More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0139 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4601  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  88.32 
 
 
396 aa  715    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0139  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  100 
 
 
395 aa  806    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4039  putative glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  76.88 
 
 
398 aa  632  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0995  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  76.21 
 
 
397 aa  620  1e-176  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.171586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2920  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  74.31 
 
 
406 aa  603  1.0000000000000001e-171  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.754967  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0850  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  77.69 
 
 
397 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3539  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  72.54 
 
 
398 aa  591  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.671185  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3060  formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  76.21 
 
 
397 aa  591  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00702018 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5027  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  71.97 
 
 
398 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441343  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0053  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  72.15 
 
 
398 aa  588  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.085418 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5192  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  71.97 
 
 
398 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371518  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0564  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  71.72 
 
 
398 aa  588  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3278  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  71.97 
 
 
398 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.240401  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4502  alcohol dehydrogenase  71.97 
 
 
398 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3740  hypothetical protein  71.29 
 
 
408 aa  590  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal  0.0188939 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5090  alcohol dehydrogenase  71.97 
 
 
398 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0197015  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4421  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  72.28 
 
 
405 aa  588  1e-167  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400614  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3959  Formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  72.57 
 
 
410 aa  588  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0139443  normal  0.927501 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4986  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  73.27 
 
 
406 aa  584  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4824  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  71.46 
 
 
398 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1013  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  71.53 
 
 
403 aa  584  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.424822 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2104  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  72.54 
 
 
399 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1008  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  72.04 
 
 
399 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.817957  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0738  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  72.29 
 
 
399 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0468  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  72.04 
 
 
399 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0826  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  72.29 
 
 
399 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1981  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  72.04 
 
 
399 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0712  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  72.04 
 
 
399 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4806  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  71.07 
 
 
409 aa  574  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.510842  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3307  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  70.45 
 
 
399 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0560  alcohol dehydrogenase  70.54 
 
 
403 aa  573  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1870  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  72.29 
 
 
477 aa  566  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0455  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  72.22 
 
 
399 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4718  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  72.22 
 
 
399 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3227  alcohol dehydrogenase  71.03 
 
 
399 aa  559  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.315388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4126  alcohol dehydrogenase  71.97 
 
 
399 aa  558  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5202  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  71.21 
 
 
399 aa  552  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0670131 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3691  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  71.29 
 
 
403 aa  551  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5061  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  70.96 
 
 
399 aa  551  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0129321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6209  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  70.45 
 
 
399 aa  551  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71560  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  70.45 
 
 
399 aa  552  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0328  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  70.89 
 
 
399 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.225321 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4879  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  71.76 
 
 
399 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1589  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  70.2 
 
 
399 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152931  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0350  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  70.89 
 
 
399 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0351  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  70.63 
 
 
399 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0853836  normal  0.45592 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4302  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  69.06 
 
 
406 aa  542  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.271716 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6435  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  66.33 
 
 
396 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00150982 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4487  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  66.67 
 
 
396 aa  534  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.321496  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0335  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  67.59 
 
 
395 aa  528  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3453  formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  67.85 
 
 
396 aa  520  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000209354  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1186  alcohol dehydrogenase  68.35 
 
 
394 aa  520  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04320  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  52.79 
 
 
397 aa  403  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0111  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.87 
 
 
404 aa  356  5e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09114  hypothetical protein  46.63 
 
 
400 aa  298  8e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0147  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  43.81 
 
 
390 aa  288  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3025  putative alcohol dehydrogenase  44.65 
 
 
380 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26960  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  44.39 
 
 
372 aa  284  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.537835  normal  0.314257 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1474  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.56 
 
 
380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.228942  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1837  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.46 
 
 
389 aa  273  3e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.607752  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4723  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.66 
 
 
387 aa  271  1e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.592653  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06280  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  46.22 
 
 
384 aa  268  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0678  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.82 
 
 
388 aa  267  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2296  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.71 
 
 
379 aa  266  4e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3462  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.06 
 
 
382 aa  265  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1573  alcohol dehydrogenase  41.16 
 
 
377 aa  255  7e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0561  alcohol dehydrogenase  38.72 
 
 
404 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.324844  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2410  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.43 
 
 
379 aa  246  6e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2676  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  39.65 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.976197  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0077  putative glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  42.51 
 
 
378 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621151  hitchhiker  0.00187852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3009  alcohol dehydrogenase  42.07 
 
 
379 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479087  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2449  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.99 
 
 
417 aa  199  9e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250445  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0165  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.94 
 
 
389 aa  192  7e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0160  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.46 
 
 
392 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.96 
 
 
392 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.13 
 
 
389 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.81 
 
 
388 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.38 
 
 
392 aa  186  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1328  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.6 
 
 
390 aa  186  9e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975088  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.6 
 
 
405 aa  184  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1016  alcohol dehydrogenase  35.34 
 
 
390 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0764  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.08 
 
 
390 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3970  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.68 
 
 
400 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5345  alcohol dehydrogenase  35.08 
 
 
399 aa  182  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.501465  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.48 
 
 
387 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.83 
 
 
398 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.609837  decreased coverage  0.000185041 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3527  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.92 
 
 
411 aa  179  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129082  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.57 
 
 
391 aa  178  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2429  alcohol dehydrogenase  35.15 
 
 
400 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0410446  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1875  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  34.15 
 
 
411 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0065  alcohol dehydrogenase  34.31 
 
 
386 aa  177  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2838  alcohol dehydrogenase, glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  31.68 
 
 
377 aa  176  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.409585  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0122  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.96 
 
 
401 aa  176  7e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.566245 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3114  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.41 
 
 
377 aa  176  9e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00577  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  33.42 
 
 
412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.57 
 
 
384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2912  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.41 
 
 
377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.549195  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3131  alcohol dehydrogenase  31.41 
 
 
377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2149  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.09 
 
 
386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.406335  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3112  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  35 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.152698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>