More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5660 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6027  alcohol dehydrogenase  92.77 
 
 
401 aa  725    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2916  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  81.59 
 
 
492 aa  669    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843639  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2760  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  81.59 
 
 
425 aa  669    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1142  alcohol dehydrogenase  81.59 
 
 
417 aa  669    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.517956  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5432  alcohol dehydrogenase  94.26 
 
 
401 aa  742    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250505  normal  0.150153 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1392  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  93.02 
 
 
401 aa  727    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5660  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
401 aa  802    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6437  alcohol dehydrogenase  93.02 
 
 
401 aa  727    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.632433  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4753  alcohol dehydrogenase  73.88 
 
 
402 aa  619  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209038  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0592  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  67.75 
 
 
401 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24840  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  66.58 
 
 
444 aa  548  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  65.59 
 
 
422 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  65.59 
 
 
415 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  60.75 
 
 
410 aa  519  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  61 
 
 
410 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36660  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  64.84 
 
 
415 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000975221  normal  0.705006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5391  alcohol dehydrogenase  59.25 
 
 
404 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.515242  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1755  alcohol dehydrogenase  56.86 
 
 
403 aa  456  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.12 
 
 
391 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3187  alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 
389 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5561  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.46 
 
 
389 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210102  normal  0.0249106 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.2 
 
 
392 aa  297  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4057  alcohol dehydrogenase  40.83 
 
 
433 aa  294  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.788461  normal  0.848638 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.81 
 
 
389 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4212  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.05 
 
 
376 aa  294  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000750849  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.05 
 
 
388 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0166  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  40.69 
 
 
395 aa  293  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912922  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 
384 aa  292  8e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1223  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.71 
 
 
390 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417243 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.61 
 
 
393 aa  289  7e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.32 
 
 
392 aa  289  8e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.58 
 
 
405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0165  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.59 
 
 
389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2860  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.44 
 
 
389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.489026  normal  0.707248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.22 
 
 
385 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  hitchhiker  0.00205277 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.35 
 
 
384 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.35 
 
 
384 aa  282  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0575  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.85 
 
 
389 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2370  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.97 
 
 
389 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4691  alcohol dehydrogenase  40.93 
 
 
389 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2482  putative zinc-containing dehydrogenase  39.71 
 
 
389 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0835  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.61 
 
 
396 aa  280  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.202579 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2247  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  40.34 
 
 
391 aa  280  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.644611  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5822  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.59 
 
 
391 aa  279  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.2 
 
 
382 aa  277  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5445  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.59 
 
 
390 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.430041  normal  0.349478 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4801  alcohol dehydrogenase  40.44 
 
 
389 aa  275  7e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0751128 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3663  hypothetical protein  38.93 
 
 
394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184617  normal  0.501234 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4441  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.36 
 
 
384 aa  273  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204388  normal  0.287337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.1 
 
 
390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0122  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.88 
 
 
401 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.566245 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0139  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.88 
 
 
401 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3104  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  38.69 
 
 
394 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.345929  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4725  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.14 
 
 
391 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105849  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2307  alcohol dehydrogenase  40.1 
 
 
390 aa  273  6e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0161452 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3833  alcohol dehydrogenase  38.69 
 
 
394 aa  272  7e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24597  normal  0.375314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4498  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.14 
 
 
389 aa  272  8.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1320  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.59 
 
 
384 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106118  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4017  alcohol dehydrogenase  39.45 
 
 
382 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.530875 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1507  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.16 
 
 
382 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4105  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.39 
 
 
390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6253  alcohol dehydrogenase  38.39 
 
 
391 aa  270  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.731237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3683  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.44 
 
 
397 aa  270  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2264  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.88 
 
 
390 aa  269  5e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0110  alcohol dehydrogenase  37.65 
 
 
390 aa  269  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4494  alcohol dehydrogenase  40.1 
 
 
390 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134818  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2149  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.23 
 
 
386 aa  268  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.406335  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.32 
 
 
385 aa  268  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3368  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.71 
 
 
384 aa  268  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5217  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.47 
 
 
384 aa  266  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5159  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.12 
 
 
390 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150662  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3665  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.96 
 
 
388 aa  264  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.698913  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.62 
 
 
382 aa  263  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0531  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.92 
 
 
390 aa  263  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1778  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.97 
 
 
382 aa  263  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.080092  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3148  alcohol dehydrogenase  37.76 
 
 
382 aa  262  8.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.539421  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2429  alcohol dehydrogenase  37.38 
 
 
400 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0410446  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.96 
 
 
387 aa  261  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4359  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.49 
 
 
389 aa  261  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.2 
 
 
398 aa  259  5.0000000000000005e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.609837  decreased coverage  0.000185041 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3025  putative alcohol dehydrogenase  38.16 
 
 
380 aa  259  6e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3669  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.87 
 
 
386 aa  259  6e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.949441  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3112  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  38.59 
 
 
388 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.152698  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0065  alcohol dehydrogenase  38.88 
 
 
386 aa  258  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0764  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.83 
 
 
390 aa  256  4e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1016  alcohol dehydrogenase  36.83 
 
 
390 aa  256  4e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0655  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  37.14 
 
 
412 aa  255  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0669  alcohol dehydrogenase GroES-like domain protein  37.14 
 
 
412 aa  255  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432264  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0728  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase (glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase) (fdh) (faldh)  37.14 
 
 
412 aa  255  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1328  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.83 
 
 
390 aa  255  9e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975088  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0695  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  37.14 
 
 
412 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0774  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase (glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase) (fdh) (faldh)  37.14 
 
 
412 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00577  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  36.89 
 
 
412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3016  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.14 
 
 
412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665749  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3970  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.62 
 
 
400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00566  hypothetical protein  36.89 
 
 
412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3035  alcohol dehydrogenase  37.14 
 
 
412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0660  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  37.14 
 
 
412 aa  253  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1837  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.11 
 
 
389 aa  253  3e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.607752  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3527  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.65 
 
 
411 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129082  normal  0.366185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>