More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3460 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3460  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
354 aa  723    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00073426  hitchhiker  0.00463895 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  84.75 
 
 
354 aa  633  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2240  zinc-binding alcohol dehydrogenase  69.77 
 
 
355 aa  515  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0360217 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4352  alcohol dehydrogenase  54.24 
 
 
354 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0435  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.29 
 
 
351 aa  373  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.692768  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2137  alcohol dehydrogenase  51.42 
 
 
351 aa  358  6e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0423941 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0548  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.43 
 
 
350 aa  349  4e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0899798  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54 
 
 
349 aa  344  1e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.228893  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0669  alcohol dehydrogenase  47.34 
 
 
374 aa  333  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.704397  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2536  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.46 
 
 
357 aa  331  1e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.563542  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3346  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.62 
 
 
357 aa  330  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07420  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  46.31 
 
 
357 aa  329  5.0000000000000004e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3514  alcohol dehydrogenase  47.56 
 
 
373 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0203  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.5 
 
 
357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0325811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3188  alcohol dehydrogenase  44.54 
 
 
366 aa  324  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0265  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.84 
 
 
371 aa  322  4e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.901967  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2064  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  46.78 
 
 
357 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2008  alcohol dehydrogenase protein  43.45 
 
 
364 aa  318  7.999999999999999e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5645  alcohol dehydrogenase  44.38 
 
 
357 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.419975 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1356  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  43.99 
 
 
366 aa  317  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3852  alcohol dehydrogenase  44.08 
 
 
365 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3032  alcohol dehydrogenase  45.51 
 
 
357 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3465  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.54 
 
 
366 aa  311  9e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.901244  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1049  alcohol dehydrogenase  43.72 
 
 
366 aa  308  5.9999999999999995e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.050805 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0967  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.72 
 
 
366 aa  308  5.9999999999999995e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.635093  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1415  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.63 
 
 
352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.275014  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0653  alcohol dehydrogenase  43.47 
 
 
352 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2770  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.21 
 
 
356 aa  268  1e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1378  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.17 
 
 
352 aa  259  4e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2344  alcohol dehydrogenase (NADP+)  42.33 
 
 
352 aa  259  4e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100089  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0764  hypothetical protein  40.45 
 
 
357 aa  255  7e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0197136 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1399  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.73 
 
 
352 aa  239  4e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1228  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.46 
 
 
352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.966969 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  40.36 
 
 
346 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1091  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.24 
 
 
342 aa  230  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  39.49 
 
 
346 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5564  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.26 
 
 
346 aa  229  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175264  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1221  alcohol dehydrogenase  37.11 
 
 
343 aa  226  6e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5892  alcohol dehydrogenase  39.17 
 
 
346 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032769  normal  0.939128 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.87 
 
 
346 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3075  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.06 
 
 
347 aa  224  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0709  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.76 
 
 
346 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0753  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.76 
 
 
346 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574599  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2432  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.76 
 
 
346 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1160  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.76 
 
 
346 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1718  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.76 
 
 
346 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1234  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.76 
 
 
346 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1860  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.1 
 
 
346 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1565  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.58 
 
 
349 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.965017  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0322  alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
347 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.65143  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2366  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.88 
 
 
347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.0010665  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3657  alcohol dehydrogenase  36.8 
 
 
347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal  0.2926 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5816  alcohol dehydrogenase  37.09 
 
 
346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.136095 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2034  hypothetical protein  35.5 
 
 
346 aa  213  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1073  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.96 
 
 
351 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1089  alcohol dehydrogenase  37.96 
 
 
351 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25524  normal  0.164937 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4548  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.69 
 
 
355 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00643704 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4415  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.69 
 
 
345 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2090  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.92 
 
 
351 aa  209  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000167964 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3962  alcohol dehydrogenase  37.24 
 
 
351 aa  209  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0194  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  37.09 
 
 
345 aa  207  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1928  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.84 
 
 
370 aa  205  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1334  alcohol dehydrogenase  35.61 
 
 
344 aa  203  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.49 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0642635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4901  alcohol dehydrogenase  34.75 
 
 
360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  35.86 
 
 
384 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.1 
 
 
351 aa  199  6e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000634163  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1713  alcohol dehydrogenase  35.98 
 
 
343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0924  putative zinc-dependent alcohol dehydrogenase (oxidoreductase)  36.28 
 
 
345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.175832  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.31 
 
 
346 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.539752  normal  0.655263 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1380  alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 
348 aa  196  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378076  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0219  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.26 
 
 
350 aa  192  7e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3239  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  36.39 
 
 
356 aa  192  9e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1100  alcohol dehydrogenase  40.07 
 
 
299 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0318515  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  34.45 
 
 
352 aa  190  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4997  alcohol dehydrogenase  35.8 
 
 
348 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1112  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.66 
 
 
351 aa  187  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.257407  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
382 aa  179  9e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4753  alcohol dehydrogenase  40.08 
 
 
402 aa  176  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209038  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0592  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.45 
 
 
401 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.83 
 
 
410 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.39 
 
 
405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.72 
 
 
382 aa  172  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2112  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.91 
 
 
350 aa  171  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0323338  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 
415 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1778  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.2 
 
 
382 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.080092  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0010  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.23 
 
 
346 aa  171  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.133832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.67 
 
 
410 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36660  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  32.21 
 
 
415 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000975221  normal  0.705006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.79 
 
 
385 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1392  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.45 
 
 
401 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6437  alcohol dehydrogenase  39.45 
 
 
401 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.632433  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6027  alcohol dehydrogenase  39.45 
 
 
401 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4017  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.530875 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5660  alcohol dehydrogenase  39.06 
 
 
401 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  30.63 
 
 
422 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2916  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  38.37 
 
 
492 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843639  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2760  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  38.76 
 
 
425 aa  165  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.55 
 
 
384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2370  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.12 
 
 
389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>