More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1415 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1415  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
352 aa  716    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.275014  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2770  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  65.45 
 
 
356 aa  479  1e-134  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0653  alcohol dehydrogenase  58 
 
 
352 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2344  alcohol dehydrogenase (NADP+)  53.69 
 
 
352 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100089  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1228  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.69 
 
 
352 aa  396  1e-109  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.966969 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0764  hypothetical protein  55.01 
 
 
357 aa  380  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0197136 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1378  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.12 
 
 
352 aa  376  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1399  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.42 
 
 
352 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0435  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.58 
 
 
351 aa  323  3e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.692768  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0548  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.73 
 
 
350 aa  307  2.0000000000000002e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0899798  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2240  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.58 
 
 
355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0360217 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4352  alcohol dehydrogenase  44.13 
 
 
354 aa  286  4e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3460  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.63 
 
 
354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00073426  hitchhiker  0.00463895 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.63 
 
 
354 aa  278  8e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.27 
 
 
349 aa  277  2e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.228893  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07420  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  37.36 
 
 
357 aa  218  8.999999999999998e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2137  alcohol dehydrogenase  35.73 
 
 
351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0423941 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3188  alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 
366 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2008  alcohol dehydrogenase protein  36.21 
 
 
364 aa  208  1e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3346  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.11 
 
 
357 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0265  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.44 
 
 
371 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.901967  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3514  alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 
373 aa  207  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0203  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.83 
 
 
357 aa  206  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0325811 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2536  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.55 
 
 
357 aa  206  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.563542  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0967  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.26 
 
 
366 aa  206  7e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.635093  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1049  alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 
366 aa  206  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.050805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3032  alcohol dehydrogenase  35.11 
 
 
357 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5645  alcohol dehydrogenase  37.24 
 
 
357 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.419975 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1356  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 
366 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3852  alcohol dehydrogenase  34.71 
 
 
365 aa  202  9e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3465  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
366 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.901244  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0669  alcohol dehydrogenase  34.83 
 
 
374 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.704397  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2064  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  35.39 
 
 
357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  34.08 
 
 
346 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  32.92 
 
 
346 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5892  alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
346 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032769  normal  0.939128 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0322  alcohol dehydrogenase  32.52 
 
 
347 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.65143  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.22 
 
 
346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5564  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.93 
 
 
346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175264  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2034  hypothetical protein  31.46 
 
 
346 aa  146  6e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.23 
 
 
345 aa  146  6e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0642635 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2090  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.95 
 
 
351 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000167964 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1091  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.86 
 
 
342 aa  144  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1221  alcohol dehydrogenase  31.3 
 
 
343 aa  143  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3075  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.52 
 
 
347 aa  143  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3962  alcohol dehydrogenase  32.09 
 
 
351 aa  143  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0924  putative zinc-dependent alcohol dehydrogenase (oxidoreductase)  32.15 
 
 
345 aa  143  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.175832  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2366  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.79 
 
 
347 aa  142  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.0010665  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3657  alcohol dehydrogenase  31.82 
 
 
347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal  0.2926 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1334  alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1928  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.6 
 
 
370 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5816  alcohol dehydrogenase  31.29 
 
 
346 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.136095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1328  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.14 
 
 
390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975088  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3881  alcohol dehydrogenase  32.37 
 
 
391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0212673 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1860  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.45 
 
 
346 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0194  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  31.16 
 
 
345 aa  133  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1016  alcohol dehydrogenase  32.08 
 
 
390 aa  133  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0764  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.08 
 
 
390 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1565  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.34 
 
 
349 aa  132  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.965017  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1718  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.6 
 
 
346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0709  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.6 
 
 
346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470076  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2432  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.6 
 
 
346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1160  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.6 
 
 
346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0753  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.6 
 
 
346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574599  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1234  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.6 
 
 
346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.61 
 
 
346 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.539752  normal  0.655263 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1073  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32 
 
 
351 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1089  alcohol dehydrogenase  32 
 
 
351 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25524  normal  0.164937 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4901  alcohol dehydrogenase  31.51 
 
 
360 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4415  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.61 
 
 
345 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4548  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.61 
 
 
355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00643704 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.65 
 
 
351 aa  125  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000634163  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1100  alcohol dehydrogenase  32.96 
 
 
299 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0318515  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.78 
 
 
410 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  32.79 
 
 
352 aa  124  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4753  alcohol dehydrogenase  34.05 
 
 
402 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209038  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1713  alcohol dehydrogenase  31.01 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0219  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.66 
 
 
350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1380  alcohol dehydrogenase  29.33 
 
 
348 aa  119  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378076  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5660  alcohol dehydrogenase  34.91 
 
 
401 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2916  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  32.51 
 
 
492 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843639  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.48 
 
 
410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2760  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.51 
 
 
425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1142  alcohol dehydrogenase  32.51 
 
 
417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.517956  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.76 
 
 
393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3187  alcohol dehydrogenase  34.24 
 
 
389 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3833  alcohol dehydrogenase  30.31 
 
 
394 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24597  normal  0.375314 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6027  alcohol dehydrogenase  34.35 
 
 
401 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36660  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  34.91 
 
 
415 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000975221  normal  0.705006 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3104  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  31.42 
 
 
394 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.345929  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1392  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.35 
 
 
401 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6437  alcohol dehydrogenase  34.35 
 
 
401 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.632433  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1112  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.84 
 
 
351 aa  116  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.257407  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3663  hypothetical protein  33.46 
 
 
394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184617  normal  0.501234 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3665  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.07 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.698913  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3025  putative alcohol dehydrogenase  38.84 
 
 
380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.86 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4997  alcohol dehydrogenase  30 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.64 
 
 
382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09114  hypothetical protein  37.55 
 
 
400 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>