More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2676 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2676  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  100 
 
 
379 aa  788    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.976197  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2410  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  95.49 
 
 
379 aa  730    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3009  alcohol dehydrogenase  88.86 
 
 
379 aa  667    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479087  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2296  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  70.11 
 
 
379 aa  570  1e-161  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3462  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  69.13 
 
 
382 aa  553  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0077  putative glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  69.76 
 
 
378 aa  522  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621151  hitchhiker  0.00187852 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06280  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  65.87 
 
 
384 aa  518  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1474  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  60.69 
 
 
380 aa  474  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.228942  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3025  putative alcohol dehydrogenase  56.61 
 
 
380 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26960  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  57.49 
 
 
372 aa  450  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.537835  normal  0.314257 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1837  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.69 
 
 
389 aa  411  1e-114  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.607752  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0147  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  52.17 
 
 
390 aa  412  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4723  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.26 
 
 
387 aa  409  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.592653  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0678  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.03 
 
 
388 aa  400  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09114  hypothetical protein  50.26 
 
 
400 aa  393  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0561  alcohol dehydrogenase  48.86 
 
 
404 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.324844  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1573  alcohol dehydrogenase  49.6 
 
 
377 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2449  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.49 
 
 
417 aa  328  8e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250445  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4487  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  40.98 
 
 
396 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.321496  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6435  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  40.72 
 
 
396 aa  285  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00150982 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4039  putative glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  41.32 
 
 
398 aa  283  4.0000000000000003e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4824  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40 
 
 
398 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0560  alcohol dehydrogenase  41.1 
 
 
403 aa  275  8e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71560  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  43.54 
 
 
399 aa  275  9e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0053  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  39.34 
 
 
398 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.085418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6209  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  43.54 
 
 
399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3307  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  40.51 
 
 
399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1186  alcohol dehydrogenase  41.9 
 
 
394 aa  272  6e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4806  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  40.41 
 
 
409 aa  272  8.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.510842  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2920  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  41.25 
 
 
406 aa  272  8.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.754967  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3539  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  39.03 
 
 
398 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.671185  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0850  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.54 
 
 
397 aa  271  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4502  alcohol dehydrogenase  39.24 
 
 
398 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5027  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  39.24 
 
 
398 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441343  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2104  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  39.29 
 
 
399 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3278  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.99 
 
 
398 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.240401  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5192  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  38.99 
 
 
398 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371518  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5090  alcohol dehydrogenase  38.99 
 
 
398 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0197015  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3691  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  41.6 
 
 
403 aa  269  8e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0738  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  39.03 
 
 
399 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0564  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.73 
 
 
398 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4421  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  42.38 
 
 
405 aa  268  8.999999999999999e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400614  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0826  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  39.03 
 
 
399 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3453  formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  40.72 
 
 
396 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000209354  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3740  hypothetical protein  40 
 
 
408 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal  0.0188939 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0712  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  38.78 
 
 
399 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1981  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  38.78 
 
 
399 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1008  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  38.78 
 
 
399 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.817957  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0468  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  38.78 
 
 
399 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0335  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.69 
 
 
395 aa  266  5e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4986  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  40.55 
 
 
406 aa  265  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3060  formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  41.33 
 
 
397 aa  264  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00702018 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4126  alcohol dehydrogenase  42.22 
 
 
399 aa  263  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1013  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  39.65 
 
 
403 aa  263  4.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.424822 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4718  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.13 
 
 
399 aa  262  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0995  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.62 
 
 
397 aa  262  8.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.171586  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4879  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  40.63 
 
 
399 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0455  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  41.88 
 
 
399 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5202  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.42 
 
 
399 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0670131 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1589  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  39.49 
 
 
399 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152931  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0351  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  40.63 
 
 
399 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0853836  normal  0.45592 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3683  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.1 
 
 
397 aa  261  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5345  alcohol dehydrogenase  38.75 
 
 
399 aa  260  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.501465  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4601  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  40.72 
 
 
396 aa  259  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0328  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  40.63 
 
 
399 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.225321 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0350  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  40.63 
 
 
399 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5061  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  40.25 
 
 
399 aa  259  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0129321 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3959  Formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  38.56 
 
 
410 aa  258  9e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0139443  normal  0.927501 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0139  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  39.65 
 
 
395 aa  258  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5561  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.62 
 
 
389 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210102  normal  0.0249106 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1870  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  38.78 
 
 
477 aa  256  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.25 
 
 
405 aa  256  5e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0166  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  35.71 
 
 
395 aa  255  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912922  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4302  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  40.84 
 
 
406 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.271716 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0065  alcohol dehydrogenase  37.59 
 
 
386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.7 
 
 
393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2370  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.13 
 
 
389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.71 
 
 
392 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.45 
 
 
389 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0531  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.61 
 
 
390 aa  249  8e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39 
 
 
385 aa  247  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  hitchhiker  0.00205277 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4494  alcohol dehydrogenase  36.63 
 
 
390 aa  247  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134818  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1223  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.28 
 
 
390 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417243 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4105  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.86 
 
 
390 aa  247  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4801  alcohol dehydrogenase  36.83 
 
 
389 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0751128 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3187  alcohol dehydrogenase  37.62 
 
 
389 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3227  alcohol dehydrogenase  38.93 
 
 
399 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.315388 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4057  alcohol dehydrogenase  35.89 
 
 
433 aa  246  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.788461  normal  0.848638 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1926  alcohol dehydrogenase  38.44 
 
 
393 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.25 
 
 
391 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0110  alcohol dehydrogenase  34.95 
 
 
390 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5159  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.13 
 
 
390 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150662  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.32 
 
 
398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.609837  decreased coverage  0.000185041 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.54 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2860  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.87 
 
 
389 aa  243  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.489026  normal  0.707248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.78 
 
 
390 aa  243  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.34 
 
 
392 aa  243  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2247  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.47 
 
 
391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.644611  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2264  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.36 
 
 
390 aa  243  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3114  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  36.41 
 
 
377 aa  243  6e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>