More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0435 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0435  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  100 
 
 
351 aa  714    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.692768  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0548  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  71.71 
 
 
350 aa  498  1e-140  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0899798  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  69.91 
 
 
349 aa  474  1e-132  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.228893  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2240  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.86 
 
 
355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0360217 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4352  alcohol dehydrogenase  56 
 
 
354 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.86 
 
 
354 aa  395  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3460  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.29 
 
 
354 aa  390  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00073426  hitchhiker  0.00463895 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2770  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.21 
 
 
356 aa  381  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0653  alcohol dehydrogenase  52.72 
 
 
352 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2344  alcohol dehydrogenase (NADP+)  53.01 
 
 
352 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100089  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1378  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.29 
 
 
352 aa  342  5.999999999999999e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0764  hypothetical protein  49.43 
 
 
357 aa  342  7e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0197136 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1415  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.58 
 
 
352 aa  338  7e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.275014  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1228  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49 
 
 
352 aa  330  2e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.966969 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2008  alcohol dehydrogenase protein  42.62 
 
 
364 aa  296  3e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07420  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  44.89 
 
 
357 aa  295  7e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2064  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  45.45 
 
 
357 aa  295  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0669  alcohol dehydrogenase  44.51 
 
 
374 aa  293  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.704397  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3188  alcohol dehydrogenase  42.38 
 
 
366 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5645  alcohol dehydrogenase  43.94 
 
 
357 aa  290  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.419975 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0967  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.21 
 
 
366 aa  287  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.635093  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1356  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  43.37 
 
 
366 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1049  alcohol dehydrogenase  43.21 
 
 
366 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.050805 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3465  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.09 
 
 
366 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.901244  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2536  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.79 
 
 
357 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.563542  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3852  alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 
365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3514  alcohol dehydrogenase  42.94 
 
 
373 aa  281  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2137  alcohol dehydrogenase  44.51 
 
 
351 aa  280  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0423941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0265  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.94 
 
 
371 aa  280  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.901967  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3346  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.1 
 
 
357 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0203  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.61 
 
 
357 aa  275  7e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0325811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3032  alcohol dehydrogenase  41.69 
 
 
357 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1399  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.78 
 
 
352 aa  260  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.09 
 
 
346 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3075  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.42 
 
 
347 aa  193  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0322  alcohol dehydrogenase  35.52 
 
 
347 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.65143  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5564  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.11 
 
 
346 aa  186  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175264  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1091  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.67 
 
 
342 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  32.74 
 
 
346 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5892  alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 
346 aa  179  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032769  normal  0.939128 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2034  hypothetical protein  32.46 
 
 
346 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  31.96 
 
 
346 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3657  alcohol dehydrogenase  33.61 
 
 
347 aa  177  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal  0.2926 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.14 
 
 
346 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.539752  normal  0.655263 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0709  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.63 
 
 
346 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470076  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1160  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  33.63 
 
 
346 aa  175  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2432  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.63 
 
 
346 aa  175  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1234  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  33.63 
 
 
346 aa  175  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1718  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.63 
 
 
346 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0753  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.63 
 
 
346 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574599  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2090  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.65 
 
 
351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000167964 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.29 
 
 
351 aa  173  5e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000634163  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  33.86 
 
 
384 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1860  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.69 
 
 
346 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0924  putative zinc-dependent alcohol dehydrogenase (oxidoreductase)  33.43 
 
 
345 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.175832  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1334  alcohol dehydrogenase  32.16 
 
 
344 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1565  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.74 
 
 
349 aa  170  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.965017  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3962  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
351 aa  169  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.46 
 
 
345 aa  168  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0642635 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.89 
 
 
385 aa  166  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1928  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.44 
 
 
370 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2366  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.66 
 
 
347 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.0010665  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1221  alcohol dehydrogenase  31.48 
 
 
343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4901  alcohol dehydrogenase  32.72 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0194  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  32.54 
 
 
345 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4415  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.24 
 
 
345 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4548  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.24 
 
 
355 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00643704 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5816  alcohol dehydrogenase  30.5 
 
 
346 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.136095 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0219  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.69 
 
 
350 aa  159  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1073  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.92 
 
 
351 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1089  alcohol dehydrogenase  32.92 
 
 
351 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25524  normal  0.164937 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1380  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
348 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378076  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4017  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
382 aa  159  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.530875 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.56 
 
 
410 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.17 
 
 
405 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4753  alcohol dehydrogenase  31.19 
 
 
402 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209038  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.89 
 
 
382 aa  155  7e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3665  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.64 
 
 
388 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.698913  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3368  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.05 
 
 
384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0592  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.41 
 
 
401 aa  153  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.64 
 
 
385 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  hitchhiker  0.00205277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3669  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.15 
 
 
386 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.949441  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  30.47 
 
 
422 aa  152  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4997  alcohol dehydrogenase  31.99 
 
 
348 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.95 
 
 
410 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  33.62 
 
 
352 aa  151  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1507  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.49 
 
 
382 aa  149  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  32.21 
 
 
415 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1142  alcohol dehydrogenase  30.69 
 
 
417 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.517956  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2760  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.69 
 
 
425 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2916  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  30.69 
 
 
492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843639  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2149  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.04 
 
 
386 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.406335  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
382 aa  146  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0215  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.2 
 
 
346 aa  146  6e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0696766 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1589  alcohol dehydrogenase  31.53 
 
 
351 aa  145  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2370  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.71 
 
 
389 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5822  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.24 
 
 
391 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1713  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
343 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1392  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.78 
 
 
401 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6437  alcohol dehydrogenase  29.78 
 
 
401 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.632433  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>