More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2366 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2366  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
347 aa  707    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.0010665  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  61.56 
 
 
346 aa  450  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0322  alcohol dehydrogenase  58.26 
 
 
347 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.65143  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3657  alcohol dehydrogenase  58.09 
 
 
347 aa  436  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal  0.2926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4415  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.51 
 
 
345 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4548  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.51 
 
 
355 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00643704 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1334  alcohol dehydrogenase  57.1 
 
 
344 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  56.23 
 
 
346 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0194  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  57.23 
 
 
345 aa  422  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1860  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  57.1 
 
 
346 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5892  alcohol dehydrogenase  55.07 
 
 
346 aa  423  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032769  normal  0.939128 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1928  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.94 
 
 
370 aa  422  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.65 
 
 
345 aa  422  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0642635 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  55.36 
 
 
346 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1221  alcohol dehydrogenase  57.51 
 
 
343 aa  418  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.2 
 
 
346 aa  416  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.539752  normal  0.655263 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5564  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.94 
 
 
346 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175264  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0924  putative zinc-dependent alcohol dehydrogenase (oxidoreductase)  57.68 
 
 
345 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.175832  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0709  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  56.52 
 
 
346 aa  411  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470076  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2034  hypothetical protein  56.07 
 
 
346 aa  414  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2432  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  56.52 
 
 
346 aa  411  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1091  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  55.49 
 
 
342 aa  413  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1234  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  56.52 
 
 
346 aa  411  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1160  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  56.52 
 
 
346 aa  411  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0753  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  56.52 
 
 
346 aa  411  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574599  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1718  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  56.52 
 
 
346 aa  411  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1565  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  55.36 
 
 
349 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.965017  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5816  alcohol dehydrogenase  53.91 
 
 
346 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.136095 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1713  alcohol dehydrogenase  57.8 
 
 
343 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3075  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  50.58 
 
 
347 aa  391  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3962  alcohol dehydrogenase  50.86 
 
 
351 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2090  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.29 
 
 
351 aa  382  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000167964 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2112  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  56.52 
 
 
350 aa  379  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0323338  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  51.45 
 
 
351 aa  379  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000634163  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1073  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  49.86 
 
 
351 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1089  alcohol dehydrogenase  49.86 
 
 
351 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25524  normal  0.164937 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4997  alcohol dehydrogenase  50 
 
 
348 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1380  alcohol dehydrogenase  48.84 
 
 
348 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378076  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4901  alcohol dehydrogenase  47.26 
 
 
360 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1112  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.43 
 
 
351 aa  346  4e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.257407  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1100  alcohol dehydrogenase  52.51 
 
 
299 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0318515  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3239  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  44.09 
 
 
356 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0219  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.26 
 
 
350 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4893  alcohol dehydrogenase  41.46 
 
 
330 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709624  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  41.09 
 
 
352 aa  273  4.0000000000000004e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2137  alcohol dehydrogenase  38.59 
 
 
351 aa  258  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0423941 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0010  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.39 
 
 
346 aa  231  2e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.133832  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0203  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.33 
 
 
357 aa  231  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0325811 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.42 
 
 
410 aa  226  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.68 
 
 
385 aa  223  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0669  alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
374 aa  223  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.704397  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3346  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.98 
 
 
357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0265  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.04 
 
 
371 aa  219  7e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.901967  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.59 
 
 
410 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07420  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  35.82 
 
 
357 aa  216  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.8 
 
 
354 aa  215  9e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3460  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.88 
 
 
354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00073426  hitchhiker  0.00463895 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2064  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  35.36 
 
 
357 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2240  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.1 
 
 
355 aa  213  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0360217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3514  alcohol dehydrogenase  34.72 
 
 
373 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3032  alcohol dehydrogenase  33.9 
 
 
357 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.11 
 
 
384 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2536  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.07 
 
 
357 aa  211  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.563542  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5645  alcohol dehydrogenase  34.44 
 
 
357 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.419975 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4212  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.01 
 
 
376 aa  208  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000750849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.85 
 
 
384 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.23 
 
 
387 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2838  alcohol dehydrogenase, glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  34.47 
 
 
377 aa  206  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.409585  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2149  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.04 
 
 
386 aa  207  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.406335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3114  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.47 
 
 
377 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1356  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 
366 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2912  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.21 
 
 
377 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.549195  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3131  alcohol dehydrogenase  34.21 
 
 
377 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2124  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.21 
 
 
377 aa  205  7e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.770168  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36660  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  32.45 
 
 
415 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000975221  normal  0.705006 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3145  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.21 
 
 
377 aa  202  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5660  alcohol dehydrogenase  32.56 
 
 
401 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.16 
 
 
405 aa  202  6e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3188  alcohol dehydrogenase  31.96 
 
 
366 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1392  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.56 
 
 
401 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6437  alcohol dehydrogenase  32.56 
 
 
401 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.632433  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2881  alcohol dehydrogenase, glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  34.21 
 
 
377 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1320  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.9 
 
 
384 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106118  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6027  alcohol dehydrogenase  32.56 
 
 
401 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4753  alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 
402 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209038  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2760  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.97 
 
 
425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3133  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.95 
 
 
377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2916  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  31.97 
 
 
492 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843639  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0820  hypothetical protein  34.83 
 
 
353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1142  alcohol dehydrogenase  31.97 
 
 
417 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.517956  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2300  alcohol dehydrogenase  32.22 
 
 
388 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  hitchhiker  0.00000777829 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3155  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.21 
 
 
377 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.633298  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  31 
 
 
422 aa  198  9e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.64 
 
 
385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  hitchhiker  0.00205277 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5432  alcohol dehydrogenase  31.03 
 
 
401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250505  normal  0.150153 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3465  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.15 
 
 
366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.901244  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2008  alcohol dehydrogenase protein  33.9 
 
 
364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1308  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.87 
 
 
353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277534  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3112  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  32.23 
 
 
388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.152698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>