More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1399 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1399  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
352 aa  712    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0653  alcohol dehydrogenase  57.22 
 
 
352 aa  391  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2344  alcohol dehydrogenase (NADP+)  53.95 
 
 
352 aa  379  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100089  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0764  hypothetical protein  51.13 
 
 
357 aa  350  2e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0197136 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2770  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.56 
 
 
356 aa  347  1e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1415  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.42 
 
 
352 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.275014  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1378  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.14 
 
 
352 aa  332  4e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1228  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.02 
 
 
352 aa  317  2e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.966969 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0548  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.91 
 
 
350 aa  266  5.999999999999999e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0899798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4352  alcohol dehydrogenase  41.71 
 
 
354 aa  257  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.93 
 
 
354 aa  257  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0435  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.78 
 
 
351 aa  257  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.692768  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2240  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.6 
 
 
355 aa  252  8.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0360217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3460  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.73 
 
 
354 aa  249  5e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00073426  hitchhiker  0.00463895 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.52 
 
 
349 aa  248  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.228893  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3188  alcohol dehydrogenase  38.87 
 
 
366 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0265  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.08 
 
 
371 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.901967  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3514  alcohol dehydrogenase  41.14 
 
 
373 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3465  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.61 
 
 
366 aa  230  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.901244  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5645  alcohol dehydrogenase  39.07 
 
 
357 aa  229  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.419975 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0967  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.29 
 
 
366 aa  228  9e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.635093  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1049  alcohol dehydrogenase  38.29 
 
 
366 aa  228  9e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.050805 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1356  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  39.15 
 
 
366 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3346  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.18 
 
 
357 aa  226  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0669  alcohol dehydrogenase  40.52 
 
 
374 aa  225  8e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.704397  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2008  alcohol dehydrogenase protein  38.59 
 
 
364 aa  225  1e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2137  alcohol dehydrogenase  40.3 
 
 
351 aa  224  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0423941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3852  alcohol dehydrogenase  37.75 
 
 
365 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3032  alcohol dehydrogenase  39 
 
 
357 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07420  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  39.37 
 
 
357 aa  222  9e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2536  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.52 
 
 
357 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.563542  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0203  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.54 
 
 
357 aa  218  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0325811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2064  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  38.78 
 
 
357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3962  alcohol dehydrogenase  35.36 
 
 
351 aa  173  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.62 
 
 
346 aa  165  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0322  alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 
347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.65143  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2090  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.05 
 
 
351 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000167964 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0592  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.51 
 
 
401 aa  156  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  32.52 
 
 
346 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5660  alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 
401 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2034  hypothetical protein  31.45 
 
 
346 aa  153  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  32.22 
 
 
346 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24840  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  35.83 
 
 
444 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5892  alcohol dehydrogenase  32.52 
 
 
346 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032769  normal  0.939128 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1392  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.56 
 
 
401 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6027  alcohol dehydrogenase  38.56 
 
 
401 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.64 
 
 
346 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.539752  normal  0.655263 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6437  alcohol dehydrogenase  38.56 
 
 
401 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.632433  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2366  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.57 
 
 
347 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.0010665  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2916  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  38.1 
 
 
492 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843639  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5564  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.34 
 
 
346 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175264  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2760  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  38.1 
 
 
425 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1142  alcohol dehydrogenase  38.1 
 
 
417 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.517956  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5432  alcohol dehydrogenase  38.98 
 
 
401 aa  149  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250505  normal  0.150153 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  30.43 
 
 
422 aa  149  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5816  alcohol dehydrogenase  32.05 
 
 
346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.136095 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  32.34 
 
 
415 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3657  alcohol dehydrogenase  33.03 
 
 
347 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal  0.2926 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1221  alcohol dehydrogenase  32.22 
 
 
343 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4753  alcohol dehydrogenase  35.42 
 
 
402 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209038  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36660  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  36.91 
 
 
415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000975221  normal  0.705006 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1328  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30 
 
 
390 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975088  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0764  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.72 
 
 
390 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  32.22 
 
 
352 aa  145  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0924  putative zinc-dependent alcohol dehydrogenase (oxidoreductase)  34.93 
 
 
345 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.175832  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1016  alcohol dehydrogenase  29.72 
 
 
390 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.29 
 
 
382 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1334  alcohol dehydrogenase  32.05 
 
 
344 aa  145  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.63 
 
 
410 aa  143  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0194  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  31.45 
 
 
345 aa  142  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1091  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.32 
 
 
342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4901  alcohol dehydrogenase  31.9 
 
 
360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3881  alcohol dehydrogenase  29.64 
 
 
391 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0212673 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.72 
 
 
410 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  31.07 
 
 
384 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.8 
 
 
345 aa  139  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0642635 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0219  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.17 
 
 
350 aa  138  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4415  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.77 
 
 
345 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2512  alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 
346 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.881464  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4548  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.77 
 
 
355 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00643704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0160  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.4 
 
 
392 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3187  alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 
389 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2370  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.09 
 
 
389 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1223  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.67 
 
 
390 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417243 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3075  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.33 
 
 
347 aa  135  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5561  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.19 
 
 
389 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210102  normal  0.0249106 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.57 
 
 
351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000634163  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0709  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.31 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470076  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2432  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.31 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0010  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.69 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.133832  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1928  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.67 
 
 
370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1160  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.31 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1718  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.31 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0753  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.31 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574599  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1234  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.31 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.95 
 
 
382 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4017  alcohol dehydrogenase  28.03 
 
 
382 aa  132  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.530875 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3025  putative alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 
380 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1073  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.29 
 
 
351 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1100  alcohol dehydrogenase  34.44 
 
 
299 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0318515  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>