More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4039 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4039  putative glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  100 
 
 
398 aa  819    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4601  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  76.83 
 
 
396 aa  634    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0139  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  76.88 
 
 
395 aa  632  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0995  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  76.98 
 
 
397 aa  625  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.171586  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3060  formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  76.96 
 
 
397 aa  612  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00702018 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0850  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  79.12 
 
 
397 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5192  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  72.01 
 
 
398 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371518  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0564  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  72.01 
 
 
398 aa  587  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3278  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  72.01 
 
 
398 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.240401  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5027  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  72.01 
 
 
398 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441343  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4502  alcohol dehydrogenase  72.01 
 
 
398 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5090  alcohol dehydrogenase  72.01 
 
 
398 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0197015  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0738  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  72.26 
 
 
399 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0826  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  72.26 
 
 
399 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2104  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  72.52 
 
 
399 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3539  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  72.01 
 
 
398 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.671185  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0712  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  72.01 
 
 
399 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0053  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  71.68 
 
 
398 aa  580  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.085418 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3307  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  71.25 
 
 
399 aa  578  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0468  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  72.01 
 
 
399 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3959  Formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  70.12 
 
 
410 aa  580  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0139443  normal  0.927501 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1981  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  72.01 
 
 
399 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1008  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  72.01 
 
 
399 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.817957  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4824  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  71.25 
 
 
398 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1589  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  73.28 
 
 
399 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152931  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1870  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  72.26 
 
 
477 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4986  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  71.64 
 
 
406 aa  568  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4806  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  70.18 
 
 
409 aa  566  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.510842  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2920  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  68.83 
 
 
406 aa  567  1e-160  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.754967  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3740  hypothetical protein  68.58 
 
 
408 aa  567  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal  0.0188939 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5061  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  72.26 
 
 
399 aa  566  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0129321 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4421  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  68.83 
 
 
405 aa  561  1.0000000000000001e-159  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400614  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1013  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  68.17 
 
 
403 aa  551  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.424822 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0560  alcohol dehydrogenase  68.42 
 
 
403 aa  546  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1186  alcohol dehydrogenase  70.41 
 
 
394 aa  546  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3227  alcohol dehydrogenase  70.05 
 
 
399 aa  542  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.315388 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4487  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  68.89 
 
 
396 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.321496  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0351  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  70.48 
 
 
399 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0853836  normal  0.45592 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0328  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  70.23 
 
 
399 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.225321 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4302  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  69.15 
 
 
406 aa  538  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.271716 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6435  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  68.11 
 
 
396 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00150982 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0350  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  70.23 
 
 
399 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4879  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  70.66 
 
 
399 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4126  alcohol dehydrogenase  70.15 
 
 
399 aa  536  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5202  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  70.48 
 
 
399 aa  537  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0670131 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0335  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  68.62 
 
 
395 aa  536  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4718  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  67.94 
 
 
399 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6209  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  68.45 
 
 
399 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3453  formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  68.11 
 
 
396 aa  527  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000209354  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0455  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  67.68 
 
 
399 aa  522  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3691  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  67.67 
 
 
403 aa  521  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71560  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  68.19 
 
 
399 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04320  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  53.18 
 
 
397 aa  412  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0111  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.5 
 
 
404 aa  342  7e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0147  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  45.36 
 
 
390 aa  309  6.999999999999999e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26960  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  46.54 
 
 
372 aa  304  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.537835  normal  0.314257 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09114  hypothetical protein  45.93 
 
 
400 aa  301  2e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3025  putative alcohol dehydrogenase  45.48 
 
 
380 aa  300  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1474  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.56 
 
 
380 aa  298  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.228942  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1837  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43 
 
 
389 aa  293  5e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.607752  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0678  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.34 
 
 
388 aa  289  6e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2296  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.8 
 
 
379 aa  278  8e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4723  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.64 
 
 
387 aa  278  1e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.592653  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3462  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.95 
 
 
382 aa  276  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0077  putative glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  43.62 
 
 
378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621151  hitchhiker  0.00187852 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2410  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.1 
 
 
379 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06280  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  43.8 
 
 
384 aa  268  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0561  alcohol dehydrogenase  40.92 
 
 
404 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.324844  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2676  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  41.32 
 
 
379 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.976197  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1573  alcohol dehydrogenase  40.63 
 
 
377 aa  259  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3009  alcohol dehydrogenase  41.22 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479087  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2449  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.18 
 
 
417 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250445  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0165  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.62 
 
 
389 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0160  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.81 
 
 
392 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36660  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  35.1 
 
 
415 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000975221  normal  0.705006 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5345  alcohol dehydrogenase  36.05 
 
 
399 aa  187  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.501465  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.61 
 
 
398 aa  186  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.609837  decreased coverage  0.000185041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  34.09 
 
 
415 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2482  putative zinc-containing dehydrogenase  35.33 
 
 
389 aa  182  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0065  alcohol dehydrogenase  33.82 
 
 
386 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.15 
 
 
392 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
389 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0166  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  34.49 
 
 
395 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912922  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.29 
 
 
405 aa  179  5.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.39 
 
 
387 aa  178  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3527  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.25 
 
 
411 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129082  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3112  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  35.52 
 
 
388 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.152698  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.99 
 
 
384 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.92 
 
 
384 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.69 
 
 
388 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3683  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.69 
 
 
397 aa  177  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1875  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  33.74 
 
 
411 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2657  alcohol dehydrogenase  35.35 
 
 
388 aa  176  7e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1328  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.29 
 
 
390 aa  176  8e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975088  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0531  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.34 
 
 
390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3970  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.09 
 
 
400 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4801  alcohol dehydrogenase  34.69 
 
 
389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0751128 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0764  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.64 
 
 
390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1016  alcohol dehydrogenase  31.64 
 
 
390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.88 
 
 
392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>