More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1442 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1442  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
354 aa  702    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0102925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0372  alcohol dehydrogenase  42.74 
 
 
348 aa  267  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2512  alcohol dehydrogenase  44.26 
 
 
346 aa  262  6.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.881464  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11924  dehydrogenase  40.06 
 
 
384 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  37.05 
 
 
352 aa  215  9e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.93 
 
 
405 aa  208  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3665  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.97 
 
 
388 aa  206  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.698913  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4057  alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
433 aa  203  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.788461  normal  0.848638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0835  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.53 
 
 
396 aa  202  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.202579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1841  alcohol dehydrogenase  40.11 
 
 
341 aa  202  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.32 
 
 
388 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0165  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.44 
 
 
389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1223  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.37 
 
 
390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417243 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5561  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.95 
 
 
389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210102  normal  0.0249106 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.04 
 
 
392 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.8 
 
 
384 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4901  alcohol dehydrogenase  38.44 
 
 
360 aa  193  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.8 
 
 
384 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.1 
 
 
392 aa  192  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0695  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.97 
 
 
412 aa  192  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2860  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.2 
 
 
389 aa  192  7e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.489026  normal  0.707248 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3683  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.86 
 
 
397 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00577  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  35.71 
 
 
412 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3016  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.71 
 
 
412 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665749  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1142  alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 
417 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.517956  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3035  alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
412 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2760  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.14 
 
 
425 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00566  hypothetical protein  35.71 
 
 
412 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2916  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.14 
 
 
492 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843639  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.69 
 
 
389 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0774  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase (glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase) (fdh) (faldh)  35.2 
 
 
412 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1073  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.54 
 
 
351 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1089  alcohol dehydrogenase  36.54 
 
 
351 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25524  normal  0.164937 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0660  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.46 
 
 
412 aa  189  8e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4997  alcohol dehydrogenase  36.51 
 
 
348 aa  189  9e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3187  alcohol dehydrogenase  34.95 
 
 
389 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1221  alcohol dehydrogenase  35.55 
 
 
343 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0655  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.95 
 
 
412 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  34.79 
 
 
415 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0669  alcohol dehydrogenase GroES-like domain protein  34.95 
 
 
412 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432264  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0728  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase (glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase) (fdh) (faldh)  34.95 
 
 
412 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0714  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.2 
 
 
412 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5432  alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 
401 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250505  normal  0.150153 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4517  alcohol dehydrogenase  39.26 
 
 
341 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.986402  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  34.45 
 
 
422 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.46 
 
 
412 aa  186  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2481  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.53 
 
 
387 aa  186  4e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4725  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.26 
 
 
391 aa  186  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105849  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19850  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  36.02 
 
 
400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.809397  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4498  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.66 
 
 
389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3075  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.91 
 
 
347 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3437  alcohol dehydrogenase  34.61 
 
 
391 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1320  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.8 
 
 
384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106118  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0764  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.1 
 
 
390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1016  alcohol dehydrogenase  35.1 
 
 
390 aa  184  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2370  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.46 
 
 
389 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3881  alcohol dehydrogenase  35.53 
 
 
391 aa  183  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0212673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1328  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.1 
 
 
390 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975088  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6027  alcohol dehydrogenase  33.66 
 
 
401 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1392  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.66 
 
 
401 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6437  alcohol dehydrogenase  33.66 
 
 
401 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.632433  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5159  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.08 
 
 
390 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150662  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.24 
 
 
346 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4801  alcohol dehydrogenase  32.91 
 
 
389 aa  182  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0751128 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4691  alcohol dehydrogenase  34.61 
 
 
389 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4130  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.86 
 
 
343 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0166  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  33.33 
 
 
395 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912922  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3216  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.09 
 
 
393 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36660  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  34.28 
 
 
415 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000975221  normal  0.705006 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4753  alcohol dehydrogenase  33.09 
 
 
402 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209038  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4494  alcohol dehydrogenase  32.32 
 
 
390 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134818  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5660  alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
401 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3663  hypothetical protein  35.62 
 
 
394 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184617  normal  0.501234 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5345  alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 
399 aa  180  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.501465  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0575  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.16 
 
 
389 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2482  putative zinc-containing dehydrogenase  33.42 
 
 
389 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3239  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  36.62 
 
 
356 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1380  alcohol dehydrogenase  35.99 
 
 
348 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378076  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1755  alcohol dehydrogenase  36.61 
 
 
403 aa  179  7e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.69 
 
 
391 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3833  alcohol dehydrogenase  35.37 
 
 
394 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24597  normal  0.375314 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6253  alcohol dehydrogenase  33.5 
 
 
391 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.731237 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1875  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  34.44 
 
 
411 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3104  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  35.37 
 
 
394 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.345929  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2090  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.63 
 
 
351 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000167964 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3962  alcohol dehydrogenase  33.72 
 
 
351 aa  177  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3527  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.18 
 
 
411 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129082  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1281  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.64 
 
 
392 aa  176  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.368078  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3148  alcohol dehydrogenase  36.56 
 
 
382 aa  176  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.539421  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0885  putative glutathione-dependent aldehyde dehydrogenase  32.32 
 
 
391 aa  175  8e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.418745  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.42 
 
 
410 aa  175  9e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5445  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.18 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.430041  normal  0.349478 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2247  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  33.25 
 
 
391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.644611  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2264  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.68 
 
 
393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0592  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.42 
 
 
401 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1091  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.72 
 
 
342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0065  alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 
386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3970  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.02 
 
 
400 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1308  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.21 
 
 
353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277534  normal  0.0550571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>