More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4806 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4986  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  80.75 
 
 
406 aa  649    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4806  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  100 
 
 
409 aa  832    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.510842  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4421  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  82 
 
 
405 aa  679    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400614  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1013  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  80.25 
 
 
403 aa  659    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.424822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3740  hypothetical protein  78.62 
 
 
408 aa  665    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal  0.0188939 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0560  alcohol dehydrogenase  79 
 
 
403 aa  653    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3959  Formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  80.95 
 
 
410 aa  668    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0139443  normal  0.927501 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3691  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  80.25 
 
 
403 aa  634  1e-180  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4302  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  76.49 
 
 
406 aa  622  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.271716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2920  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  74.87 
 
 
406 aa  608  1e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.754967  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0139  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  71.07 
 
 
395 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4039  putative glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  70.18 
 
 
398 aa  566  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0995  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  70.75 
 
 
397 aa  567  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.171586  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4601  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  69.83 
 
 
396 aa  561  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5027  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  69.4 
 
 
398 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441343  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4502  alcohol dehydrogenase  69.4 
 
 
398 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0564  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  68.91 
 
 
398 aa  549  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5192  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  68.91 
 
 
398 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371518  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3278  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  68.91 
 
 
398 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.240401  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5090  alcohol dehydrogenase  68.91 
 
 
398 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0197015  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0053  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  68.33 
 
 
398 aa  545  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.085418 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0712  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  68.66 
 
 
399 aa  544  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0468  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  68.66 
 
 
399 aa  544  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0826  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  68.91 
 
 
399 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3539  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  68.41 
 
 
398 aa  545  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.671185  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3307  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  68.91 
 
 
399 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2104  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  68.66 
 
 
399 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1008  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  68.66 
 
 
399 aa  544  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.817957  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1981  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  68.66 
 
 
399 aa  544  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0738  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  68.91 
 
 
399 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0850  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  70.25 
 
 
397 aa  544  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4824  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  67.41 
 
 
398 aa  538  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3060  formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  71.04 
 
 
397 aa  537  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00702018 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6209  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  69.73 
 
 
399 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1870  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  68.91 
 
 
477 aa  531  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1589  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  68.41 
 
 
399 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152931  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4879  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  69.31 
 
 
399 aa  524  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71560  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  69.48 
 
 
399 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1186  alcohol dehydrogenase  67.83 
 
 
394 aa  526  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0328  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  68.97 
 
 
399 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.225321 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3227  alcohol dehydrogenase  68.66 
 
 
399 aa  523  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.315388 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0350  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  68.97 
 
 
399 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5061  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  68.16 
 
 
399 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0129321 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0351  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  68.97 
 
 
399 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0853836  normal  0.45592 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6435  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  63.97 
 
 
396 aa  521  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00150982 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4487  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  63.73 
 
 
396 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.321496  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4126  alcohol dehydrogenase  68.98 
 
 
399 aa  520  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0455  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  67.89 
 
 
399 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4718  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  67.98 
 
 
399 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5202  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  68.49 
 
 
399 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0670131 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0335  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  63.7 
 
 
395 aa  506  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3453  formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  63.24 
 
 
396 aa  496  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000209354  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04320  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  49.01 
 
 
397 aa  382  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0111  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.96 
 
 
404 aa  351  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0147  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44.55 
 
 
390 aa  306  6e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09114  hypothetical protein  43.97 
 
 
400 aa  296  4e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1474  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.99 
 
 
380 aa  294  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.228942  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3025  putative alcohol dehydrogenase  44.68 
 
 
380 aa  290  3e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1837  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.72 
 
 
389 aa  288  1e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.607752  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0678  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.11 
 
 
388 aa  282  8.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26960  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  43.72 
 
 
372 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.537835  normal  0.314257 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2296  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.6 
 
 
379 aa  280  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06280  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  42.86 
 
 
384 aa  278  9e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4723  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.07 
 
 
387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.592653  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3462  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.05 
 
 
382 aa  272  8.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1573  alcohol dehydrogenase  41.19 
 
 
377 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0561  alcohol dehydrogenase  40.25 
 
 
404 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.324844  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2410  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.67 
 
 
379 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2676  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  40.41 
 
 
379 aa  256  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.976197  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0077  putative glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  42.08 
 
 
378 aa  248  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621151  hitchhiker  0.00187852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3009  alcohol dehydrogenase  39.64 
 
 
379 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479087  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2449  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38 
 
 
417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250445  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.32 
 
 
405 aa  191  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.96 
 
 
392 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0165  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.68 
 
 
389 aa  186  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0122  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.8 
 
 
401 aa  186  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.566245 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.58 
 
 
389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3112  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.152698  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.52 
 
 
387 aa  184  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0139  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.34 
 
 
401 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.6 
 
 
392 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.84 
 
 
384 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.59 
 
 
384 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.46 
 
 
398 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.609837  decreased coverage  0.000185041 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5345  alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
399 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.501465  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3148  alcohol dehydrogenase  36.05 
 
 
382 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.539421  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0774  formaldehyde dehydrogenase  39.93 
 
 
293 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000012543 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.66 
 
 
393 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.33 
 
 
388 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1320  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
384 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106118  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  36.08 
 
 
384 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2149  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.33 
 
 
386 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.406335  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3527  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.28 
 
 
411 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129082  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2984  alcohol dehydrogenase  32.87 
 
 
400 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.29856  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3683  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.3 
 
 
397 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1328  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.79 
 
 
390 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975088  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0160  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.63 
 
 
392 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1016  alcohol dehydrogenase  34.79 
 
 
390 aa  170  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0065  alcohol dehydrogenase  33.65 
 
 
386 aa  171  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.9 
 
 
391 aa  171  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  0.119261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>