More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_1008 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6209  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  80.2 
 
 		 399 aa  639    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0328  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  80.45 
 
 		 399 aa  634    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.225321 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0053  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  92.73 
 
 		 398 aa  759    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.085418 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5061  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  87.97 
 
 		 399 aa  712    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0129321 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0468  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 399 aa  812    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4879  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  81.2 
 
 		 399 aa  639    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5027  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  92.46 
 
 		 398 aa  760    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4126  alcohol dehydrogenase  81.95 
 
 		 399 aa  641    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4824  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  90.95 
 
 		 398 aa  751    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2104  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  99.5 
 
 		 399 aa  810    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0826  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  99.75 
 
 		 399 aa  811    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5202  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  81.45 
 
 		 399 aa  639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0670131 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0564  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  92.21 
 
 		 398 aa  761    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1870  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  96.99 
 
 		 477 aa  777    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1589  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  87.72 
 
 		 399 aa  711    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3278  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  92.71 
 
 		 398 aa  762    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.240401  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0712  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 399 aa  812    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4502  alcohol dehydrogenase  92.46 
 
 		 398 aa  760    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3307  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  89.97 
 
 		 399 aa  744    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71560  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  80.45 
 
 		 399 aa  639    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0738  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  99.75 
 
 		 399 aa  811    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3539  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  94.22 
 
 		 398 aa  771    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.671185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5090  alcohol dehydrogenase  92.71 
 
 		 398 aa  762    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0197015  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1008  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 399 aa  812    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.817957  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5192  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  92.71 
 
 		 398 aa  762    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1981  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 399 aa  812    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0351  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  80.2 
 
 		 399 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0853836  normal  0.45592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0350  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  80.2 
 
 		 399 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4718  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  78.7 
 
 		 399 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3227  alcohol dehydrogenase  77.78 
 
 		 399 aa  618  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.315388 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0455  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  78.28 
 
 		 399 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6435  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  73.68 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00150982 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4487  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  74.37 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.321496  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4039  putative glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  72.01 
 
 		 398 aa  580  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0335  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  72.68 
 
 		 395 aa  580  1e-164  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0139  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  72.04 
 
 		 395 aa  579  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1186  alcohol dehydrogenase  74.87 
 
 		 394 aa  576  1.0000000000000001e-163  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4601  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  71.46 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0995  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  69.02 
 
 		 397 aa  567  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.171586  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3453  formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  72.73 
 
 		 396 aa  564  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000209354  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3959  Formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  69.55 
 
 		 410 aa  558  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0139443  normal  0.927501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3740  hypothetical protein  68.87 
 
 		 408 aa  560  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal  0.0188939 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1013  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  68.72 
 
 		 403 aa  556  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.424822 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0850  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  71.5 
 
 		 397 aa  557  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3060  formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  71.07 
 
 		 397 aa  553  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00702018 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2920  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  67.9 
 
 		 406 aa  548  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.754967  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4986  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  69.36 
 
 		 406 aa  546  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0560  alcohol dehydrogenase  66.91 
 
 		 403 aa  544  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4806  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  68.66 
 
 		 409 aa  544  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.510842  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4421  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  66.67 
 
 		 405 aa  533  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400614  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4302  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  66.67 
 
 		 406 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.271716 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3691  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  66.01 
 
 		 403 aa  509  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04320  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  54.29 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0111  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.39 
 
 		 404 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0147  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  46.02 
 
 		 390 aa  298  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1837  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.96 
 
 		 389 aa  281  1e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.607752  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3025  putative alcohol dehydrogenase  44.3 
 
 		 380 aa  280  3e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0678  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.73 
 
 		 388 aa  279  5e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4723  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.78 
 
 		 387 aa  278  9e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.592653  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26960  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  43.08 
 
 		 372 aa  278  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.537835  normal  0.314257 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1474  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.95 
 
 		 380 aa  276  4e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.228942  normal  0.246435 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09114  hypothetical protein  42.53 
 
 		 400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2296  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.27 
 
 		 379 aa  269  7e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0561  alcohol dehydrogenase  40.49 
 
 		 404 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.324844  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3462  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.58 
 
 		 382 aa  263  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06280  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  41.47 
 
 		 384 aa  261  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0077  putative glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  42.44 
 
 		 378 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621151  hitchhiker  0.00187852 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2410  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.79 
 
 		 379 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2676  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  38.78 
 
 		 379 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.976197  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1573  alcohol dehydrogenase  40.11 
 
 		 377 aa  247  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3009  alcohol dehydrogenase  39.52 
 
 		 379 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479087  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0165  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.26 
 
 		 389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3683  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.22 
 
 		 397 aa  199  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.01 
 
 		 392 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2838  alcohol dehydrogenase, glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  34.11 
 
 		 377 aa  196  9e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.409585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3114  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.85 
 
 		 377 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.99 
 
 		 392 aa  195  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.94 
 
 		 398 aa  195  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.609837  decreased coverage  0.000185041 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.51 
 
 		 388 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0065  alcohol dehydrogenase  35.42 
 
 		 386 aa  195  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.98 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5345  alcohol dehydrogenase  34.66 
 
 		 399 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.501465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.34 
 
 		 387 aa  194  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2912  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.85 
 
 		 377 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.549195  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3131  alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 		 377 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2449  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.18 
 
 		 417 aa  193  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250445  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2124  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.59 
 
 		 377 aa  193  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.770168  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2881  alcohol dehydrogenase, glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  34.11 
 
 		 377 aa  192  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3145  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.85 
 
 		 377 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3133  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.85 
 
 		 377 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0166  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  34.67 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3155  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.11 
 
 		 377 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.633298  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.67 
 
 		 389 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4691  alcohol dehydrogenase  35.38 
 
 		 389 aa  189  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3970  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.15 
 
 		 400 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2300  alcohol dehydrogenase  34.54 
 
 		 388 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  hitchhiker  0.00000777829 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0122  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.09 
 
 		 401 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.566245 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1328  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.58 
 
 		 390 aa  186  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975088  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0139  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.83 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0575  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.09 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>