More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0265 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0265  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
345 aa  679    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0894063  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16630  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  57.59 
 
 
349 aa  363  2e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0165  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.07 
 
 
347 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0844  threonine dehydrogenase  53.03 
 
 
347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06010  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  56.57 
 
 
351 aa  339  2.9999999999999998e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2673  alcohol dehydrogenase  56.4 
 
 
338 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0477  alcohol dehydrogenase  57.59 
 
 
351 aa  335  9e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3360  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.9 
 
 
338 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2284  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.31 
 
 
338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.399136 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0624  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  55.09 
 
 
338 aa  318  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2100  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.9 
 
 
340 aa  314  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0831  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.42 
 
 
340 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151744  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.13 
 
 
345 aa  310  2e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1854  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.31 
 
 
348 aa  310  2e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2438  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.3 
 
 
347 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.931486  hitchhiker  0.00356491 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2717  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.85 
 
 
341 aa  306  3e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1032  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.4 
 
 
344 aa  304  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0215  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.3 
 
 
346 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0696766 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1589  alcohol dehydrogenase  47.55 
 
 
351 aa  303  4.0000000000000003e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22800  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  48.84 
 
 
339 aa  301  1e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.9 
 
 
338 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3625  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  49.55 
 
 
340 aa  299  6e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698872  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1970  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.27 
 
 
341 aa  297  2e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04280  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  50.44 
 
 
340 aa  294  1e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2144  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.3 
 
 
349 aa  294  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.862427  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1641  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  49.54 
 
 
326 aa  293  2e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2318  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.67 
 
 
338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.263931  normal  0.648846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4121  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.43 
 
 
345 aa  286  4e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.991808 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20300  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  49.86 
 
 
340 aa  280  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0185  alcohol dehydrogenase  47.08 
 
 
340 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1473  alcohol dehydrogenase  45.91 
 
 
340 aa  273  3e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.308593  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3749  alcohol dehydrogenase  49.86 
 
 
345 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0184  alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 
338 aa  264  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.56 
 
 
353 aa  260  3e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0949  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  43.48 
 
 
345 aa  258  1e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0171372  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
346 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  37.22 
 
 
346 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1860  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.83 
 
 
346 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5892  alcohol dehydrogenase  37.84 
 
 
346 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032769  normal  0.939128 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5564  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.11 
 
 
346 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175264  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0924  putative zinc-dependent alcohol dehydrogenase (oxidoreductase)  37.2 
 
 
345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.175832  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5816  alcohol dehydrogenase  35.51 
 
 
346 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.136095 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0194  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  35.24 
 
 
345 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.95 
 
 
346 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.539752  normal  0.655263 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1565  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.44 
 
 
349 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.965017  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1334  alcohol dehydrogenase  34.96 
 
 
344 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3657  alcohol dehydrogenase  34.19 
 
 
347 aa  176  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal  0.2926 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  33.68 
 
 
384 aa  175  8e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2034  hypothetical protein  32.39 
 
 
346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3669  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.97 
 
 
386 aa  173  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.949441  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0709  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.59 
 
 
346 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470076  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1160  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.59 
 
 
346 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0753  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.59 
 
 
346 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574599  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2432  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.59 
 
 
346 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.71 
 
 
345 aa  172  9e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0642635 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1718  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.59 
 
 
346 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1234  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.59 
 
 
346 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.29 
 
 
346 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08406  Alcohol dehydrogenase (Eurofung)  31.53 
 
 
350 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0322  alcohol dehydrogenase  34 
 
 
347 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.65143  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4548  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.38 
 
 
355 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00643704 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4415  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.38 
 
 
345 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5217  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.9 
 
 
384 aa  169  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.75 
 
 
410 aa  169  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2366  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.1 
 
 
347 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.0010665  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2137  alcohol dehydrogenase  35.39 
 
 
351 aa  168  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0423941 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3075  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.51 
 
 
347 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4441  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.76 
 
 
384 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204388  normal  0.287337 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36660  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  33.95 
 
 
415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000975221  normal  0.705006 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1928  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.13 
 
 
370 aa  167  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 
422 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  32.89 
 
 
415 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1221  alcohol dehydrogenase  32.66 
 
 
343 aa  166  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.75 
 
 
410 aa  166  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1091  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.71 
 
 
342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2449  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.05 
 
 
417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250445  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4017  alcohol dehydrogenase  31.18 
 
 
382 aa  164  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.530875 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3025  putative alcohol dehydrogenase  32.61 
 
 
380 aa  164  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1246  zinc-type alcohol dehydrogenase  30.93 
 
 
385 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.939827  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.78 
 
 
384 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.71 
 
 
382 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.12 
 
 
389 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0265  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.99 
 
 
371 aa  161  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.901967  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3368  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.55 
 
 
384 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.51 
 
 
384 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1507  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.06 
 
 
382 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.25 
 
 
387 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4753  alcohol dehydrogenase  31.57 
 
 
402 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209038  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2300  alcohol dehydrogenase  34.44 
 
 
388 aa  160  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  hitchhiker  0.00000777829 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5660  alcohol dehydrogenase  33.92 
 
 
401 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2429  alcohol dehydrogenase  32.72 
 
 
400 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0410446  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3527  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.81 
 
 
411 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129082  normal  0.366185 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04540  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02810)  32.19 
 
 
355 aa  158  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.825375 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26960  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  34.06 
 
 
372 aa  158  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.537835  normal  0.314257 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2760  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  33.08 
 
 
425 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2916  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  33.08 
 
 
492 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843639  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.41 
 
 
385 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  hitchhiker  0.00205277 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1142  alcohol dehydrogenase  33.08 
 
 
417 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.517956  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1392  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.18 
 
 
401 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6437  alcohol dehydrogenase  34.18 
 
 
401 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.632433  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>