More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3462 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3462  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
382 aa  790    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2296  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  70.45 
 
 
379 aa  572  1.0000000000000001e-162  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2676  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  69.13 
 
 
379 aa  531  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.976197  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2410  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  67.81 
 
 
379 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0077  putative glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  70.26 
 
 
378 aa  521  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621151  hitchhiker  0.00187852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3009  alcohol dehydrogenase  67.63 
 
 
379 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479087  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1474  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  64.64 
 
 
380 aa  508  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.228942  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06280  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  64.64 
 
 
384 aa  507  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3025  putative alcohol dehydrogenase  60.95 
 
 
380 aa  479  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26960  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  59.04 
 
 
372 aa  457  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.537835  normal  0.314257 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0147  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  54.2 
 
 
390 aa  426  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1573  alcohol dehydrogenase  53.3 
 
 
377 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1837  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.18 
 
 
389 aa  411  1e-114  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.607752  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0561  alcohol dehydrogenase  51.89 
 
 
404 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.324844  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4723  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.5 
 
 
387 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.592653  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0678  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.33 
 
 
388 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09114  hypothetical protein  50.52 
 
 
400 aa  399  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2449  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.72 
 
 
417 aa  360  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250445  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3740  hypothetical protein  41.6 
 
 
408 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal  0.0188939 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3959  Formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  44.64 
 
 
410 aa  278  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0139443  normal  0.927501 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4487  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  40.46 
 
 
396 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.321496  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4039  putative glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  39.95 
 
 
398 aa  276  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6435  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  40.21 
 
 
396 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00150982 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1013  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  43.98 
 
 
403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.424822 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1186  alcohol dehydrogenase  42.67 
 
 
394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4824  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.9 
 
 
398 aa  272  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4806  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  40.05 
 
 
409 aa  272  8.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.510842  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0560  alcohol dehydrogenase  43.05 
 
 
403 aa  272  8.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5027  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  41.1 
 
 
398 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441343  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4502  alcohol dehydrogenase  41.1 
 
 
398 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0564  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.58 
 
 
398 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3278  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.84 
 
 
398 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.240401  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5090  alcohol dehydrogenase  40.84 
 
 
398 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0197015  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5192  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  40.84 
 
 
398 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371518  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3691  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  44.72 
 
 
403 aa  269  7e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0053  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  40.48 
 
 
398 aa  269  8e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.085418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4986  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  43.71 
 
 
406 aa  268  8e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71560  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  43.27 
 
 
399 aa  269  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6209  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  43.27 
 
 
399 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3539  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  40.63 
 
 
398 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.671185  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4879  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  41.95 
 
 
399 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0351  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  41.95 
 
 
399 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0853836  normal  0.45592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5202  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.48 
 
 
399 aa  266  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0670131 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3307  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  40.11 
 
 
399 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0328  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  41.95 
 
 
399 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.225321 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2920  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  42.18 
 
 
406 aa  266  5.999999999999999e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.754967  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0738  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  40.84 
 
 
399 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0826  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  40.84 
 
 
399 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0350  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  41.95 
 
 
399 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0139  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  42.06 
 
 
395 aa  265  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2104  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  40.58 
 
 
399 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4421  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  42.41 
 
 
405 aa  265  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400614  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1008  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  40.58 
 
 
399 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.817957  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0455  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  43.01 
 
 
399 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0468  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  40.58 
 
 
399 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1981  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  40.58 
 
 
399 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4718  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.16 
 
 
399 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0712  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  40.58 
 
 
399 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4601  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  40.95 
 
 
396 aa  261  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4126  alcohol dehydrogenase  41.95 
 
 
399 aa  259  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1589  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  40.58 
 
 
399 aa  259  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152931  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3453  formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  40.21 
 
 
396 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000209354  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5061  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  40.84 
 
 
399 aa  257  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0129321 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4302  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  41.35 
 
 
406 aa  257  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.271716 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.91 
 
 
385 aa  256  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  hitchhiker  0.00205277 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0995  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.21 
 
 
397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.171586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2838  alcohol dehydrogenase, glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  36.8 
 
 
377 aa  253  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.409585  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0065  alcohol dehydrogenase  37.41 
 
 
386 aa  252  6e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0335  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.66 
 
 
395 aa  252  7e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1870  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  40.58 
 
 
477 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3155  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  36.55 
 
 
377 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.633298  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3114  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  36.55 
 
 
377 aa  250  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0774  formaldehyde dehydrogenase  44.11 
 
 
293 aa  250  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000012543 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2124  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  36.55 
 
 
377 aa  249  5e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.770168  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2881  alcohol dehydrogenase, glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  36.55 
 
 
377 aa  249  7e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3060  formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  40.48 
 
 
397 aa  248  9e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00702018 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4057  alcohol dehydrogenase  37.35 
 
 
433 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.788461  normal  0.848638 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3145  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.29 
 
 
377 aa  247  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2912  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.04 
 
 
377 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.549195  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3131  alcohol dehydrogenase  36.04 
 
 
377 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5561  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.63 
 
 
389 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210102  normal  0.0249106 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3133  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  36.29 
 
 
377 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3227  alcohol dehydrogenase  42.36 
 
 
399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.315388 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.23 
 
 
392 aa  245  9e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04320  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  40.71 
 
 
397 aa  245  9e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2370  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.9 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1223  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.54 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417243 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3683  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.05 
 
 
397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1926  alcohol dehydrogenase  37.25 
 
 
393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.64 
 
 
405 aa  243  3.9999999999999997e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.89 
 
 
393 aa  243  5e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0850  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.58 
 
 
397 aa  242  7e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.92 
 
 
392 aa  242  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3104  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  36.34 
 
 
394 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.345929  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3187  alcohol dehydrogenase  35.38 
 
 
389 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0166  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  34.72 
 
 
395 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912922  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.36 
 
 
389 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3833  alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
394 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24597  normal  0.375314 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4105  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.48 
 
 
390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2247  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.64 
 
 
391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.644611  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>