More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2916 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6027  alcohol dehydrogenase  81.59 
 
 
401 aa  656    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2916  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  100 
 
 
492 aa  991    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843639  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1142  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
417 aa  844    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.517956  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2760  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  99.53 
 
 
425 aa  855    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5432  alcohol dehydrogenase  83.33 
 
 
401 aa  671    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250505  normal  0.150153 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1392  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  81.59 
 
 
401 aa  657    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5660  alcohol dehydrogenase  81.59 
 
 
401 aa  654    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6437  alcohol dehydrogenase  81.59 
 
 
401 aa  657    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.632433  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4753  alcohol dehydrogenase  77.36 
 
 
402 aa  656    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209038  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0592  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  68.08 
 
 
401 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  63.93 
 
 
422 aa  526  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  61.1 
 
 
410 aa  523  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24840  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  62.94 
 
 
444 aa  521  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  60.85 
 
 
410 aa  520  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  64.18 
 
 
415 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36660  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  63.68 
 
 
415 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000975221  normal  0.705006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5391  alcohol dehydrogenase  60.35 
 
 
404 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.515242  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1755  alcohol dehydrogenase  57.61 
 
 
403 aa  457  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.17 
 
 
389 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.55 
 
 
391 aa  307  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.85 
 
 
392 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4212  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.36 
 
 
376 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000750849  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3187  alcohol dehydrogenase  41.56 
 
 
389 aa  300  5e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5561  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.63 
 
 
389 aa  299  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210102  normal  0.0249106 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.71 
 
 
392 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0165  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.22 
 
 
389 aa  296  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0166  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  41.32 
 
 
395 aa  296  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912922  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0575  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.98 
 
 
389 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2370  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.34 
 
 
389 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.49 
 
 
388 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1223  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.1 
 
 
390 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.34 
 
 
405 aa  291  2e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5445  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.98 
 
 
390 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.430041  normal  0.349478 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4057  alcohol dehydrogenase  39.29 
 
 
433 aa  287  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.788461  normal  0.848638 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4691  alcohol dehydrogenase  41.81 
 
 
389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.51 
 
 
393 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2247  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  40.73 
 
 
391 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.644611  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.99 
 
 
384 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.66 
 
 
385 aa  283  5.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  hitchhiker  0.00205277 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4498  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.27 
 
 
389 aa  283  6.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.99 
 
 
384 aa  283  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2860  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.59 
 
 
389 aa  282  9e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.489026  normal  0.707248 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  38.71 
 
 
384 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3663  hypothetical protein  39.66 
 
 
394 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184617  normal  0.501234 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3104  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  39.66 
 
 
394 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.345929  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5822  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.59 
 
 
391 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3833  alcohol dehydrogenase  39.66 
 
 
394 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24597  normal  0.375314 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3683  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.26 
 
 
397 aa  280  4e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2482  putative zinc-containing dehydrogenase  39.85 
 
 
389 aa  279  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4801  alcohol dehydrogenase  40.59 
 
 
389 aa  279  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0751128 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0122  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.24 
 
 
401 aa  278  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.566245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0835  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.78 
 
 
396 aa  277  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.202579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0139  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.76 
 
 
401 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6253  alcohol dehydrogenase  39.02 
 
 
391 aa  273  7e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.731237 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4725  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.54 
 
 
391 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105849  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0110  alcohol dehydrogenase  38.05 
 
 
390 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0065  alcohol dehydrogenase  40.73 
 
 
386 aa  271  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.76 
 
 
390 aa  271  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2307  alcohol dehydrogenase  39.76 
 
 
390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0161452 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1320  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.12 
 
 
384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106118  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3665  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38 
 
 
388 aa  270  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.698913  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.71 
 
 
385 aa  269  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2264  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.51 
 
 
390 aa  269  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4494  alcohol dehydrogenase  40.24 
 
 
390 aa  268  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134818  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4105  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.54 
 
 
390 aa  268  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.85 
 
 
382 aa  267  4e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2149  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.86 
 
 
386 aa  267  4e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.406335  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.35 
 
 
387 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0531  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.07 
 
 
390 aa  264  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1328  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.35 
 
 
390 aa  265  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975088  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3368  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.68 
 
 
384 aa  263  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1507  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.69 
 
 
382 aa  263  4e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1016  alcohol dehydrogenase  36.87 
 
 
390 aa  263  6e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0764  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.87 
 
 
390 aa  263  6e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4441  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.53 
 
 
384 aa  261  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204388  normal  0.287337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5159  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.29 
 
 
390 aa  260  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150662  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3881  alcohol dehydrogenase  36.74 
 
 
391 aa  259  8e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0212673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.65 
 
 
398 aa  259  9e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.609837  decreased coverage  0.000185041 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.02 
 
 
382 aa  258  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3148  alcohol dehydrogenase  37.59 
 
 
382 aa  258  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.539421  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0695  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  36.8 
 
 
412 aa  257  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1778  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.88 
 
 
382 aa  257  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.080092  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2300  alcohol dehydrogenase  37.77 
 
 
388 aa  257  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  hitchhiker  0.00000777829 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2838  alcohol dehydrogenase, glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  37.93 
 
 
377 aa  257  4e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.409585  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3025  putative alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 
380 aa  256  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3155  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  37.68 
 
 
377 aa  257  4e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.633298  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00566  hypothetical protein  36.56 
 
 
412 aa  256  6e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00577  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  36.56 
 
 
412 aa  256  6e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1441  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.83 
 
 
390 aa  256  6e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.42991 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3016  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.56 
 
 
412 aa  256  7e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665749  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5217  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.88 
 
 
384 aa  256  7e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3035  alcohol dehydrogenase  36.56 
 
 
412 aa  256  7e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0774  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase (glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase) (fdh) (faldh)  36.8 
 
 
412 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2881  alcohol dehydrogenase, glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  37.68 
 
 
377 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2657  alcohol dehydrogenase  37.59 
 
 
388 aa  255  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6246  alcohol dehydrogenase  37.53 
 
 
389 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.829786 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3114  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  37.93 
 
 
377 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0660  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  36.56 
 
 
412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5345  alcohol dehydrogenase  36.71 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.501465  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3112  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  38.5 
 
 
388 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.152698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>