127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4664 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4664  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 		 307 aa  595  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4783  alcohol dehydrogenase  76.66 
 
 		 289 aa  330  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2316  alcohol dehydrogenase  62.16 
 
 		 334 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.947925  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2453  putative dehydrogenase  54.05 
 
 		 332 aa  282  5.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1178  putative dehydrogenase  50.98 
 
 		 325 aa  276  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2745  putative dehydrogenase  52.27 
 
 		 337 aa  265  8e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000542225  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1678  putative dehydrogenase  51.16 
 
 		 346 aa  258  8e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0767  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.69 
 
 		 328 aa  256  5e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1679  dehydrogenase  54.25 
 
 		 360 aa  245  6.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445125  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0642  dehydrogenase  45.05 
 
 		 342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0795  dehydrogenase  44.44 
 
 		 340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0315  putative dehydrogenase  51.69 
 
 		 329 aa  239  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3598  putative dehydrogenase  51.14 
 
 		 337 aa  231  8.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927271  hitchhiker  0.00450633 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2564  hypothetical protein  50.49 
 
 		 326 aa  209  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.172199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2751  hypothetical protein  51.14 
 
 		 326 aa  205  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1078  putative dehydrogenase  36.74 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1999  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.02 
 
 		 336 aa  153  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.131571  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3514  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.47 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0522  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.62 
 
 		 338 aa  139  7.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0876145  normal  0.61344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1232  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.76 
 
 		 343 aa  132  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38005  predicted protein  30.51 
 
 		 1005 aa  130  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2577  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.59 
 
 		 342 aa  122  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 		 1079 aa  92.8  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2207  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.56 
 
 		 367 aa  85.9  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1296  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 		 1080 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0667  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.21 
 
 		 357 aa  72.4  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.559998 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3128  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.23 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02345  hypothetical protein  23.56 
 
 		 713 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  27.38 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0614  alcohol dehydrogenase  27.85 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0116847  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  25.76 
 
 		 341 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  25.76 
 
 		 341 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  27.72 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  25.71 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  25.71 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3331  alcohol dehydrogenase  26.02 
 
 		 719 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.127059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3921  alcohol dehydrogenase  31.36 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1422  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide  32.94 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0633  alcohol dehydrogenase  27.85 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23420  putative zinc-binding dehydrogenase  22.69 
 
 		 722 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123826  hitchhiker  0.00977209 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.69 
 
 		 336 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.52 
 
 		 351 aa  53.5  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3643  alcohol dehydrogenase  32.41 
 
 		 347 aa  53.5  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.826426  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  27.8 
 
 		 342 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3696  chlorophyll synthesis pathway, BchC  31.92 
 
 		 312 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  hitchhiker  0.00324331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  24.84 
 
 		 734 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3261  alcohol dehydrogenase  29.5 
 
 		 327 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255944 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2830  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.7 
 
 		 364 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02437  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  29.7 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1123  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.7 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2697  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.7 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1132  alcohol dehydrogenase  29.7 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2698  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.7 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02401  hypothetical protein  29.7 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0388  oxidoreductase domain protein  21.37 
 
 		 721 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.702394  normal  0.542029 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0938  chlorophyll synthesis pathway, BchC  23.14 
 
 		 325 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3935  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.56 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3592  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.31 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2473  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.82 
 
 		 344 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000066055  normal  0.0147407 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.44 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  25.51 
 
 		 715 aa  50.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1527  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  21.74 
 
 		 356 aa  50.4  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0808  alcohol dehydrogenase  20.39 
 
 		 712 aa  50.4  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0923  chlorobiumquinone synthase BchC related protein  22.47 
 
 		 318 aa  49.7  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.125274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1791  chlorophyll synthesis pathway, BchC  28.9 
 
 		 334 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.916125  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3224  alcohol dehydrogenase  29.59 
 
 		 317 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234723  normal  0.02058 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4226  alcohol dehydrogenase  28.05 
 
 		 352 aa  49.7  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0343  alcohol dehydrogenase  31.75 
 
 		 312 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472318 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0980  chlorophyll synthesis pathway, BchC  30.77 
 
 		 334 aa  49.7  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1534  chlorophyll synthesis pathway, BchC  27.54 
 
 		 321 aa  49.3  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910743 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  26.52 
 
 		 345 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3527  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.06 
 
 		 411 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129082  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0127  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31 
 
 		 345 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0898  chlorophyll synthesis pathway, BchC  28.83 
 
 		 334 aa  47.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.714457  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4187  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.74 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2451  alcohol dehydrogenase  29.32 
 
 		 355 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4931  alcohol dehydrogenase  25.84 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  29.07 
 
 		 346 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0075  sorbitol dehydrogenase, putative  24.6 
 
 		 348 aa  47  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0401  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide  25.96 
 
 		 332 aa  47  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.632471  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1144  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.09 
 
 		 323 aa  46.2  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.129111 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.15 
 
 		 352 aa  46.6  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3133  alcohol dehydrogenase  25.59 
 
 		 329 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0598  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.06 
 
 		 314 aa  46.2  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.122264  normal  0.243738 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0108  alcohol dehydrogenase  30.71 
 
 		 338 aa  45.8  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.476377  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.49 
 
 		 341 aa  45.8  0.0009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  27.14 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3794  zinc-binding alcohol dehydrogenase  21.2 
 
 		 719 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0021  Zn-binding dehydrogenase  22.75 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0554419  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0607  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  37.04 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420026  normal  0.0271059 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1540  alcohol dehydrogenase  30.51 
 
 		 336 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.931266 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0770  alcohol dehydrogenase  31.64 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00613196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1685  alcohol dehydrogenase  34.04 
 
 		 724 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4169  alcohol dehydrogenase  29.61 
 
 		 420 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.235444  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4033  oxidoreductase domain protein  23.78 
 
 		 699 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0424149 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2080  alcohol dehydrogenase  29.93 
 
 		 348 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.266825  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0114  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.71 
 
 		 348 aa  43.9  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  0.0906479 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6438  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide A dehydrogenase  29.61 
 
 		 313 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.88 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>