More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0165 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0165  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
347 aa  680    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0624  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  69.12 
 
 
338 aa  455  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3625  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  60.06 
 
 
340 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698872  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1970  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.45 
 
 
341 aa  378  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0831  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.62 
 
 
340 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151744  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04280  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  57.27 
 
 
340 aa  366  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2717  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.91 
 
 
341 aa  364  1e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2100  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.48 
 
 
340 aa  362  6e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3360  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.46 
 
 
338 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20300  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  54.6 
 
 
340 aa  360  1e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4121  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.62 
 
 
345 aa  360  1e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.991808 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16630  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  55.27 
 
 
349 aa  358  7e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2673  alcohol dehydrogenase  55.78 
 
 
338 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0215  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.45 
 
 
346 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0696766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3749  alcohol dehydrogenase  58.33 
 
 
345 aa  350  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2284  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.89 
 
 
338 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.399136 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1854  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.29 
 
 
348 aa  345  6e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.91 
 
 
338 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06010  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  53.67 
 
 
351 aa  344  2e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0477  alcohol dehydrogenase  54.52 
 
 
351 aa  342  4e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2438  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.7 
 
 
347 aa  338  9.999999999999999e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.931486  hitchhiker  0.00356491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1032  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  59.65 
 
 
344 aa  338  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0185  alcohol dehydrogenase  51.45 
 
 
340 aa  332  6e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2318  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.62 
 
 
338 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.263931  normal  0.648846 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22800  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  48.27 
 
 
339 aa  328  7e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1473  alcohol dehydrogenase  51.16 
 
 
340 aa  328  7e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.308593  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0184  alcohol dehydrogenase  52.02 
 
 
338 aa  325  7e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2144  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.67 
 
 
349 aa  321  9.999999999999999e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.862427  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0844  threonine dehydrogenase  47.99 
 
 
347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0265  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.91 
 
 
345 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0894063  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1589  alcohol dehydrogenase  44.25 
 
 
351 aa  300  3e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.53 
 
 
345 aa  294  1e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.11 
 
 
353 aa  294  1e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0949  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  44.54 
 
 
345 aa  282  7.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0171372  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1641  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  43.28 
 
 
326 aa  256  3e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0122  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.35 
 
 
401 aa  206  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.566245 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0139  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.1 
 
 
401 aa  202  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.04 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.61 
 
 
392 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  37.64 
 
 
346 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0165  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.91 
 
 
389 aa  198  9e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 
346 aa  198  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.1 
 
 
389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2300  alcohol dehydrogenase  36.46 
 
 
388 aa  196  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  hitchhiker  0.00000777829 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.77 
 
 
405 aa  195  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.6 
 
 
388 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.43 
 
 
346 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.539752  normal  0.655263 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4997  alcohol dehydrogenase  34.94 
 
 
348 aa  192  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1334  alcohol dehydrogenase  35.24 
 
 
344 aa  192  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0575  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.08 
 
 
389 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.59 
 
 
392 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4498  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.32 
 
 
389 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0924  putative zinc-dependent alcohol dehydrogenase (oxidoreductase)  35.13 
 
 
345 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.175832  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  34.19 
 
 
415 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5892  alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 
346 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032769  normal  0.939128 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5445  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.08 
 
 
390 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.430041  normal  0.349478 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3075  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.41 
 
 
347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36660  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  34.45 
 
 
415 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000975221  normal  0.705006 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 
422 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1474  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.46 
 
 
380 aa  189  5.999999999999999e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.228942  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34 
 
 
346 aa  188  9e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2481  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.35 
 
 
387 aa  187  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2296  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.55 
 
 
379 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2429  alcohol dehydrogenase  33.93 
 
 
400 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0410446  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4901  alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 
360 aa  186  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0322  alcohol dehydrogenase  34.76 
 
 
347 aa  185  8e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.65143  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0194  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  34.47 
 
 
345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.4 
 
 
393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5564  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.03 
 
 
346 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175264  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3657  alcohol dehydrogenase  34.08 
 
 
347 aa  183  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal  0.2926 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.77 
 
 
410 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0077  putative glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  34.64 
 
 
378 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621151  hitchhiker  0.00187852 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5561  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.74 
 
 
389 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210102  normal  0.0249106 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5660  alcohol dehydrogenase  32.43 
 
 
401 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04540  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02810)  35.96 
 
 
355 aa  181  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.825375 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3970  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.65 
 
 
400 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0592  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.51 
 
 
401 aa  181  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1565  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.51 
 
 
349 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.965017  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  34.03 
 
 
384 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1860  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.9 
 
 
346 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4105  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.67 
 
 
390 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3462  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.38 
 
 
382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2370  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.99 
 
 
389 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0166  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  32.49 
 
 
395 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912922  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4494  alcohol dehydrogenase  32.91 
 
 
390 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134818  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2124  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.71 
 
 
377 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.770168  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.53 
 
 
410 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3683  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.42 
 
 
397 aa  179  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6027  alcohol dehydrogenase  32.92 
 
 
401 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4753  alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 
402 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209038  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2149  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.56 
 
 
386 aa  178  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.406335  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3187  alcohol dehydrogenase  32.74 
 
 
389 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1392  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.92 
 
 
401 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6437  alcohol dehydrogenase  32.92 
 
 
401 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.632433  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4441  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.77 
 
 
384 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204388  normal  0.287337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2984  alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 
400 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.29856  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6253  alcohol dehydrogenase  33.08 
 
 
391 aa  178  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.731237 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5432  alcohol dehydrogenase  32.19 
 
 
401 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250505  normal  0.150153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3669  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
386 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.949441  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1928  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 
370 aa  177  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>