More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1573 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1573  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
377 aa  763    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3025  putative alcohol dehydrogenase  61.64 
 
 
380 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1474  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.99 
 
 
380 aa  444  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.228942  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0147  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  56.12 
 
 
390 aa  431  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26960  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  57.6 
 
 
372 aa  429  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.537835  normal  0.314257 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3462  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.3 
 
 
382 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06280  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  55.56 
 
 
384 aa  416  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2296  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  52.51 
 
 
379 aa  404  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1837  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.81 
 
 
389 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.607752  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0678  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.96 
 
 
388 aa  394  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4723  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.32 
 
 
387 aa  385  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.592653  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0561  alcohol dehydrogenase  50.13 
 
 
404 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.324844  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0077  putative glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  52.77 
 
 
378 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621151  hitchhiker  0.00187852 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09114  hypothetical protein  49.87 
 
 
400 aa  375  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2410  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.6 
 
 
379 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3009  alcohol dehydrogenase  49.87 
 
 
379 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479087  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2676  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  49.6 
 
 
379 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.976197  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2449  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.26 
 
 
417 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250445  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4487  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  42.78 
 
 
396 aa  279  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.321496  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6435  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  42.78 
 
 
396 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00150982 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4806  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  41.19 
 
 
409 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.510842  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3959  Formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  41.9 
 
 
410 aa  271  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0139443  normal  0.927501 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1013  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  41.21 
 
 
403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.424822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3740  hypothetical protein  41.34 
 
 
408 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal  0.0188939 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0335  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44 
 
 
395 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3691  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  42.71 
 
 
403 aa  268  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3453  formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  43.04 
 
 
396 aa  264  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000209354  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.6 
 
 
389 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1186  alcohol dehydrogenase  43.2 
 
 
394 aa  262  8.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4039  putative glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  40.63 
 
 
398 aa  259  4e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4421  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  41.09 
 
 
405 aa  259  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400614  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4986  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  42.12 
 
 
406 aa  257  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4824  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.95 
 
 
398 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0139  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  41.16 
 
 
395 aa  255  7e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0560  alcohol dehydrogenase  39.45 
 
 
403 aa  256  7e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2920  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  41.25 
 
 
406 aa  255  9e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.754967  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0575  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.31 
 
 
389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.86 
 
 
391 aa  254  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.06 
 
 
392 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.81 
 
 
385 aa  253  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0564  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.16 
 
 
398 aa  252  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3539  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  40.63 
 
 
398 aa  252  7e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.671185  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3278  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.16 
 
 
398 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.240401  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5192  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  41.16 
 
 
398 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371518  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5090  alcohol dehydrogenase  41.16 
 
 
398 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0197015  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0053  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  41.27 
 
 
398 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.085418 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  38.75 
 
 
422 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3187  alcohol dehydrogenase  37.38 
 
 
389 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0065  alcohol dehydrogenase  39.6 
 
 
386 aa  250  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4502  alcohol dehydrogenase  40.9 
 
 
398 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5027  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  40.9 
 
 
398 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441343  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4498  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.31 
 
 
389 aa  250  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5561  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.72 
 
 
389 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210102  normal  0.0249106 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0995  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.64 
 
 
397 aa  250  3e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.171586  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4057  alcohol dehydrogenase  38.52 
 
 
433 aa  249  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.788461  normal  0.848638 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2860  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.12 
 
 
389 aa  249  4e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.489026  normal  0.707248 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2104  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  40.63 
 
 
399 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71560  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  42.48 
 
 
399 aa  249  8e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0826  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  40.37 
 
 
399 aa  249  8e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0738  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  40.37 
 
 
399 aa  249  8e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6209  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  42.48 
 
 
399 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0468  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  40.11 
 
 
399 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1981  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  40.11 
 
 
399 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1008  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  40.11 
 
 
399 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.817957  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0712  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  40.11 
 
 
399 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.81 
 
 
388 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3307  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  39.31 
 
 
399 aa  246  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2370  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.72 
 
 
389 aa  245  9e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0455  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  43.01 
 
 
399 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0592  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.59 
 
 
401 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4302  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  41.35 
 
 
406 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.271716 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.48 
 
 
385 aa  245  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  hitchhiker  0.00205277 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0166  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  37.22 
 
 
395 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912922  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.22 
 
 
392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0351  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  42.48 
 
 
399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0853836  normal  0.45592 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  37.94 
 
 
415 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1016  alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
390 aa  243  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4718  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.74 
 
 
399 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0764  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.39 
 
 
390 aa  243  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.47 
 
 
405 aa  243  3e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1328  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.39 
 
 
390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975088  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4601  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  39.79 
 
 
396 aa  243  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3227  alcohol dehydrogenase  42.48 
 
 
399 aa  243  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.315388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1223  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.98 
 
 
390 aa  242  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417243 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36660  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  37.44 
 
 
415 aa  242  9e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000975221  normal  0.705006 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.46 
 
 
384 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0328  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  41.95 
 
 
399 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.225321 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24840  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  36.78 
 
 
444 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0850  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.11 
 
 
397 aa  240  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2657  alcohol dehydrogenase  37 
 
 
388 aa  240  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0350  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  41.95 
 
 
399 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0122  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.56 
 
 
401 aa  240  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.566245 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.2 
 
 
384 aa  239  5e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4126  alcohol dehydrogenase  42.22 
 
 
399 aa  239  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5202  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.69 
 
 
399 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0670131 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4879  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  41.69 
 
 
399 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1870  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  41.16 
 
 
477 aa  237  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5660  alcohol dehydrogenase  37.65 
 
 
401 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  39.9 
 
 
384 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2255  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.8 
 
 
393 aa  236  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000285596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>