More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0077 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0077  putative glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  100 
 
 
378 aa  775    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621151  hitchhiker  0.00187852 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3462  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  70.26 
 
 
382 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2296  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  69.23 
 
 
379 aa  556  1e-157  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2410  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  70.18 
 
 
379 aa  547  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2676  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  69.76 
 
 
379 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.976197  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3009  alcohol dehydrogenase  72.03 
 
 
379 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479087  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06280  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  64.02 
 
 
384 aa  499  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1474  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  62.2 
 
 
380 aa  489  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.228942  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3025  putative alcohol dehydrogenase  59.95 
 
 
380 aa  484  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26960  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  60.96 
 
 
372 aa  479  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.537835  normal  0.314257 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0147  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  56.27 
 
 
390 aa  448  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09114  hypothetical protein  55 
 
 
400 aa  433  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4723  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.01 
 
 
387 aa  415  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.592653  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1573  alcohol dehydrogenase  52.77 
 
 
377 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1837  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.92 
 
 
389 aa  413  1e-114  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.607752  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0678  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.55 
 
 
388 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0561  alcohol dehydrogenase  50.63 
 
 
404 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.324844  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2449  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.53 
 
 
417 aa  360  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250445  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4039  putative glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  43.62 
 
 
398 aa  301  9e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4824  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.77 
 
 
398 aa  299  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0053  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  43.88 
 
 
398 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.085418 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3307  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  43.24 
 
 
399 aa  293  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6435  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  42.53 
 
 
396 aa  292  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00150982 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4502  alcohol dehydrogenase  44.3 
 
 
398 aa  292  6e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5027  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  44.3 
 
 
398 aa  292  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441343  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4487  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  42.27 
 
 
396 aa  291  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.321496  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5192  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  43.77 
 
 
398 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371518  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0564  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.5 
 
 
398 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3278  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  43.77 
 
 
398 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.240401  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5090  alcohol dehydrogenase  43.77 
 
 
398 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0197015  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3539  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  43.5 
 
 
398 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.671185  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0738  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  42.71 
 
 
399 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0826  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  42.71 
 
 
399 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2104  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  42.44 
 
 
399 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0560  alcohol dehydrogenase  44.19 
 
 
403 aa  286  4e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1008  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  42.44 
 
 
399 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.817957  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0468  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  42.44 
 
 
399 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1981  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  42.44 
 
 
399 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0712  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  42.44 
 
 
399 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1186  alcohol dehydrogenase  44.68 
 
 
394 aa  285  9e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71560  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  44.83 
 
 
399 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6209  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  44.83 
 
 
399 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4806  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  41.56 
 
 
409 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.510842  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3740  hypothetical protein  42.32 
 
 
408 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal  0.0188939 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0995  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44.48 
 
 
397 aa  280  4e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.171586  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4879  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  43.24 
 
 
399 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1589  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  42.71 
 
 
399 aa  278  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152931  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4601  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  44.38 
 
 
396 aa  278  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3060  formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  45.12 
 
 
397 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00702018 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5202  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.5 
 
 
399 aa  278  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0670131 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3453  formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  42.78 
 
 
396 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000209354  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0351  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  42.97 
 
 
399 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0853836  normal  0.45592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4986  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  42.6 
 
 
406 aa  277  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5061  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  42.97 
 
 
399 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0129321 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0328  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  42.97 
 
 
399 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.225321 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4718  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.18 
 
 
399 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4126  alcohol dehydrogenase  43.5 
 
 
399 aa  276  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0350  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  42.97 
 
 
399 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0850  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44 
 
 
397 aa  276  6e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1870  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  42.97 
 
 
477 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4421  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  41.56 
 
 
405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400614  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0455  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  43.77 
 
 
399 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0139  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  42.55 
 
 
395 aa  273  5.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1013  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  42.46 
 
 
403 aa  272  7e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.424822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3959  Formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  41.45 
 
 
410 aa  272  8.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0139443  normal  0.927501 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2920  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  43.26 
 
 
406 aa  270  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.754967  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3691  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  41.92 
 
 
403 aa  269  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0335  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.67 
 
 
395 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3227  alcohol dehydrogenase  44.06 
 
 
399 aa  266  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.315388 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4302  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  43.73 
 
 
406 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.271716 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3114  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  37.31 
 
 
377 aa  261  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0065  alcohol dehydrogenase  39.4 
 
 
386 aa  261  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2838  alcohol dehydrogenase, glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  37.31 
 
 
377 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.409585  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2912  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.06 
 
 
377 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.549195  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3131  alcohol dehydrogenase  37.06 
 
 
377 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.16 
 
 
405 aa  258  1e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3145  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.06 
 
 
377 aa  257  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2124  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  36.8 
 
 
377 aa  257  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.770168  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2881  alcohol dehydrogenase, glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  37.31 
 
 
377 aa  256  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3133  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  37.06 
 
 
377 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3155  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  37.31 
 
 
377 aa  255  9e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.633298  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.2 
 
 
392 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.64 
 
 
384 aa  252  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.64 
 
 
384 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4498  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.35 
 
 
389 aa  249  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.65 
 
 
387 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0166  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  36.14 
 
 
395 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912922  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4494  alcohol dehydrogenase  37.99 
 
 
390 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134818  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.48 
 
 
393 aa  246  6.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2149  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.75 
 
 
386 aa  245  8e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.406335  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4057  alcohol dehydrogenase  37.13 
 
 
433 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.788461  normal  0.848638 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5561  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.88 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210102  normal  0.0249106 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.47 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3104  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  38.08 
 
 
394 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.345929  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3833  alcohol dehydrogenase  38.08 
 
 
394 aa  243  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24597  normal  0.375314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.47 
 
 
392 aa  243  6e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3683  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.39 
 
 
397 aa  243  6e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0122  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.47 
 
 
401 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.566245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.41 
 
 
385 aa  242  7.999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  hitchhiker  0.00205277 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3112  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  39.36 
 
 
388 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.152698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>