More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1755 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1755  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
403 aa  818    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0592  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  59.1 
 
 
401 aa  485  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  58.35 
 
 
415 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5391  alcohol dehydrogenase  58.81 
 
 
404 aa  462  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.515242  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24840  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  56.75 
 
 
444 aa  461  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2760  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  57.61 
 
 
425 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1142  alcohol dehydrogenase  57.61 
 
 
417 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.517956  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4753  alcohol dehydrogenase  55.11 
 
 
402 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209038  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36660  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  57.5 
 
 
415 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000975221  normal  0.705006 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2916  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  57.61 
 
 
492 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843639  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.73 
 
 
410 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.36 
 
 
410 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5432  alcohol dehydrogenase  56.75 
 
 
401 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250505  normal  0.150153 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  55.11 
 
 
422 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5660  alcohol dehydrogenase  56.86 
 
 
401 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6027  alcohol dehydrogenase  55.75 
 
 
401 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1392  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  55.75 
 
 
401 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6437  alcohol dehydrogenase  55.75 
 
 
401 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.632433  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3683  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.89 
 
 
397 aa  308  8e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0575  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.42 
 
 
389 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3663  hypothetical protein  41.08 
 
 
394 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184617  normal  0.501234 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.69 
 
 
388 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4498  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.18 
 
 
389 aa  296  6e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.2 
 
 
393 aa  291  1e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.2 
 
 
392 aa  291  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5445  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.69 
 
 
390 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.430041  normal  0.349478 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3104  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  40.34 
 
 
394 aa  290  4e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.345929  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3833  alcohol dehydrogenase  40.34 
 
 
394 aa  290  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24597  normal  0.375314 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.05 
 
 
405 aa  288  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.93 
 
 
389 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0165  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.95 
 
 
389 aa  285  9e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.05 
 
 
391 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0139  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.1 
 
 
401 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4212  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.45 
 
 
376 aa  280  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000750849  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5345  alcohol dehydrogenase  38.54 
 
 
399 aa  280  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.501465  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0122  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.29 
 
 
401 aa  278  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.566245 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5822  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40 
 
 
391 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4057  alcohol dehydrogenase  37.1 
 
 
433 aa  276  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.788461  normal  0.848638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3665  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.25 
 
 
388 aa  276  6e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.698913  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.95 
 
 
384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2860  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.08 
 
 
389 aa  274  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.489026  normal  0.707248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1223  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.08 
 
 
390 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417243 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.11 
 
 
398 aa  271  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.609837  decreased coverage  0.000185041 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5561  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.61 
 
 
389 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210102  normal  0.0249106 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.1 
 
 
382 aa  270  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.71 
 
 
384 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3148  alcohol dehydrogenase  38.97 
 
 
382 aa  271  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.539421  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4105  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.46 
 
 
390 aa  269  8e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3187  alcohol dehydrogenase  37.35 
 
 
389 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0065  alcohol dehydrogenase  38.73 
 
 
386 aa  268  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  38.65 
 
 
384 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0110  alcohol dehydrogenase  39.22 
 
 
390 aa  267  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0531  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.22 
 
 
390 aa  267  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.84 
 
 
392 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.74 
 
 
385 aa  266  5.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  hitchhiker  0.00205277 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0166  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  37.35 
 
 
395 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912922  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2370  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.35 
 
 
389 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1320  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.19 
 
 
384 aa  265  8e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106118  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6253  alcohol dehydrogenase  38.78 
 
 
391 aa  265  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.731237 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4673  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.57 
 
 
389 aa  263  4e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.77 
 
 
385 aa  263  4.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4725  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.58 
 
 
391 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105849  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2264  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.42 
 
 
390 aa  260  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.36 
 
 
390 aa  260  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2307  alcohol dehydrogenase  39.36 
 
 
390 aa  259  6e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0161452 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0835  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.27 
 
 
396 aa  258  9e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.202579 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2247  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  37.5 
 
 
391 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.644611  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.98 
 
 
387 aa  258  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4494  alcohol dehydrogenase  38.73 
 
 
390 aa  256  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134818  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1281  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.85 
 
 
392 aa  256  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.368078  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6246  alcohol dehydrogenase  38.44 
 
 
389 aa  255  9e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.829786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5415  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.86 
 
 
393 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0748  alcohol dehydrogenase  36.19 
 
 
388 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0754  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.19 
 
 
388 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0768  alcohol dehydrogenase  36.19 
 
 
388 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.87513  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4801  alcohol dehydrogenase  37.99 
 
 
389 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0751128 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4017  alcohol dehydrogenase  37.19 
 
 
382 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.530875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5159  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.48 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150662  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0764  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.68 
 
 
390 aa  254  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1016  alcohol dehydrogenase  35.68 
 
 
390 aa  253  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.72 
 
 
382 aa  253  5.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3368  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.72 
 
 
384 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0720  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.38 
 
 
389 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00145968  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3881  alcohol dehydrogenase  35.19 
 
 
391 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0212673 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1778  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.84 
 
 
382 aa  250  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.080092  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1328  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.19 
 
 
390 aa  250  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975088  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4359  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.05 
 
 
389 aa  249  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2149  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.37 
 
 
386 aa  248  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.406335  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4691  alcohol dehydrogenase  38.57 
 
 
389 aa  246  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0160  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.64 
 
 
392 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1507  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.54 
 
 
382 aa  246  8e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2482  putative zinc-containing dehydrogenase  36.86 
 
 
389 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4441  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.15 
 
 
384 aa  245  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204388  normal  0.287337 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5217  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.15 
 
 
384 aa  240  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2838  alcohol dehydrogenase, glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  36.14 
 
 
377 aa  237  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.409585  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3025  putative alcohol dehydrogenase  37.05 
 
 
380 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1246  zinc-type alcohol dehydrogenase  34.47 
 
 
385 aa  236  6e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.939827  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2300  alcohol dehydrogenase  35.92 
 
 
388 aa  236  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  hitchhiker  0.00000777829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3669  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.34 
 
 
386 aa  235  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.949441  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2657  alcohol dehydrogenase  34.31 
 
 
388 aa  234  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>