More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2770 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2770  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
356 aa  722    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1415  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  65.45 
 
 
352 aa  479  1e-134  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.275014  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0653  alcohol dehydrogenase  62.43 
 
 
352 aa  456  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2344  alcohol dehydrogenase (NADP+)  58.71 
 
 
352 aa  437  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100089  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1228  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.58 
 
 
352 aa  410  1e-113  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.966969 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0764  hypothetical protein  57.22 
 
 
357 aa  409  1e-113  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0197136 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1378  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.02 
 
 
352 aa  394  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0435  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.21 
 
 
351 aa  368  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.692768  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0548  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.09 
 
 
350 aa  357  1.9999999999999998e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0899798  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1399  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.56 
 
 
352 aa  334  1e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.86 
 
 
349 aa  319  3.9999999999999996e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.228893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4352  alcohol dehydrogenase  49.29 
 
 
354 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.04 
 
 
354 aa  281  8.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2240  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.91 
 
 
355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0360217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3460  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.21 
 
 
354 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00073426  hitchhiker  0.00463895 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0967  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.13 
 
 
366 aa  236  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.635093  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1049  alcohol dehydrogenase  39.13 
 
 
366 aa  236  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.050805 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2008  alcohol dehydrogenase protein  39.13 
 
 
364 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07420  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  40.06 
 
 
357 aa  232  7.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3465  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.36 
 
 
366 aa  230  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.901244  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3188  alcohol dehydrogenase  37.64 
 
 
366 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1356  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  38.32 
 
 
366 aa  229  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3852  alcohol dehydrogenase  37.64 
 
 
365 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5645  alcohol dehydrogenase  38.38 
 
 
357 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.419975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3346  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.82 
 
 
357 aa  223  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0669  alcohol dehydrogenase  37.25 
 
 
374 aa  219  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.704397  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0203  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.25 
 
 
357 aa  218  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0325811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3032  alcohol dehydrogenase  36.69 
 
 
357 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2536  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.69 
 
 
357 aa  215  9e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.563542  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0265  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.68 
 
 
371 aa  210  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.901967  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2064  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  37.25 
 
 
357 aa  209  6e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2137  alcohol dehydrogenase  36.93 
 
 
351 aa  207  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0423941 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3514  alcohol dehydrogenase  36.68 
 
 
373 aa  206  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.33 
 
 
346 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2034  hypothetical protein  31.86 
 
 
346 aa  152  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0322  alcohol dehydrogenase  32.74 
 
 
347 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.65143  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3962  alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 
351 aa  151  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0924  putative zinc-dependent alcohol dehydrogenase (oxidoreductase)  32.45 
 
 
345 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.175832  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5892  alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 
346 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032769  normal  0.939128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  32.15 
 
 
346 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.05 
 
 
351 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000634163  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2090  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.24 
 
 
351 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000167964 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  31.47 
 
 
346 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3075  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.15 
 
 
347 aa  143  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1221  alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 
343 aa  142  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1334  alcohol dehydrogenase  29.3 
 
 
344 aa  142  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1091  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.59 
 
 
342 aa  142  9e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2366  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.1 
 
 
347 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.0010665  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2760  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  36.9 
 
 
425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1142  alcohol dehydrogenase  36.9 
 
 
417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.517956  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.7 
 
 
410 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2916  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.72 
 
 
492 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843639  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3657  alcohol dehydrogenase  30.97 
 
 
347 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal  0.2926 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.47 
 
 
346 aa  139  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.539752  normal  0.655263 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0194  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  31.45 
 
 
345 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5816  alcohol dehydrogenase  30.62 
 
 
346 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.136095 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  36.9 
 
 
422 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4415  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.45 
 
 
345 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.38 
 
 
345 aa  138  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0642635 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4548  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.45 
 
 
355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00643704 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0592  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.13 
 
 
401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5660  alcohol dehydrogenase  36.9 
 
 
401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1392  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.51 
 
 
401 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6437  alcohol dehydrogenase  36.51 
 
 
401 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.632433  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6027  alcohol dehydrogenase  36.51 
 
 
401 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.51 
 
 
410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4901  alcohol dehydrogenase  31.09 
 
 
360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1860  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.88 
 
 
346 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0215  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.07 
 
 
346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0696766 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1928  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.09 
 
 
370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36660  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  36.11 
 
 
415 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000975221  normal  0.705006 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5564  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.67 
 
 
346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175264  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24840  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  35.32 
 
 
444 aa  129  9.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0219  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.86 
 
 
350 aa  129  9.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  35.32 
 
 
415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4753  alcohol dehydrogenase  33.2 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209038  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5432  alcohol dehydrogenase  35.32 
 
 
401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250505  normal  0.150153 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1589  alcohol dehydrogenase  33.82 
 
 
351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.59 
 
 
345 aa  127  3e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  28.93 
 
 
384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1100  alcohol dehydrogenase  32.72 
 
 
299 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0318515  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1073  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.72 
 
 
351 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1089  alcohol dehydrogenase  32.72 
 
 
351 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25524  normal  0.164937 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.26 
 
 
382 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1565  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.59 
 
 
349 aa  124  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.965017  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3187  alcohol dehydrogenase  37.21 
 
 
389 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0624  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  32.52 
 
 
338 aa  122  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3368  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.67 
 
 
384 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1641  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  34 
 
 
326 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1713  alcohol dehydrogenase  30.88 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0165  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.47 
 
 
347 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1112  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.42 
 
 
351 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.257407  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1854  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.19 
 
 
348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4997  alcohol dehydrogenase  28.86 
 
 
348 aa  119  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2112  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.23 
 
 
350 aa  119  9e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0323338  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3025  putative alcohol dehydrogenase  37.2 
 
 
380 aa  119  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0831  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.82 
 
 
340 aa  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151744  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1718  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.85 
 
 
346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06010  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  35.02 
 
 
351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0753  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.85 
 
 
346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>