More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3120 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  96.1 
 
 
410 aa  814    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
410 aa  843    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0592  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  65.84 
 
 
401 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24840  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  63.77 
 
 
444 aa  538  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4753  alcohol dehydrogenase  59.6 
 
 
402 aa  523  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209038  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2916  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  60.85 
 
 
492 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843639  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1142  alcohol dehydrogenase  60.85 
 
 
417 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.517956  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2760  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  60.85 
 
 
425 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  61.54 
 
 
422 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5660  alcohol dehydrogenase  61 
 
 
401 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5432  alcohol dehydrogenase  60.1 
 
 
401 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250505  normal  0.150153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  61.04 
 
 
415 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1392  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  60 
 
 
401 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6437  alcohol dehydrogenase  60 
 
 
401 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.632433  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6027  alcohol dehydrogenase  59.75 
 
 
401 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36660  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  60.55 
 
 
415 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000975221  normal  0.705006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1755  alcohol dehydrogenase  54.73 
 
 
403 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5391  alcohol dehydrogenase  53.73 
 
 
404 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.515242  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.03 
 
 
389 aa  322  8e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4057  alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 
433 aa  320  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.788461  normal  0.848638 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3187  alcohol dehydrogenase  42.4 
 
 
389 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5561  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.55 
 
 
389 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210102  normal  0.0249106 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.26 
 
 
392 aa  317  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.82 
 
 
391 aa  316  4e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2370  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.16 
 
 
389 aa  316  6e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.18 
 
 
388 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0165  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.83 
 
 
389 aa  310  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1223  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.42 
 
 
390 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417243 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.4 
 
 
393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0065  alcohol dehydrogenase  42.89 
 
 
386 aa  308  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2860  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.91 
 
 
389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.489026  normal  0.707248 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.44 
 
 
392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.2 
 
 
384 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4212  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.45 
 
 
376 aa  301  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000750849  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.95 
 
 
384 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0166  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  40.48 
 
 
395 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912922  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4498  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.85 
 
 
389 aa  298  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3665  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.75 
 
 
388 aa  295  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.698913  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5822  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.32 
 
 
391 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  38.77 
 
 
384 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0575  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.59 
 
 
389 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.71 
 
 
405 aa  291  1e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5445  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.1 
 
 
390 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.430041  normal  0.349478 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3663  hypothetical protein  39.51 
 
 
394 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184617  normal  0.501234 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1320  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.19 
 
 
384 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106118  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.08 
 
 
390 aa  290  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.08 
 
 
398 aa  289  7e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.609837  decreased coverage  0.000185041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0110  alcohol dehydrogenase  39.12 
 
 
390 aa  289  8e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2307  alcohol dehydrogenase  41.08 
 
 
390 aa  288  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0161452 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4494  alcohol dehydrogenase  40.83 
 
 
390 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134818  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0122  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.61 
 
 
401 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.566245 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0139  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.13 
 
 
401 aa  287  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0835  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.86 
 
 
396 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.202579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5159  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.59 
 
 
390 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150662  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4105  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.12 
 
 
390 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3833  alcohol dehydrogenase  39.02 
 
 
394 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24597  normal  0.375314 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3104  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  39.02 
 
 
394 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.345929  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4017  alcohol dehydrogenase  39.6 
 
 
382 aa  286  7e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.530875 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.85 
 
 
382 aa  285  9e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2264  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.1 
 
 
390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0531  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.39 
 
 
390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2247  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  39.85 
 
 
391 aa  283  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.644611  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.35 
 
 
382 aa  282  9e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4801  alcohol dehydrogenase  39.46 
 
 
389 aa  282  9e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0751128 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2149  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.9 
 
 
386 aa  280  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.406335  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2482  putative zinc-containing dehydrogenase  39.22 
 
 
389 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3683  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.56 
 
 
397 aa  280  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3148  alcohol dehydrogenase  39.1 
 
 
382 aa  279  5e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.539421  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4725  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.12 
 
 
391 aa  279  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105849  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4691  alcohol dehydrogenase  39.22 
 
 
389 aa  279  8e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2255  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40 
 
 
393 aa  278  9e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000285596  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40 
 
 
385 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  hitchhiker  0.00205277 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5345  alcohol dehydrogenase  39.17 
 
 
399 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.501465  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3881  alcohol dehydrogenase  39.13 
 
 
391 aa  278  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0212673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1016  alcohol dehydrogenase  40.29 
 
 
390 aa  277  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0764  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.29 
 
 
390 aa  277  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3368  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.66 
 
 
384 aa  276  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0720  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.77 
 
 
389 aa  275  8e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00145968  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5415  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.05 
 
 
393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1328  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.8 
 
 
390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975088  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5217  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.84 
 
 
384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6253  alcohol dehydrogenase  38.39 
 
 
391 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.731237 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3025  putative alcohol dehydrogenase  40.29 
 
 
380 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1507  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.32 
 
 
382 aa  273  6e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1778  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.34 
 
 
382 aa  272  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.080092  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.05 
 
 
387 aa  270  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0160  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.28 
 
 
392 aa  269  8e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4441  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.34 
 
 
384 aa  268  8.999999999999999e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204388  normal  0.287337 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4673  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.42 
 
 
389 aa  268  8.999999999999999e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2300  alcohol dehydrogenase  38.11 
 
 
388 aa  265  8e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  hitchhiker  0.00000777829 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0344  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.52 
 
 
396 aa  264  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3216  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.59 
 
 
393 aa  264  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.47 
 
 
385 aa  262  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0748  alcohol dehydrogenase  36.25 
 
 
388 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0754  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.25 
 
 
388 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0768  alcohol dehydrogenase  36.25 
 
 
388 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.87513  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1281  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.02 
 
 
392 aa  261  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.368078  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0655  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  38.83 
 
 
412 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0669  alcohol dehydrogenase GroES-like domain protein  38.83 
 
 
412 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432264  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4359  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.86 
 
 
389 aa  260  3e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>