 
 
 
412 aa  302  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0122  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.75 
 
 
401 aa  301  9e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.566245 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0655  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  41.18 
 
 
412 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0669  alcohol dehydrogenase GroES-like domain protein  41.18 
 
 
412 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432264  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6246  alcohol dehydrogenase  43.08 
 
 
389 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.829786 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2657  alcohol dehydrogenase  41.39 
 
 
388 aa  301  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0774  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase (glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase) (fdh) (faldh)  40.92 
 
 
412 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1246  zinc-type alcohol dehydrogenase  39.69 
 
 
385 aa  300  3e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.939827  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3663  hypothetical protein  42.53 
 
 
394 aa  299  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184617  normal  0.501234 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3683  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.84 
 
 
397 aa  299  5e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0714  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  40.92 
 
 
412 aa  298  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4673  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.71 
 
 
389 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4359  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.59 
 
 
389 aa  297  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3145  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.84 
 
 
377 aa  296  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3155  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  39.84 
 
 
377 aa  297  3e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.633298  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3114  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  39.84 
 
 
377 aa  296  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0695  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  40.92 
 
 
412 aa  296  3e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1875  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  40.62 
 
 
411 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0835  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.95 
 
 
396 aa  296  5e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.202579 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2124  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  39.84 
 
 
377 aa  296  5e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.770168  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3833  alcohol dehydrogenase  42.75 
 
 
394 aa  295  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24597  normal  0.375314 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2881  alcohol dehydrogenase, glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  39.84 
 
 
377 aa  295  7e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2838  alcohol dehydrogenase, glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  39.84 
 
 
377 aa  295  7e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.409585  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00577  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  40.66 
 
 
412 aa  295  8e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00566  hypothetical protein  40.66 
 
 
412 aa  295  8e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3133  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  39.58 
 
 
377 aa  295  9e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3016  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.41 
 
 
412 aa  295  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2912  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.84 
 
 
377 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.549195  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3104  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  42.75 
 
 
394 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.345929  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3131  alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 
377 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3035  alcohol dehydrogenase  40.41 
 
 
412 aa  295  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.69 
 
 
385 aa  293  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  hitchhiker  0.00205277 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2641  alcohol dehydrogenase  39.29 
 
 
396 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0246923  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0660  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  40.15 
 
 
412 aa  293  4e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  40.41 
 
 
412 aa  292  6e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4691  alcohol dehydrogenase  41.94 
 
 
389 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3665  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.63 
 
 
388 aa  287  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.698913  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3881  alcohol dehydrogenase  41.79 
 
 
391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0212673 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4801  alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 
389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0751128 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5822  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.12 
 
 
391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0160  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.48 
 
 
392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1441  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.89 
 
 
390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.42991 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2482  putative zinc-containing dehydrogenase  40.92 
 
 
389 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5345  alcohol dehydrogenase  41.56 
 
 
399 aa  282  9e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.501465  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  38.8 
 
 
422 aa  280  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1016  alcohol dehydrogenase  41.73 
 
 
390 aa  279  7e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0764  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.73 
 
 
390 aa  279  7e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2247  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  39.95 
 
 
391 aa  277  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.644611  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4725  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.95 
 
 
391 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105849  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1328  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.48 
 
 
390 aa  276  5e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975088  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4753  alcohol dehydrogenase  38.37 
 
 
402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209038  normal  0.806258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>