More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0995 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0995  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  100 
 
 
397 aa  816    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.171586  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0850  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  79.75 
 
 
397 aa  634  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4601  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  77.24 
 
 
396 aa  629  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4039  putative glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  76.98 
 
 
398 aa  625  1e-178  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3060  formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  78.63 
 
 
397 aa  621  1e-177  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00702018 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0139  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  76.21 
 
 
395 aa  620  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2104  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  69.27 
 
 
399 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4806  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  70.75 
 
 
409 aa  567  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.510842  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3740  hypothetical protein  69.58 
 
 
408 aa  570  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal  0.0188939 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0738  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  69.27 
 
 
399 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0826  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  69.27 
 
 
399 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1981  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  69.02 
 
 
399 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0053  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  69.54 
 
 
398 aa  567  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.085418 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0468  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  69.02 
 
 
399 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1008  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  69.02 
 
 
399 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.817957  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3959  Formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  68.81 
 
 
410 aa  566  1e-160  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0139443  normal  0.927501 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3539  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  68.51 
 
 
398 aa  564  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.671185  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0712  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  69.02 
 
 
399 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0455  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  72.26 
 
 
399 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4986  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  71.22 
 
 
406 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5027  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  68.26 
 
 
398 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441343  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0564  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  68.26 
 
 
398 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3278  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  68.26 
 
 
398 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.240401  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4502  alcohol dehydrogenase  68.26 
 
 
398 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2920  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  67.81 
 
 
406 aa  561  1.0000000000000001e-159  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.754967  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5090  alcohol dehydrogenase  68.26 
 
 
398 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0197015  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5192  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  68.26 
 
 
398 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371518  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4718  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  71.54 
 
 
399 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4824  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  68.26 
 
 
398 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3307  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  67.51 
 
 
399 aa  556  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1870  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  69.02 
 
 
477 aa  555  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3227  alcohol dehydrogenase  71.36 
 
 
399 aa  555  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.315388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4421  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  68.33 
 
 
405 aa  556  1e-157  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400614  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4879  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  70.78 
 
 
399 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0328  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  70.92 
 
 
399 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.225321 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0350  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  70.92 
 
 
399 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1013  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  68.07 
 
 
403 aa  549  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.424822 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0351  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  70.66 
 
 
399 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0853836  normal  0.45592 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4126  alcohol dehydrogenase  70.89 
 
 
399 aa  550  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6209  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  70.15 
 
 
399 aa  547  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71560  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  70.41 
 
 
399 aa  549  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0560  alcohol dehydrogenase  67.82 
 
 
403 aa  548  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5061  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  68.26 
 
 
399 aa  541  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0129321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5202  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  69.52 
 
 
399 aa  542  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0670131 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1589  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  67.76 
 
 
399 aa  542  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152931  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0335  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  68.78 
 
 
395 aa  539  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6435  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  66.08 
 
 
396 aa  534  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00150982 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3691  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  68.83 
 
 
403 aa  533  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4487  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  65.82 
 
 
396 aa  531  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.321496  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1186  alcohol dehydrogenase  68.94 
 
 
394 aa  530  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4302  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  67 
 
 
406 aa  523  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.271716 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3453  formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  66.58 
 
 
396 aa  512  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000209354  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04320  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  52.26 
 
 
397 aa  394  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0111  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.12 
 
 
404 aa  364  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3025  putative alcohol dehydrogenase  45.33 
 
 
380 aa  291  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09114  hypothetical protein  43.59 
 
 
400 aa  286  4e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26960  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  43.97 
 
 
372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.537835  normal  0.314257 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1474  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.96 
 
 
380 aa  283  5.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.228942  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0147  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.75 
 
 
390 aa  280  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1837  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.38 
 
 
389 aa  278  1e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.607752  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0678  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.26 
 
 
388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2296  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.62 
 
 
379 aa  271  1e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4723  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.32 
 
 
387 aa  268  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.592653  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06280  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  43.6 
 
 
384 aa  262  6.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3462  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.21 
 
 
382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0561  alcohol dehydrogenase  38.21 
 
 
404 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.324844  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0077  putative glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  44.48 
 
 
378 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621151  hitchhiker  0.00187852 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1573  alcohol dehydrogenase  41.64 
 
 
377 aa  250  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2676  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  41.62 
 
 
379 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.976197  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2410  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.52 
 
 
379 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3009  alcohol dehydrogenase  42.15 
 
 
379 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479087  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3112  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  37.37 
 
 
388 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.152698  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3527  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.1 
 
 
411 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129082  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2449  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.31 
 
 
417 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250445  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0165  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.84 
 
 
389 aa  186  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1875  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  35.61 
 
 
411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.94 
 
 
387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2481  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.18 
 
 
387 aa  183  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.84 
 
 
392 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5345  alcohol dehydrogenase  36.04 
 
 
399 aa  182  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.501465  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0122  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.75 
 
 
401 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.566245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.49 
 
 
398 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.609837  decreased coverage  0.000185041 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.75 
 
 
389 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.54 
 
 
391 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  0.119261 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00577  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  33.25 
 
 
412 aa  180  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00566  hypothetical protein  33.25 
 
 
412 aa  180  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.1 
 
 
405 aa  180  4e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2657  alcohol dehydrogenase  35.68 
 
 
388 aa  180  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3016  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.25 
 
 
412 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3035  alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 
412 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3970  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.6 
 
 
400 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0139  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.5 
 
 
401 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0660  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  33.25 
 
 
412 aa  179  8e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0695  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33 
 
 
412 aa  179  8e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2149  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.18 
 
 
386 aa  179  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.406335  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
388 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.85 
 
 
392 aa  176  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0160  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.18 
 
 
392 aa  176  6e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  35.38 
 
 
384 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2429  alcohol dehydrogenase  33.5 
 
 
400 aa  176  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0410446  normal  0.763827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>