More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1641 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1641  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  100 
 
 
326 aa  662    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  60.24 
 
 
345 aa  412  1e-114  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0844  threonine dehydrogenase  58.13 
 
 
347 aa  384  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1589  alcohol dehydrogenase  54.88 
 
 
351 aa  369  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0949  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  54.1 
 
 
345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0171372  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2673  alcohol dehydrogenase  50.15 
 
 
338 aa  300  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06010  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  46.43 
 
 
351 aa  279  5e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0831  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.26 
 
 
340 aa  278  9e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151744  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0624  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  47.52 
 
 
338 aa  275  6e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1854  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.82 
 
 
348 aa  268  1e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0215  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.36 
 
 
346 aa  267  2e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0696766 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2284  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.9 
 
 
338 aa  265  5.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.399136 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2438  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.62 
 
 
347 aa  265  1e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.931486  hitchhiker  0.00356491 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16630  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  44.05 
 
 
349 aa  265  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3360  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.81 
 
 
338 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3625  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  46.88 
 
 
340 aa  258  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698872  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0165  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.28 
 
 
347 aa  256  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2100  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.87 
 
 
340 aa  253  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0477  alcohol dehydrogenase  47.38 
 
 
351 aa  253  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22800  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  45.09 
 
 
339 aa  252  7e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0265  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.02 
 
 
345 aa  252  7e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0894063  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.71 
 
 
338 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1970  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.12 
 
 
341 aa  248  8e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2717  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.73 
 
 
341 aa  248  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04280  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  44.04 
 
 
340 aa  245  9e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1473  alcohol dehydrogenase  42.64 
 
 
340 aa  240  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.308593  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1032  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.92 
 
 
344 aa  239  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.09 
 
 
353 aa  237  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20300  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  44.04 
 
 
340 aa  233  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2144  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.88 
 
 
349 aa  229  7e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.862427  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3749  alcohol dehydrogenase  43.64 
 
 
345 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2318  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.3 
 
 
338 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.263931  normal  0.648846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0184  alcohol dehydrogenase  39.76 
 
 
338 aa  225  9e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4121  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.81 
 
 
345 aa  224  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.991808 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0185  alcohol dehydrogenase  39.76 
 
 
340 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2366  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.93 
 
 
347 aa  188  8e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.0010665  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.63 
 
 
346 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1860  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.33 
 
 
346 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  31.33 
 
 
346 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  31.63 
 
 
346 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5892  alcohol dehydrogenase  31.85 
 
 
346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032769  normal  0.939128 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  34.07 
 
 
422 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3657  alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 
347 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal  0.2926 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.34 
 
 
351 aa  171  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000634163  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24840  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  37.13 
 
 
444 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1334  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
344 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26960  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  33.81 
 
 
372 aa  169  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.537835  normal  0.314257 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1221  alcohol dehydrogenase  34.03 
 
 
343 aa  169  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32 
 
 
405 aa  169  8e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0924  putative zinc-dependent alcohol dehydrogenase (oxidoreductase)  31.85 
 
 
345 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.175832  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1928  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.85 
 
 
370 aa  166  5e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.04 
 
 
345 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0642635 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5564  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.14 
 
 
346 aa  165  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175264  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0203  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.92 
 
 
357 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0325811 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2137  alcohol dehydrogenase  31.18 
 
 
351 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0423941 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3075  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.33 
 
 
347 aa  163  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.93 
 
 
346 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.539752  normal  0.655263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 
415 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2449  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.33 
 
 
417 aa  162  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250445  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36660  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  31.4 
 
 
415 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000975221  normal  0.705006 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3155  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.4 
 
 
377 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.633298  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0322  alcohol dehydrogenase  31.33 
 
 
347 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.65143  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3025  putative alcohol dehydrogenase  32.22 
 
 
380 aa  160  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1091  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.4 
 
 
342 aa  160  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2034  hypothetical protein  31.14 
 
 
346 aa  159  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1474  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.96 
 
 
380 aa  159  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.228942  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2838  alcohol dehydrogenase, glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  32.12 
 
 
377 aa  159  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.409585  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5816  alcohol dehydrogenase  29.52 
 
 
346 aa  159  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.136095 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2881  alcohol dehydrogenase, glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  32.12 
 
 
377 aa  158  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3346  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.33 
 
 
357 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1073  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.02 
 
 
351 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1089  alcohol dehydrogenase  31.02 
 
 
351 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25524  normal  0.164937 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0194  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  30.65 
 
 
345 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2912  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.13 
 
 
377 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.549195  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3131  alcohol dehydrogenase  32.13 
 
 
377 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2296  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.3 
 
 
379 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4901  alcohol dehydrogenase  31.33 
 
 
360 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0669  alcohol dehydrogenase  32.15 
 
 
374 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.704397  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3114  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.86 
 
 
377 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.66 
 
 
389 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3145  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.86 
 
 
377 aa  155  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3462  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.36 
 
 
382 aa  155  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1565  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.36 
 
 
349 aa  155  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.965017  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3962  alcohol dehydrogenase  32.2 
 
 
351 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5217  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.11 
 
 
384 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4498  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.82 
 
 
389 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0122  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.61 
 
 
401 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.566245 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3133  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.58 
 
 
377 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4548  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.38 
 
 
355 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00643704 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1380  alcohol dehydrogenase  32.39 
 
 
348 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378076  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4415  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.38 
 
 
345 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1234  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.36 
 
 
346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0709  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.36 
 
 
346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470076  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2432  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.36 
 
 
346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0753  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.36 
 
 
346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574599  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1718  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.36 
 
 
346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1160  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.36 
 
 
346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5561  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.76 
 
 
389 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210102  normal  0.0249106 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2124  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.02 
 
 
377 aa  152  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.770168  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  32.15 
 
 
384 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>