More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6209 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5027  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  80.15 
 
 		 398 aa  655    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441343  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0328  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  86.47 
 
 		 399 aa  687    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.225321 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1008  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  80.2 
 
 		 399 aa  664    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.817957  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5061  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  79.95 
 
 		 399 aa  638    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0129321 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0053  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  81.95 
 
 		 398 aa  664    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.085418 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0455  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  89.65 
 
 		 399 aa  709    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0468  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  80.2 
 
 		 399 aa  664    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4718  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  89.72 
 
 		 399 aa  714    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3539  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  80.65 
 
 		 398 aa  660    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.671185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4824  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  79.65 
 
 		 398 aa  656    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5192  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  79.9 
 
 		 398 aa  654    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2104  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  80.45 
 
 		 399 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5202  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  88.97 
 
 		 399 aa  704    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0670131 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0564  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  80.15 
 
 		 398 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1870  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  80.2 
 
 		 477 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0826  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  80.45 
 
 		 399 aa  665    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1589  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  80.2 
 
 		 399 aa  641    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3307  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  80.45 
 
 		 399 aa  664    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3227  alcohol dehydrogenase  81.31 
 
 		 399 aa  647    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.315388 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3278  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  79.9 
 
 		 398 aa  654    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.240401  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0351  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  86.22 
 
 		 399 aa  685    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0853836  normal  0.45592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0350  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  86.47 
 
 		 399 aa  687    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0738  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  80.45 
 
 		 399 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4126  alcohol dehydrogenase  87.47 
 
 		 399 aa  697    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1981  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  80.2 
 
 		 399 aa  664    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4502  alcohol dehydrogenase  80.15 
 
 		 398 aa  655    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71560  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  99.75 
 
 		 399 aa  812    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0712  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  80.2 
 
 		 399 aa  664    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5090  alcohol dehydrogenase  79.9 
 
 		 398 aa  654    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0197015  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4879  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  86.72 
 
 		 399 aa  692    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6209  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 399 aa  813    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6435  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  74.05 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00150982 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4487  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  73.54 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.321496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0139  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  70.45 
 
 		 395 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0335  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  72.93 
 
 		 395 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0995  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  70.15 
 
 		 397 aa  571  1.0000000000000001e-162  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.171586  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1186  alcohol dehydrogenase  73.87 
 
 		 394 aa  567  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3453  formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  72.73 
 
 		 396 aa  556  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000209354  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4601  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  70.2 
 
 		 396 aa  553  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4039  putative glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  68.45 
 
 		 398 aa  549  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4806  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  69.73 
 
 		 409 aa  551  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.510842  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3959  Formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  68.07 
 
 		 410 aa  550  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0139443  normal  0.927501 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2920  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  68.81 
 
 		 406 aa  543  1e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.754967  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1013  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  67.66 
 
 		 403 aa  538  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.424822 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4986  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  68.38 
 
 		 406 aa  540  9.999999999999999e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3740  hypothetical protein  66.67 
 
 		 408 aa  535  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal  0.0188939 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0850  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  70.41 
 
 		 397 aa  536  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0560  alcohol dehydrogenase  67.16 
 
 		 403 aa  537  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3060  formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  70.15 
 
 		 397 aa  536  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00702018 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4421  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  66.58 
 
 		 405 aa  533  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400614  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3691  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  67.41 
 
 		 403 aa  511  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4302  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  65.43 
 
 		 406 aa  502  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.271716 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04320  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  52.53 
 
 		 397 aa  392  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0111  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.72 
 
 		 404 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1474  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.17 
 
 		 380 aa  299  5e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.228942  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3025  putative alcohol dehydrogenase  46.68 
 
 		 380 aa  297  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0147  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  45.9 
 
 		 390 aa  296  4e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26960  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  45.88 
 
 		 372 aa  291  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.537835  normal  0.314257 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09114  hypothetical protein  44.05 
 
 		 400 aa  290  4e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1837  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.59 
 
 		 389 aa  287  2e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.607752  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3462  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.27 
 
 		 382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2296  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.94 
 
 		 379 aa  280  4e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4723  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.9 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.592653  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2410  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.06 
 
 		 379 aa  277  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0678  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.44 
 
 		 388 aa  276  4e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2676  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  43.54 
 
 		 379 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.976197  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06280  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  42.86 
 
 		 384 aa  272  9e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0561  alcohol dehydrogenase  42.22 
 
 		 404 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.324844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0077  putative glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  44.83 
 
 		 378 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621151  hitchhiker  0.00187852 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1573  alcohol dehydrogenase  42.48 
 
 		 377 aa  262  8.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3009  alcohol dehydrogenase  42.74 
 
 		 379 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479087  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2449  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.74 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250445  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0165  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.77 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.68 
 
 		 387 aa  204  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2149  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.5 
 
 		 386 aa  202  9e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.406335  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3970  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.77 
 
 		 400 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3527  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.82 
 
 		 411 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129082  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1875  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  36.02 
 
 		 411 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2429  alcohol dehydrogenase  35.52 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0410446  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3112  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  37.28 
 
 		 388 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.152698  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1441  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.86 
 
 		 390 aa  193  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.42991 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2481  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.48 
 
 		 387 aa  193  5e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.25 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0122  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.25 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.566245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2984  alcohol dehydrogenase  34.16 
 
 		 400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.29856  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.51 
 
 		 392 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0139  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35 
 
 		 401 aa  189  9e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0065  alcohol dehydrogenase  34.88 
 
 		 386 aa  188  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1328  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.34 
 
 		 390 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975088  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5345  alcohol dehydrogenase  35.2 
 
 		 399 aa  187  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.501465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2641  alcohol dehydrogenase  34.92 
 
 		 396 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0246923  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3683  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.67 
 
 		 397 aa  187  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.84 
 
 		 405 aa  186  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1016  alcohol dehydrogenase  34.09 
 
 		 390 aa  186  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0764  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.09 
 
 		 390 aa  186  7e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.5 
 
 		 388 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.34 
 
 		 398 aa  186  7e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.609837  decreased coverage  0.000185041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2300  alcohol dehydrogenase  35.84 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  hitchhiker  0.00000777829 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3016  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.51 
 
 		 412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665749  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00566  hypothetical protein  34.51 
 
 		 412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>