More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_16630 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_16630  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  100 
 
 
349 aa  703    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2144  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  70.77 
 
 
349 aa  463  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.862427  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06010  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  63.92 
 
 
351 aa  410  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2673  alcohol dehydrogenase  59.89 
 
 
338 aa  398  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0477  alcohol dehydrogenase  59.54 
 
 
351 aa  389  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3360  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.73 
 
 
338 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0831  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.3 
 
 
340 aa  383  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151744  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1970  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.57 
 
 
341 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2100  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.87 
 
 
340 aa  375  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2284  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  55.3 
 
 
338 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.399136 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.73 
 
 
338 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0165  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.27 
 
 
347 aa  358  7e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2717  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.3 
 
 
341 aa  358  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0185  alcohol dehydrogenase  54.15 
 
 
340 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1473  alcohol dehydrogenase  53.3 
 
 
340 aa  355  5e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.308593  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2318  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.02 
 
 
338 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.263931  normal  0.648846 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.36 
 
 
353 aa  352  7e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1032  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.02 
 
 
344 aa  342  4e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3625  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  51.73 
 
 
340 aa  332  7.000000000000001e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698872  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1854  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.69 
 
 
348 aa  330  2e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0265  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.59 
 
 
345 aa  328  6e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0894063  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2438  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.69 
 
 
347 aa  327  3e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.931486  hitchhiker  0.00356491 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04280  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  51.3 
 
 
340 aa  325  8.000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0215  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.98 
 
 
346 aa  322  6e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0696766 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4121  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.14 
 
 
345 aa  311  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.991808 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0624  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  49.12 
 
 
338 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20300  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  48.43 
 
 
340 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22800  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  47.56 
 
 
339 aa  298  9e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0184  alcohol dehydrogenase  46.7 
 
 
338 aa  298  9e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3749  alcohol dehydrogenase  50.71 
 
 
345 aa  297  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0844  threonine dehydrogenase  45.04 
 
 
347 aa  290  2e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.97 
 
 
345 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1589  alcohol dehydrogenase  44.32 
 
 
351 aa  280  2e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0949  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  44.44 
 
 
345 aa  267  2e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0171372  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1641  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  44.05 
 
 
326 aa  265  1e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 
422 aa  202  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  37.98 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  37.98 
 
 
346 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0592  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.74 
 
 
401 aa  195  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5892  alcohol dehydrogenase  36.8 
 
 
346 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032769  normal  0.939128 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2366  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.58 
 
 
347 aa  192  6e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.0010665  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2300  alcohol dehydrogenase  35.37 
 
 
388 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  hitchhiker  0.00000777829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3112  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 
388 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.152698  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2296  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.6 
 
 
379 aa  189  5.999999999999999e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.5 
 
 
410 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4441  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.77 
 
 
384 aa  186  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204388  normal  0.287337 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1334  alcohol dehydrogenase  35.13 
 
 
344 aa  186  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0194  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  35.01 
 
 
345 aa  186  8e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3462  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.64 
 
 
382 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36660  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  33.85 
 
 
415 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000975221  normal  0.705006 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.42 
 
 
389 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.1 
 
 
385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  hitchhiker  0.00205277 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4753  alcohol dehydrogenase  31.94 
 
 
402 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209038  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3104  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  33.08 
 
 
394 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.345929  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1860  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.01 
 
 
346 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3833  alcohol dehydrogenase  33.08 
 
 
394 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24597  normal  0.375314 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5564  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.31 
 
 
346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175264  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.4 
 
 
392 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 
415 aa  182  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26960  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  35.54 
 
 
372 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.537835  normal  0.314257 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.75 
 
 
410 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.29 
 
 
382 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4017  alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 
382 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.530875 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3025  putative alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 
380 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5660  alcohol dehydrogenase  32.66 
 
 
401 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24840  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  32.76 
 
 
444 aa  180  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3663  hypothetical protein  32.83 
 
 
394 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184617  normal  0.501234 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2034  hypothetical protein  33.04 
 
 
346 aa  179  7e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3669  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.94 
 
 
386 aa  179  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.949441  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1246  zinc-type alcohol dehydrogenase  32.31 
 
 
385 aa  179  8e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.939827  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2149  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.84 
 
 
386 aa  178  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.406335  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.31 
 
 
385 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1392  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.15 
 
 
401 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5561  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.57 
 
 
389 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210102  normal  0.0249106 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6437  alcohol dehydrogenase  32.15 
 
 
401 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.632433  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1142  alcohol dehydrogenase  32.43 
 
 
417 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.517956  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6027  alcohol dehydrogenase  32.15 
 
 
401 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2760  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.43 
 
 
425 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.55 
 
 
387 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3075  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.42 
 
 
347 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2124  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.32 
 
 
377 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.770168  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2916  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  32.43 
 
 
492 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843639  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1221  alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 
343 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.65 
 
 
388 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0122  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.4 
 
 
401 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.566245 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3368  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.51 
 
 
384 aa  176  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.58 
 
 
384 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4415  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.42 
 
 
345 aa  176  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4548  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.42 
 
 
355 aa  176  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00643704 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3114  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.15 
 
 
377 aa  175  8e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0720  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.67 
 
 
389 aa  175  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00145968  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08406  Alcohol dehydrogenase (Eurofung)  32.39 
 
 
350 aa  175  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3657  alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 
347 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal  0.2926 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0165  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.38 
 
 
389 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0322  alcohol dehydrogenase  34.28 
 
 
347 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.65143  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3145  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.15 
 
 
377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2838  alcohol dehydrogenase, glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  31.15 
 
 
377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.409585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3133  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.15 
 
 
377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.82 
 
 
346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.46 
 
 
393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>