More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5090 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1008  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  92.71 
 
 
399 aa  762    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.817957  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0053  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  92.21 
 
 
398 aa  754    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.085418 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0468  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  92.71 
 
 
399 aa  762    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5061  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  88.94 
 
 
399 aa  709    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0129321 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0712  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  92.71 
 
 
399 aa  762    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4824  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  91.96 
 
 
398 aa  756    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3539  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  96.98 
 
 
398 aa  792    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.671185  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2104  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  92.71 
 
 
399 aa  763    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0564  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  99.5 
 
 
398 aa  810    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1870  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  93.22 
 
 
477 aa  747    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5192  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  100 
 
 
398 aa  812    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371518  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1589  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  88.44 
 
 
399 aa  709    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152931  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0826  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  92.96 
 
 
399 aa  764    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3227  alcohol dehydrogenase  79.8 
 
 
399 aa  637    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.315388 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3278  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  100 
 
 
398 aa  812    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.240401  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5027  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  99.25 
 
 
398 aa  806    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441343  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1981  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  92.71 
 
 
399 aa  762    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4502  alcohol dehydrogenase  99.25 
 
 
398 aa  806    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3307  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  88.69 
 
 
399 aa  730    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0738  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  92.96 
 
 
399 aa  764    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5090  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
398 aa  812    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0197015  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5202  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  80.4 
 
 
399 aa  632  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0670131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6209  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  79.9 
 
 
399 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71560  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  79.65 
 
 
399 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4879  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  79.4 
 
 
399 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4126  alcohol dehydrogenase  79.4 
 
 
399 aa  626  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0328  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  78.39 
 
 
399 aa  621  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.225321 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0351  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  78.14 
 
 
399 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0853836  normal  0.45592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0350  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  78.14 
 
 
399 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4718  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  77.64 
 
 
399 aa  609  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0455  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  77.27 
 
 
399 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0139  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  71.97 
 
 
395 aa  589  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6435  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  72.29 
 
 
396 aa  587  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00150982 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4039  putative glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  72.01 
 
 
398 aa  587  1e-166  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4601  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  71.97 
 
 
396 aa  585  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4487  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  72.54 
 
 
396 aa  585  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.321496  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0335  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  72.86 
 
 
395 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1186  alcohol dehydrogenase  74.62 
 
 
394 aa  580  1e-164  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3959  Formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  71.04 
 
 
410 aa  571  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0139443  normal  0.927501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3740  hypothetical protein  69.88 
 
 
408 aa  564  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal  0.0188939 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0995  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  68.26 
 
 
397 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.171586  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3453  formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  72.29 
 
 
396 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000209354  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2920  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  68.89 
 
 
406 aa  559  1e-158  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.754967  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1013  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  68.72 
 
 
403 aa  557  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.424822 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4986  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  69.78 
 
 
406 aa  551  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0850  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  70.74 
 
 
397 aa  550  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0560  alcohol dehydrogenase  67.98 
 
 
403 aa  550  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4806  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  68.91 
 
 
409 aa  549  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.510842  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3060  formaldehyde dehydrogenase glutathione-independent  69.87 
 
 
397 aa  546  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00702018 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4421  formaldehyde dehydrogenase, glutathione- independent  66.75 
 
 
405 aa  536  1e-151  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400614  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4302  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  67.9 
 
 
406 aa  528  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.271716 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3691  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  66.17 
 
 
403 aa  513  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04320  formaldehyde dehydrogenase, glutathione-independent  56.17 
 
 
397 aa  426  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0111  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.73 
 
 
404 aa  358  9e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0147  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  47.18 
 
 
390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26960  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  43.59 
 
 
372 aa  286  4e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.537835  normal  0.314257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3025  putative alcohol dehydrogenase  44.56 
 
 
380 aa  286  5e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1837  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.19 
 
 
389 aa  285  9e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.607752  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0678  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.99 
 
 
388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09114  hypothetical protein  43.04 
 
 
400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4723  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.08 
 
 
387 aa  281  2e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.592653  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1474  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.48 
 
 
380 aa  280  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.228942  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2296  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.91 
 
 
379 aa  273  3e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0561  alcohol dehydrogenase  40.99 
 
 
404 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.324844  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3462  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.84 
 
 
382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06280  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  44.64 
 
 
384 aa  265  8e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0077  putative glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  43.5 
 
 
378 aa  259  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621151  hitchhiker  0.00187852 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2410  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.26 
 
 
379 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2676  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  38.99 
 
 
379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.976197  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1573  alcohol dehydrogenase  41.16 
 
 
377 aa  252  7e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3009  alcohol dehydrogenase  39.79 
 
 
379 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479087  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0165  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.01 
 
 
389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.26 
 
 
392 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2449  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.92 
 
 
417 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250445  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0065  alcohol dehydrogenase  35.9 
 
 
386 aa  196  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.17 
 
 
398 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.609837  decreased coverage  0.000185041 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.27 
 
 
405 aa  196  5.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.89 
 
 
392 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5345  alcohol dehydrogenase  34.91 
 
 
399 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.501465  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.75 
 
 
389 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.45 
 
 
387 aa  192  8e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3683  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.73 
 
 
397 aa  192  8e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0166  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  35.5 
 
 
395 aa  192  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912922  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.51 
 
 
388 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4498  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.92 
 
 
389 aa  189  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3970  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.52 
 
 
400 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0122  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.76 
 
 
401 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.566245 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2838  alcohol dehydrogenase, glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  31.74 
 
 
377 aa  187  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.409585  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2482  putative zinc-containing dehydrogenase  35.85 
 
 
389 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3114  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.49 
 
 
377 aa  186  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2300  alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  hitchhiker  0.00000777829 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2912  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.49 
 
 
377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.549195  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1328  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.92 
 
 
390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975088  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3131  alcohol dehydrogenase  31.49 
 
 
377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3112  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  35.61 
 
 
388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.152698  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0575  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.34 
 
 
389 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2124  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.23 
 
 
377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.770168  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4691  alcohol dehydrogenase  35.58 
 
 
389 aa  184  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6253  alcohol dehydrogenase  34.5 
 
 
391 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.731237 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0139  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.26 
 
 
401 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>