More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2449 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2449  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
417 aa  816    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250445  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3025  putative alcohol dehydrogenase  61.05 
 
 
380 aa  456  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0147  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  58.78 
 
 
390 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26960  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  59.89 
 
 
372 aa  426  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.537835  normal  0.314257 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1474  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.87 
 
 
380 aa  404  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.228942  normal  0.246435 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09114  hypothetical protein  54.57 
 
 
400 aa  400  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0678  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.08 
 
 
388 aa  383  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1837  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.67 
 
 
389 aa  382  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.607752  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06280  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  53.02 
 
 
384 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2296  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  50.52 
 
 
379 aa  372  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3462  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.83 
 
 
382 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0561  alcohol dehydrogenase  49.87 
 
 
404 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.324844  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4723  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.73 
 
 
387 aa  370  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.592653  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1573  alcohol dehydrogenase  50.66 
 
 
377 aa  346  5e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0077  putative glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  51.04 
 
 
378 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621151  hitchhiker  0.00187852 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2410  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.83 
 
 
379 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3009  alcohol dehydrogenase  48.3 
 
 
379 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479087  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2676  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  48.17 
 
 
379 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.976197  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.09 
 
 
385 aa  236  7e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  hitchhiker  0.00205277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.96 
 
 
389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.56 
 
 
392 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0065  alcohol dehydrogenase  38.4 
 
 
386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4494  alcohol dehydrogenase  36.3 
 
 
390 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134818  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.75 
 
 
405 aa  234  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0592  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.57 
 
 
401 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.56 
 
 
388 aa  232  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4105  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.64 
 
 
390 aa  232  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1016  alcohol dehydrogenase  35.46 
 
 
390 aa  232  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0764  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.46 
 
 
390 aa  232  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4057  alcohol dehydrogenase  37.34 
 
 
433 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.788461  normal  0.848638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2247  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.11 
 
 
391 aa  230  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.644611  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1328  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.95 
 
 
390 aa  230  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975088  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2370  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.34 
 
 
389 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00577  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  36.71 
 
 
412 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00566  hypothetical protein  36.71 
 
 
412 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3187  alcohol dehydrogenase  35.59 
 
 
389 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3016  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.47 
 
 
412 aa  229  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3035  alcohol dehydrogenase  36.47 
 
 
412 aa  229  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2481  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.16 
 
 
387 aa  229  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3740  hypothetical protein  39.13 
 
 
408 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal  0.0188939 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0695  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  36.71 
 
 
412 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0660  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  37.05 
 
 
412 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3959  Formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  40.98 
 
 
410 aa  227  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0139443  normal  0.927501 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3683  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.39 
 
 
397 aa  227  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3881  alcohol dehydrogenase  34.74 
 
 
391 aa  227  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0212673 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.9 
 
 
384 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4806  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  39.23 
 
 
409 aa  227  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.510842  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1223  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.32 
 
 
390 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417243 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0160  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.48 
 
 
392 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3368  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.24 
 
 
384 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5561  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.09 
 
 
389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210102  normal  0.0249106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0531  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.22 
 
 
390 aa  226  7e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  37.34 
 
 
415 aa  226  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4441  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.51 
 
 
384 aa  225  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204388  normal  0.287337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2920  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  42.19 
 
 
406 aa  225  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.754967  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6435  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  38.89 
 
 
396 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00150982 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  36.24 
 
 
412 aa  225  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2984  alcohol dehydrogenase  37.59 
 
 
400 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.29856  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4986  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  41.9 
 
 
406 aa  225  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2860  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.41 
 
 
389 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.489026  normal  0.707248 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1875  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  36.95 
 
 
411 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3527  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.7 
 
 
411 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129082  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2264  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.74 
 
 
390 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.36 
 
 
392 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.99 
 
 
390 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24840  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  35.89 
 
 
444 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.06 
 
 
387 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2307  alcohol dehydrogenase  34.99 
 
 
390 aa  223  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0161452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36660  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  36.84 
 
 
415 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000975221  normal  0.705006 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5159  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.89 
 
 
390 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150662  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2300  alcohol dehydrogenase  36.88 
 
 
388 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  hitchhiker  0.00000777829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.84 
 
 
385 aa  223  6e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5345  alcohol dehydrogenase  35.15 
 
 
399 aa  223  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.501465  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0165  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.66 
 
 
389 aa  222  8e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0166  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  34.99 
 
 
395 aa  222  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912922  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4487  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  38.64 
 
 
396 aa  222  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.321496  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2149  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.34 
 
 
386 aa  222  9e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.406335  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3669  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.46 
 
 
386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.949441  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3104  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  35.63 
 
 
394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.345929  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.14 
 
 
384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0110  alcohol dehydrogenase  34.16 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4421  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  41.48 
 
 
405 aa  220  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400614  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  35.7 
 
 
422 aa  221  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5660  alcohol dehydrogenase  37.56 
 
 
401 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2429  alcohol dehydrogenase  36.61 
 
 
400 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0410446  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5217  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.51 
 
 
384 aa  220  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3833  alcohol dehydrogenase  35.38 
 
 
394 aa  220  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24597  normal  0.375314 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3970  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.1 
 
 
400 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3112  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  37.78 
 
 
388 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.152698  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0655  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.13 
 
 
412 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3663  hypothetical protein  35.4 
 
 
394 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184617  normal  0.501234 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0728  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase (glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase) (fdh) (faldh)  35.68 
 
 
412 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0669  alcohol dehydrogenase GroES-like domain protein  35.13 
 
 
412 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432264  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1186  alcohol dehydrogenase  40.98 
 
 
394 aa  219  6e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0560  alcohol dehydrogenase  39.1 
 
 
403 aa  219  7.999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.2 
 
 
398 aa  219  8.999999999999998e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.609837  decreased coverage  0.000185041 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3453  formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  39.69 
 
 
396 aa  219  8.999999999999998e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000209354  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4498  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.78 
 
 
389 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1013  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  38.85 
 
 
403 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.424822 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1966  alcohol dehydrogenase  39.16 
 
 
393 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0317258  normal  0.133986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>