More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3261 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3261  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
327 aa  650    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0255944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3747  alcohol dehydrogenase  87.93 
 
 
323 aa  543  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00165792  hitchhiker  0.00000793402 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3128  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.69 
 
 
328 aa  326  3e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1422  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide  39.06 
 
 
334 aa  228  7e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0938  chlorophyll synthesis pathway, BchC  38.24 
 
 
325 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0401  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide  40.18 
 
 
332 aa  223  3e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.632471  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0898  chlorophyll synthesis pathway, BchC  38.75 
 
 
334 aa  223  3e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.714457  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1534  chlorophyll synthesis pathway, BchC  37.77 
 
 
321 aa  223  4e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910743 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0980  chlorophyll synthesis pathway, BchC  38.82 
 
 
334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1791  chlorophyll synthesis pathway, BchC  37.81 
 
 
334 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.916125  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3696  chlorophyll synthesis pathway, BchC  39.56 
 
 
312 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  hitchhiker  0.00324331 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1611  chlorophyll synthesis pathway, BchC  38.08 
 
 
327 aa  186  5e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2851  chlorophyll synthesis pathway, BchC  38.05 
 
 
312 aa  186  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.754242 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2051  chlorophyll synthesis pathway, BchC  38.44 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0614897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2981  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide  38.2 
 
 
317 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383171  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2729  chlorophyll synthesis pathway, BchC  37.38 
 
 
312 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195631  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2956  chlorophyll synthesis pathway, BchC  36.99 
 
 
312 aa  179  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.106767 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4002  chlorophyll synthesis pathway protein BchC  36.22 
 
 
312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.232331  decreased coverage  0.000580255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6438  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide A dehydrogenase  38.82 
 
 
313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3757  chlorophyll synthesis pathway protein BchC  35.6 
 
 
312 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485804 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1709  chlorophyll synthesis pathway, BchC  35.29 
 
 
312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3516  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide A dehydrogenase  34.38 
 
 
312 aa  162  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.549552 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2819  chlorophyll synthesis pathway, BchC  37.11 
 
 
312 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370469  normal  0.373141 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1292  chlorophyll synthesis pathway protein BchC  35.6 
 
 
312 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0263  chlorophyll synthesis pathway, bchC  33.44 
 
 
318 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1907  chlorophyll synthesis pathway, BchC  33.44 
 
 
318 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274753  normal  0.343747 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2037  chlorophyll synthesis pathway, BchC  32.01 
 
 
318 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.228307  normal  0.0545701 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0180  chlorophyll synthesis pathway, bchC  31.89 
 
 
325 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0994  alcohol dehydrogenase  26.42 
 
 
318 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0923  chlorobiumquinone synthase BchC related protein  28.12 
 
 
318 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.125274  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1109  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.04 
 
 
318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1445  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.1 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1181  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.59 
 
 
319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.531712 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1528  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.02 
 
 
320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1497  chlorobiumquinone synthase BchC related protein  24.76 
 
 
318 aa  106  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.132648  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3133  alcohol dehydrogenase  27.41 
 
 
329 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.09 
 
 
340 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.22 
 
 
340 aa  92.8  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06260  zinc-binding dehydrogenase, putative  25.9 
 
 
349 aa  92.8  7e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.040279  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.09 
 
 
340 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.09 
 
 
340 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  26.8 
 
 
340 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  26.8 
 
 
340 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.8 
 
 
340 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.8 
 
 
340 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  26.8 
 
 
340 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.65 
 
 
340 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1823  alcohol dehydrogenase  27.38 
 
 
350 aa  89.7  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00496203  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.07 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1608  putative Zn-dependent dehydrogenase  24.92 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.587808  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2811  alcohol dehydrogenase  29.6 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133999  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0639  alcohol dehydrogenase  27.51 
 
 
322 aa  80.5  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000239851  hitchhiker  0.000149204 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0265  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.78 
 
 
371 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.901967  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2784  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.6 
 
 
342 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551512  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0511  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.91 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.203373  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2828  alcohol dehydrogenase  29.6 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155527  normal  0.0877096 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.63 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3514  alcohol dehydrogenase  29.03 
 
 
373 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2137  alcohol dehydrogenase  28.03 
 
 
351 aa  79.3  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0423941 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07420  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  30.17 
 
 
357 aa  79.3  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2220  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.8 
 
 
343 aa  79  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.135715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0262  alcohol dehydrogenase  24.62 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0286  alcohol dehydrogenase  26.33 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0669  alcohol dehydrogenase  28.33 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.704397  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1545  alcohol dehydrogenase  25.17 
 
 
322 aa  75.9  0.0000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0146504 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5128  zinc-binding dehydrogenase  27.94 
 
 
337 aa  75.9  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  27.62 
 
 
344 aa  75.9  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2536  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.22 
 
 
357 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.563542  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0944  L-idonate 5-dehydrogenase  25.07 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.272351  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  24.14 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  24.65 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  23.99 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.56 
 
 
348 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.44 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.66 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  26.39 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.34 
 
 
333 aa  73.6  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  24.68 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0731443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1166  alcohol dehydrogenase  27.7 
 
 
351 aa  73.9  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.45 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1540  alcohol dehydrogenase  25.47 
 
 
336 aa  72.4  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.931266 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1538  L-idonate 5-dehydrogenase  26.22 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25.39 
 
 
349 aa  72  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4931  alcohol dehydrogenase  25.43 
 
 
337 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.23 
 
 
333 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  22.94 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4677  alcohol dehydrogenase  28.71 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1347  alcohol dehydrogenase  23.71 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.71457  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  27.43 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3346  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.65 
 
 
357 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0698  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.05 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.76 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  22.74 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1179  alcohol dehydrogenase  25.28 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  22.48 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3852  alcohol dehydrogenase  26.91 
 
 
365 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3621  alcohol dehydrogenase  26.93 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5642  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.24 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1573  alcohol dehydrogenase  27.45 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.42 
 
 
342 aa  69.3  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>