More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4986 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3691  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  81.64 
 
 
403 aa  655    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4986  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  100 
 
 
406 aa  828    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3740  hypothetical protein  82.76 
 
 
408 aa  697    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal  0.0188939 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4806  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  80.75 
 
 
409 aa  672    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.510842  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3959  Formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  81.14 
 
 
410 aa  682    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0139443  normal  0.927501 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1013  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  81.39 
 
 
403 aa  677    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.424822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4421  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  76.92 
 
 
405 aa  651    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400614  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0560  alcohol dehydrogenase  80.89 
 
 
403 aa  676    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2920  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  79.6 
 
 
406 aa  664    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.754967  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4302  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  76.67 
 
 
406 aa  629  1e-179  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.271716 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0139  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  73.27 
 
 
395 aa  608  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4601  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  72.84 
 
 
396 aa  605  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4039  putative glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  71.64 
 
 
398 aa  591  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0995  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  71.22 
 
 
397 aa  585  1e-166  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.171586  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3539  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  69.78 
 
 
398 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.671185  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5027  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  69.78 
 
 
398 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441343  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0564  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  69.53 
 
 
398 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3278  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  69.78 
 
 
398 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.240401  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4502  alcohol dehydrogenase  69.78 
 
 
398 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5090  alcohol dehydrogenase  69.78 
 
 
398 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0197015  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5192  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  69.78 
 
 
398 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371518  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0468  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  69.36 
 
 
399 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0738  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  69.61 
 
 
399 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0826  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  69.61 
 
 
399 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2104  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  69.36 
 
 
399 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1008  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  69.36 
 
 
399 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.817957  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0712  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  69.36 
 
 
399 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1981  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  69.36 
 
 
399 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0053  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  68.8 
 
 
398 aa  565  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.085418 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3307  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  68.87 
 
 
399 aa  559  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4824  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  68.06 
 
 
398 aa  560  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1870  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  69.36 
 
 
477 aa  551  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0850  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  69.92 
 
 
397 aa  551  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3060  formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  70.82 
 
 
397 aa  553  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00702018 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6435  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  67.32 
 
 
396 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00150982 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4487  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  66.58 
 
 
396 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.321496  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5202  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  69.36 
 
 
399 aa  545  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0670131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0328  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  69.36 
 
 
399 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.225321 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1589  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  68.87 
 
 
399 aa  541  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152931  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0335  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  67.08 
 
 
395 aa  542  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4879  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  69.36 
 
 
399 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0350  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  69.36 
 
 
399 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4126  alcohol dehydrogenase  69.36 
 
 
399 aa  543  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0351  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  69.36 
 
 
399 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0853836  normal  0.45592 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0455  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  69.14 
 
 
399 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4718  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  68.87 
 
 
399 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5061  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  68.38 
 
 
399 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0129321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6209  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  68.38 
 
 
399 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71560  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  68.14 
 
 
399 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1186  alcohol dehydrogenase  68.72 
 
 
394 aa  538  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3227  alcohol dehydrogenase  69.38 
 
 
399 aa  537  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.315388 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3453  formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  66.83 
 
 
396 aa  521  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000209354  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04320  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  52.24 
 
 
397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0111  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.99 
 
 
404 aa  358  8e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0147  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  45.12 
 
 
390 aa  310  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09114  hypothetical protein  44.36 
 
 
400 aa  299  5e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3025  putative alcohol dehydrogenase  45.19 
 
 
380 aa  299  6e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1474  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.37 
 
 
380 aa  299  7e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.228942  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4723  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.15 
 
 
387 aa  294  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.592653  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26960  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  45.69 
 
 
372 aa  293  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.537835  normal  0.314257 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1837  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.77 
 
 
389 aa  289  5.0000000000000004e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.607752  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2296  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  42.71 
 
 
379 aa  289  8e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0678  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.95 
 
 
388 aa  285  9e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3462  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.71 
 
 
382 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0561  alcohol dehydrogenase  41.75 
 
 
404 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.324844  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06280  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  43.75 
 
 
384 aa  272  6e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1573  alcohol dehydrogenase  42.12 
 
 
377 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2676  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  40.75 
 
 
379 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.976197  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0077  putative glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  42.6 
 
 
378 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621151  hitchhiker  0.00187852 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2410  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.04 
 
 
379 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3009  alcohol dehydrogenase  40.52 
 
 
379 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479087  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2449  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.13 
 
 
417 aa  232  7.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250445  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.48 
 
 
389 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.25 
 
 
392 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0165  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.38 
 
 
389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.21 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.26 
 
 
388 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5345  alcohol dehydrogenase  33.97 
 
 
399 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.501465  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.4 
 
 
405 aa  182  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0122  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.75 
 
 
401 aa  179  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.566245 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0714  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.18 
 
 
412 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0655  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.94 
 
 
412 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2149  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.07 
 
 
386 aa  179  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.406335  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0669  alcohol dehydrogenase GroES-like domain protein  32.94 
 
 
412 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432264  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2429  alcohol dehydrogenase  35.68 
 
 
400 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0410446  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0728  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase (glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase) (fdh) (faldh)  32.94 
 
 
412 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0160  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.02 
 
 
392 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0774  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase (glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase) (fdh) (faldh)  32.94 
 
 
412 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3970  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.24 
 
 
400 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0139  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.68 
 
 
401 aa  177  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3527  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.71 
 
 
411 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129082  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  34.31 
 
 
384 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.96 
 
 
393 aa  176  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00577  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  32.7 
 
 
412 aa  176  7e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3112  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  37.34 
 
 
388 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.152698  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0065  alcohol dehydrogenase  33.49 
 
 
386 aa  176  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00566  hypothetical protein  32.7 
 
 
412 aa  176  7e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3016  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.7 
 
 
412 aa  176  8e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3035  alcohol dehydrogenase  32.7 
 
 
412 aa  176  8e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.76 
 
 
392 aa  176  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>