More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0764 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0764  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  722    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0197136 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0653  alcohol dehydrogenase  66.95 
 
 
352 aa  486  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1228  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  66.67 
 
 
352 aa  486  1e-136  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.966969 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2344  alcohol dehydrogenase (NADP+)  64.39 
 
 
352 aa  476  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100089  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1378  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  64.87 
 
 
352 aa  459  9.999999999999999e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2770  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.22 
 
 
356 aa  409  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1415  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.01 
 
 
352 aa  380  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.275014  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1399  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.13 
 
 
352 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0435  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.43 
 
 
351 aa  329  4e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.692768  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0548  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.3 
 
 
350 aa  303  4.0000000000000003e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0899798  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.71 
 
 
349 aa  295  8e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.228893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4352  alcohol dehydrogenase  44.48 
 
 
354 aa  281  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3460  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.45 
 
 
354 aa  255  7e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00073426  hitchhiker  0.00463895 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.73 
 
 
354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2240  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.09 
 
 
355 aa  253  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0360217 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0203  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.71 
 
 
357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0325811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3188  alcohol dehydrogenase  34.07 
 
 
366 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3346  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.13 
 
 
357 aa  209  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0967  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.89 
 
 
366 aa  206  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.635093  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1049  alcohol dehydrogenase  34.89 
 
 
366 aa  206  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.050805 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5645  alcohol dehydrogenase  36.49 
 
 
357 aa  206  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.419975 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1356  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  34.34 
 
 
366 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2008  alcohol dehydrogenase protein  33.52 
 
 
364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07420  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  35.76 
 
 
357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2536  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.63 
 
 
357 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.563542  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3032  alcohol dehydrogenase  35.67 
 
 
357 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3465  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.52 
 
 
366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.901244  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0669  alcohol dehydrogenase  35.67 
 
 
374 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.704397  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3514  alcohol dehydrogenase  35.63 
 
 
373 aa  196  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0265  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.09 
 
 
371 aa  192  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.901967  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3852  alcohol dehydrogenase  32.14 
 
 
365 aa  192  9e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2137  alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 
351 aa  190  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0423941 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2064  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 
357 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2090  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.22 
 
 
351 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000167964 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3962  alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 
351 aa  152  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.65 
 
 
346 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3075  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.93 
 
 
347 aa  139  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4901  alcohol dehydrogenase  32.26 
 
 
360 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0322  alcohol dehydrogenase  32.52 
 
 
347 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.65143  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1091  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.14 
 
 
342 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  31.29 
 
 
352 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.72 
 
 
351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000634163  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2366  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.98 
 
 
347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.0010665  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1073  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.75 
 
 
351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1089  alcohol dehydrogenase  33.75 
 
 
351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25524  normal  0.164937 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0219  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.46 
 
 
350 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5892  alcohol dehydrogenase  29.17 
 
 
346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032769  normal  0.939128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.71 
 
 
346 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.539752  normal  0.655263 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  29.25 
 
 
346 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.69 
 
 
393 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0010  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.94 
 
 
346 aa  126  7e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.133832  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1221  alcohol dehydrogenase  30.45 
 
 
343 aa  126  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0924  putative zinc-dependent alcohol dehydrogenase (oxidoreductase)  30.77 
 
 
345 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.175832  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1334  alcohol dehydrogenase  28.61 
 
 
344 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3881  alcohol dehydrogenase  28.07 
 
 
391 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0212673 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  28.96 
 
 
346 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1380  alcohol dehydrogenase  31.86 
 
 
348 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378076  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3657  alcohol dehydrogenase  31.04 
 
 
347 aa  123  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal  0.2926 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5564  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.53 
 
 
346 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175264  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1641  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  32.62 
 
 
326 aa  123  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1100  alcohol dehydrogenase  36.55 
 
 
299 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0318515  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0592  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.33 
 
 
401 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2034  hypothetical protein  29.9 
 
 
346 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2916  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.52 
 
 
492 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843639  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1142  alcohol dehydrogenase  36.52 
 
 
417 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.517956  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4997  alcohol dehydrogenase  31.86 
 
 
348 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2760  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  36.52 
 
 
425 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.16 
 
 
405 aa  120  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1328  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.6 
 
 
390 aa  119  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975088  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3239  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  30.23 
 
 
356 aa  119  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.81 
 
 
410 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0194  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  29.97 
 
 
345 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4753  alcohol dehydrogenase  34.48 
 
 
402 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209038  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.04 
 
 
345 aa  116  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0642635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3625  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  33.06 
 
 
340 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698872  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1755  alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
403 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  29.09 
 
 
422 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.84 
 
 
382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4893  alcohol dehydrogenase  30.28 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709624  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5660  alcohol dehydrogenase  36.63 
 
 
401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5816  alcohol dehydrogenase  28.83 
 
 
346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.136095 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1016  alcohol dehydrogenase  27.6 
 
 
390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3148  alcohol dehydrogenase  28.08 
 
 
382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.539421  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0764  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.67 
 
 
390 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  33.2 
 
 
415 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0165  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.64 
 
 
389 aa  113  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1928  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.48 
 
 
370 aa  113  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2676  glutathione-independent formaldehyde dehydrogenase  36.28 
 
 
379 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.976197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1392  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.02 
 
 
401 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6437  alcohol dehydrogenase  36.02 
 
 
401 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.632433  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4017  alcohol dehydrogenase  28.14 
 
 
382 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.530875 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6027  alcohol dehydrogenase  36.02 
 
 
401 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3009  alcohol dehydrogenase  29.43 
 
 
361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.39042  normal  0.310098 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.84 
 
 
392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  27.3 
 
 
358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.42 
 
 
389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.64 
 
 
410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5432  alcohol dehydrogenase  35.68 
 
 
401 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250505  normal  0.150153 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36660  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  32.03 
 
 
415 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000975221  normal  0.705006 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1442  alcohol dehydrogenase  34.92 
 
 
354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0102925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>