More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4352 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4352  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
354 aa  726    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2240  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.06 
 
 
355 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0360217 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.37 
 
 
354 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3460  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.24 
 
 
354 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00073426  hitchhiker  0.00463895 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0548  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.43 
 
 
350 aa  391  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0899798  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0435  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56 
 
 
351 aa  386  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.692768  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.3 
 
 
349 aa  385  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.228893  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0653  alcohol dehydrogenase  47.56 
 
 
352 aa  322  7e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3465  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.58 
 
 
366 aa  315  8e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.901244  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2770  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.29 
 
 
356 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5645  alcohol dehydrogenase  46.33 
 
 
357 aa  314  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.419975 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0967  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.48 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.635093  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1049  alcohol dehydrogenase  45.48 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.050805 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2008  alcohol dehydrogenase protein  44.32 
 
 
364 aa  311  2e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3188  alcohol dehydrogenase  45.21 
 
 
366 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1356  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  43.84 
 
 
366 aa  309  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3852  alcohol dehydrogenase  44.66 
 
 
365 aa  309  5e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07420  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  45.2 
 
 
357 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2137  alcohol dehydrogenase  44 
 
 
351 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0423941 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0203  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.51 
 
 
357 aa  299  6e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0325811 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1378  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.73 
 
 
352 aa  296  3e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2344  alcohol dehydrogenase (NADP+)  43.75 
 
 
352 aa  293  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100089  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0669  alcohol dehydrogenase  43.7 
 
 
374 aa  288  9e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.704397  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3346  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.38 
 
 
357 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1415  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.13 
 
 
352 aa  286  4e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.275014  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3514  alcohol dehydrogenase  43.36 
 
 
373 aa  286  5e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3032  alcohol dehydrogenase  42.66 
 
 
357 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2064  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  44.07 
 
 
357 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0265  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.07 
 
 
371 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.901967  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2536  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.66 
 
 
357 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.563542  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0764  hypothetical protein  44.48 
 
 
357 aa  281  2e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0197136 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1228  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.47 
 
 
352 aa  280  3e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.966969 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1399  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.71 
 
 
352 aa  250  3e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5564  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.63 
 
 
346 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175264  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1860  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.34 
 
 
346 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.44 
 
 
346 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1565  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.39 
 
 
349 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.965017  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5816  alcohol dehydrogenase  36.18 
 
 
346 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.136095 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  36.5 
 
 
346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3075  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.8 
 
 
347 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3657  alcohol dehydrogenase  39.05 
 
 
347 aa  212  7e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal  0.2926 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0709  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.8 
 
 
346 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1234  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  37.8 
 
 
346 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1718  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.8 
 
 
346 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0753  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.8 
 
 
346 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574599  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1160  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  37.8 
 
 
346 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2432  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.8 
 
 
346 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5892  alcohol dehydrogenase  35.61 
 
 
346 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032769  normal  0.939128 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  36.2 
 
 
346 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  36.9 
 
 
352 aa  205  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2034  hypothetical protein  33.33 
 
 
346 aa  203  4e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4548  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.62 
 
 
355 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00643704 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4415  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.62 
 
 
345 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1334  alcohol dehydrogenase  34.02 
 
 
344 aa  199  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0194  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  34.62 
 
 
345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.72 
 
 
346 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.539752  normal  0.655263 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1928  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.84 
 
 
370 aa  197  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.69 
 
 
345 aa  195  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0642635 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0322  alcohol dehydrogenase  36.01 
 
 
347 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.65143  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.6 
 
 
382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3962  alcohol dehydrogenase  34.94 
 
 
351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2090  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.37 
 
 
351 aa  190  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000167964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0924  putative zinc-dependent alcohol dehydrogenase (oxidoreductase)  33.33 
 
 
345 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.175832  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1091  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.19 
 
 
342 aa  189  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  34.12 
 
 
384 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4901  alcohol dehydrogenase  34.59 
 
 
360 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2366  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.65 
 
 
347 aa  186  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.0010665  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1073  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.81 
 
 
351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1089  alcohol dehydrogenase  34.81 
 
 
351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25524  normal  0.164937 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.59 
 
 
405 aa  183  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3239  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  37.39 
 
 
356 aa  182  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1221  alcohol dehydrogenase  32.74 
 
 
343 aa  182  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.27 
 
 
351 aa  181  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000634163  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0592  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.5 
 
 
401 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4997  alcohol dehydrogenase  34.71 
 
 
348 aa  179  9e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.59 
 
 
410 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3148  alcohol dehydrogenase  32.72 
 
 
382 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.539421  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
389 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5660  alcohol dehydrogenase  40.93 
 
 
401 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6246  alcohol dehydrogenase  30.9 
 
 
389 aa  176  7e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.829786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.42 
 
 
382 aa  176  8e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.74 
 
 
385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  hitchhiker  0.00205277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1380  alcohol dehydrogenase  33.95 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378076  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1778  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.46 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.080092  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1100  alcohol dehydrogenase  38.75 
 
 
299 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0318515  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.6 
 
 
410 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  32.38 
 
 
422 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1142  alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 
417 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.517956  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4017  alcohol dehydrogenase  32.97 
 
 
382 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.530875 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2760  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.34 
 
 
425 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2916  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  31.34 
 
 
492 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843639  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6027  alcohol dehydrogenase  39 
 
 
401 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1392  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39 
 
 
401 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6437  alcohol dehydrogenase  39 
 
 
401 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.632433  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0219  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.61 
 
 
350 aa  169  7e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24840  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  37.22 
 
 
444 aa  169  8e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0165  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.81 
 
 
389 aa  169  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0010  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.3 
 
 
346 aa  169  9e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.133832  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.23 
 
 
388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3187  alcohol dehydrogenase  32.33 
 
 
389 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>