More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5391 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5391  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
404 aa  830    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.515242  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0592  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60.25 
 
 
401 aa  520  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2916  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  60.35 
 
 
492 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843639  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2760  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  60.35 
 
 
425 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1142  alcohol dehydrogenase  60.35 
 
 
417 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.517956  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4753  alcohol dehydrogenase  58.85 
 
 
402 aa  501  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209038  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.22 
 
 
410 aa  483  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  58 
 
 
422 aa  479  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1755  alcohol dehydrogenase  58.81 
 
 
403 aa  481  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5660  alcohol dehydrogenase  59 
 
 
401 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5432  alcohol dehydrogenase  58.6 
 
 
401 aa  473  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250505  normal  0.150153 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24840  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  57 
 
 
444 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.73 
 
 
410 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1392  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  58 
 
 
401 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6437  alcohol dehydrogenase  58 
 
 
401 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.632433  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6027  alcohol dehydrogenase  58 
 
 
401 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  57.5 
 
 
415 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36660  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  57.5 
 
 
415 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000975221  normal  0.705006 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.18 
 
 
389 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.07 
 
 
391 aa  290  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5445  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.13 
 
 
390 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.430041  normal  0.349478 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0575  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.12 
 
 
389 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.88 
 
 
388 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.73 
 
 
392 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0165  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.74 
 
 
389 aa  281  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3665  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.25 
 
 
388 aa  278  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.698913  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3187  alcohol dehydrogenase  37.35 
 
 
389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0835  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.98 
 
 
396 aa  273  6e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.202579 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4057  alcohol dehydrogenase  36.27 
 
 
433 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.788461  normal  0.848638 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1223  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.1 
 
 
390 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417243 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3683  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.32 
 
 
397 aa  271  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3663  hypothetical protein  36.41 
 
 
394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184617  normal  0.501234 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.84 
 
 
392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2860  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.35 
 
 
389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.489026  normal  0.707248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4498  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.65 
 
 
389 aa  269  7e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5822  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.65 
 
 
391 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.25 
 
 
382 aa  266  4e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5561  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.14 
 
 
389 aa  266  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210102  normal  0.0249106 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2370  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.14 
 
 
389 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3104  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  35.68 
 
 
394 aa  266  7e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.345929  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3833  alcohol dehydrogenase  35.68 
 
 
394 aa  265  8e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24597  normal  0.375314 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.96 
 
 
384 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.76 
 
 
405 aa  265  1e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0065  alcohol dehydrogenase  37.9 
 
 
386 aa  263  4e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  37.16 
 
 
384 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0139  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.14 
 
 
401 aa  263  6e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0122  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.14 
 
 
401 aa  262  6e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.566245 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.71 
 
 
384 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.65 
 
 
393 aa  261  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4212  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.32 
 
 
376 aa  259  7e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000750849  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.44 
 
 
398 aa  257  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.609837  decreased coverage  0.000185041 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0166  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  35.78 
 
 
395 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912922  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1320  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.45 
 
 
384 aa  255  7e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106118  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0754  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.04 
 
 
388 aa  256  7e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0748  alcohol dehydrogenase  35.04 
 
 
388 aa  256  7e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57534  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0768  alcohol dehydrogenase  35.04 
 
 
388 aa  256  7e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.87513  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4801  alcohol dehydrogenase  36.27 
 
 
389 aa  255  8e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0751128 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4725  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.78 
 
 
391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105849  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6253  alcohol dehydrogenase  36.03 
 
 
391 aa  252  7e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.731237 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6246  alcohol dehydrogenase  36.59 
 
 
389 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.829786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2247  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.59 
 
 
391 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.644611  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3368  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.81 
 
 
384 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5217  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.06 
 
 
384 aa  251  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4494  alcohol dehydrogenase  36.43 
 
 
390 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134818  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.19 
 
 
390 aa  251  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0110  alcohol dehydrogenase  35.7 
 
 
390 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2307  alcohol dehydrogenase  36.19 
 
 
390 aa  250  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0161452 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1778  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.59 
 
 
382 aa  250  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.080092  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4017  alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
382 aa  250  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.530875 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2264  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.19 
 
 
390 aa  249  6e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5345  alcohol dehydrogenase  36.59 
 
 
399 aa  249  6e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.501465  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.84 
 
 
382 aa  249  7e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3148  alcohol dehydrogenase  35.59 
 
 
382 aa  249  8e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.539421  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0531  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.05 
 
 
390 aa  249  9e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4691  alcohol dehydrogenase  36.54 
 
 
389 aa  247  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4105  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.8 
 
 
390 aa  247  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.01 
 
 
387 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5159  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.45 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150662  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.45 
 
 
385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  hitchhiker  0.00205277 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2482  putative zinc-containing dehydrogenase  35.38 
 
 
389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0720  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.22 
 
 
389 aa  242  9e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00145968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4441  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.07 
 
 
384 aa  242  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204388  normal  0.287337 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2149  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.47 
 
 
386 aa  241  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.406335  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2429  alcohol dehydrogenase  33.82 
 
 
400 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0410446  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26960  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  36.74 
 
 
372 aa  240  4e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.537835  normal  0.314257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.72 
 
 
385 aa  239  9e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3669  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.83 
 
 
386 aa  237  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.949441  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3025  putative alcohol dehydrogenase  35.27 
 
 
380 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4673  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.73 
 
 
389 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2641  alcohol dehydrogenase  34.06 
 
 
396 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0246923  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1507  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.81 
 
 
382 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1441  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.9 
 
 
390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.42991 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0561  alcohol dehydrogenase  35.03 
 
 
404 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.324844  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1281  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.94 
 
 
392 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.368078  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2657  alcohol dehydrogenase  34.71 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3970  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.58 
 
 
400 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0147  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.23 
 
 
390 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3527  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.74 
 
 
411 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129082  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2300  alcohol dehydrogenase  35.44 
 
 
388 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  hitchhiker  0.00000777829 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2984  alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 
400 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.29856  normal  0.505288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>