More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3514 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0265  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  96.98 
 
 
371 aa  712    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.901967  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3514  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
373 aa  749    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0669  alcohol dehydrogenase  83.29 
 
 
374 aa  624  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.704397  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2536  zinc-binding alcohol dehydrogenase  78.03 
 
 
357 aa  571  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.563542  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2064  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  76.9 
 
 
357 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3346  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  76.12 
 
 
357 aa  558  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0203  zinc-binding alcohol dehydrogenase  74.44 
 
 
357 aa  558  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0325811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3032  alcohol dehydrogenase  74.44 
 
 
357 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5645  alcohol dehydrogenase  72.47 
 
 
357 aa  532  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.419975 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07420  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  72.88 
 
 
357 aa  528  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2137  alcohol dehydrogenase  70.22 
 
 
351 aa  514  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0423941 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1356  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  69.42 
 
 
366 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3852  alcohol dehydrogenase  68.87 
 
 
365 aa  508  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0967  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  67.22 
 
 
366 aa  498  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.635093  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1049  alcohol dehydrogenase  67.22 
 
 
366 aa  498  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.050805 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2008  alcohol dehydrogenase protein  66.67 
 
 
364 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3188  alcohol dehydrogenase  66.48 
 
 
366 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3465  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  66.94 
 
 
366 aa  490  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.901244  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.72 
 
 
354 aa  351  1e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3460  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.19 
 
 
354 aa  332  6e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00073426  hitchhiker  0.00463895 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2240  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.76 
 
 
355 aa  313  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0360217 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0548  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.01 
 
 
350 aa  290  3e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0899798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4352  alcohol dehydrogenase  42.37 
 
 
354 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.16 
 
 
349 aa  277  2e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.228893  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0435  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.3 
 
 
351 aa  276  4e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.692768  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3962  alcohol dehydrogenase  39.39 
 
 
351 aa  232  8.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5564  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.04 
 
 
346 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175264  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2090  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.83 
 
 
351 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000167964 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3075  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.9 
 
 
347 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  39.89 
 
 
352 aa  230  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1091  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.57 
 
 
342 aa  229  7e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1234  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  40 
 
 
346 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0709  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40 
 
 
346 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470076  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2432  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40 
 
 
346 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1718  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40 
 
 
346 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0753  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40 
 
 
346 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574599  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1160  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  40 
 
 
346 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.1 
 
 
346 aa  228  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.539752  normal  0.655263 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.25 
 
 
346 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0322  alcohol dehydrogenase  38.76 
 
 
347 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.65143  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1565  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.29 
 
 
349 aa  227  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.965017  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1221  alcohol dehydrogenase  38.38 
 
 
343 aa  227  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  39.65 
 
 
346 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0194  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  39.94 
 
 
345 aa  226  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2034  hypothetical protein  37.82 
 
 
346 aa  226  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4548  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.25 
 
 
355 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00643704 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1073  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.83 
 
 
351 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1089  alcohol dehydrogenase  38.83 
 
 
351 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25524  normal  0.164937 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4415  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.94 
 
 
345 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1399  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.14 
 
 
352 aa  224  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  39.07 
 
 
346 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5892  alcohol dehydrogenase  39.07 
 
 
346 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032769  normal  0.939128 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5816  alcohol dehydrogenase  38.37 
 
 
346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.136095 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4901  alcohol dehydrogenase  38.36 
 
 
360 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1860  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.92 
 
 
346 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2366  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.44 
 
 
347 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.0010665  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1928  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.54 
 
 
370 aa  218  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1334  alcohol dehydrogenase  38.19 
 
 
344 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0653  alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 
352 aa  216  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0924  putative zinc-dependent alcohol dehydrogenase (oxidoreductase)  38.76 
 
 
345 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.175832  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3657  alcohol dehydrogenase  37.68 
 
 
347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal  0.2926 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.85 
 
 
351 aa  209  5e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000634163  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2770  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.59 
 
 
356 aa  209  5e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1415  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.67 
 
 
352 aa  209  7e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.275014  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.79 
 
 
345 aa  208  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0642635 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  35.7 
 
 
384 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1380  alcohol dehydrogenase  37.43 
 
 
348 aa  206  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378076  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4997  alcohol dehydrogenase  36.69 
 
 
348 aa  206  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.34 
 
 
384 aa  205  9e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1378  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.41 
 
 
352 aa  205  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.6 
 
 
384 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.48 
 
 
410 aa  205  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0219  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.45 
 
 
350 aa  205  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1713  alcohol dehydrogenase  38.38 
 
 
343 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.53 
 
 
385 aa  203  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  hitchhiker  0.00205277 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2344  alcohol dehydrogenase (NADP+)  35.88 
 
 
352 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100089  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.58 
 
 
410 aa  200  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  35.75 
 
 
422 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.1 
 
 
389 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3239  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  37.25 
 
 
356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0592  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.41 
 
 
401 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0764  hypothetical protein  35.63 
 
 
357 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0197136 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0010  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.84 
 
 
346 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.133832  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1100  alcohol dehydrogenase  39.74 
 
 
299 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0318515  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4753  alcohol dehydrogenase  33.98 
 
 
402 aa  195  9e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209038  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  36.43 
 
 
415 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36660  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  35.92 
 
 
415 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000975221  normal  0.705006 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.57 
 
 
382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4212  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.89 
 
 
376 aa  190  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000750849  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1112  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.34 
 
 
351 aa  189  5e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.257407  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24840  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  33.17 
 
 
444 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1320  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.6 
 
 
384 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106118  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6246  alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
389 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.829786 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1228  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.71 
 
 
352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.966969 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3669  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.82 
 
 
386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.949441  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1778  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.59 
 
 
382 aa  184  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.080092  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.56 
 
 
385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1246  zinc-type alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 
385 aa  182  6e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.939827  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.19 
 
 
382 aa  182  6e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4441  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.64 
 
 
384 aa  182  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204388  normal  0.287337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>