More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1179 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1179  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
399 aa  817    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2116  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.04 
 
 
373 aa  431  1e-119  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796302 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0394  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  50 
 
 
345 aa  355  8.999999999999999e-97  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.06 
 
 
385 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.807634  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4353  alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
385 aa  150  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  26.46 
 
 
345 aa  122  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.9 
 
 
365 aa  121  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000698288  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2220  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.77 
 
 
343 aa  121  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.135715 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2879  alcohol dehydrogenase  28.38 
 
 
371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0472393  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  28.61 
 
 
341 aa  119  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  26.53 
 
 
348 aa  119  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.22 
 
 
348 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0106  L-threonine 3-dehydrogenase  28.77 
 
 
341 aa  119  9e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588963  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0698  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.78 
 
 
349 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0308  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.45 
 
 
368 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0318  alcohol dehydrogenase  28.45 
 
 
368 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.407118 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0299  alcohol dehydrogenase  28.45 
 
 
368 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  28.9 
 
 
341 aa  117  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5737  putative sorbitol dehydrogenase  30.66 
 
 
376 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0763433  normal  0.0753834 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22030  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  29.35 
 
 
375 aa  116  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255526  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  27.93 
 
 
343 aa  116  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03240  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  27.95 
 
 
358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129511  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2083  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.14 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.6772  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.61 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2076  L-threonine 3-dehydrogenase  27.38 
 
 
342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0654334  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2565  L-threonine 3-dehydrogenase  26.69 
 
 
354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.61 
 
 
341 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01050  sorbitol dehydrogenase, putative  27.01 
 
 
379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917438  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0499  alcohol dehydrogenase  25.59 
 
 
367 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00895021  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  28.2 
 
 
341 aa  114  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2377  L-threonine 3-dehydrogenase  27.41 
 
 
341 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  27.93 
 
 
343 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1037  L-threonine 3-dehydrogenase  27.41 
 
 
341 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.210217  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0484  alcohol dehydrogenase  25.86 
 
 
367 aa  114  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  27.73 
 
 
342 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  28.2 
 
 
341 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  28.2 
 
 
341 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4823  L-threonine 3-dehydrogenase  28.69 
 
 
341 aa  114  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204753 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  28.2 
 
 
341 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  28.2 
 
 
341 aa  113  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1899  L-threonine 3-dehydrogenase  27.25 
 
 
341 aa  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.198837  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2554  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.7 
 
 
362 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2593  alcohol dehydrogenase  29.7 
 
 
362 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0149814  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2599  alcohol dehydrogenase  29.7 
 
 
362 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139182  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0100  L-threonine 3-dehydrogenase  27.59 
 
 
341 aa  112  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.173553 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001213  L-threonine 3-dehydrogenase  28.49 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.23 
 
 
371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.286052  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02580  sorbitol dehydrogenase, putative  26.7 
 
 
416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  27.91 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3288  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.23 
 
 
371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.44 
 
 
366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3421  alcohol dehydrogenase  28.23 
 
 
371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219023  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2379  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.84 
 
 
364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0062  L-threonine 3-dehydrogenase  26.97 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  27.91 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  27.91 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  27.76 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03474  L-threonine 3-dehydrogenase  28.69 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0601715  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3828  L-threonine 3-dehydrogenase  28.69 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4044  L-threonine 3-dehydrogenase  28.69 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03425  hypothetical protein  28.69 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3616  L-threonine 3-dehydrogenase  27.01 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00121447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4989  L-threonine 3-dehydrogenase  28.69 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.014  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  26.5 
 
 
345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  27.84 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0092  L-threonine 3-dehydrogenase  28.69 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212636  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4120  L-threonine 3-dehydrogenase  28.69 
 
 
341 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.357417  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0757  L-threonine 3-dehydrogenase  26.32 
 
 
340 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  27.35 
 
 
341 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0530  L-threonine 3-dehydrogenase  27.5 
 
 
345 aa  111  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0066  L-threonine 3-dehydrogenase  27.35 
 
 
341 aa  110  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  27.35 
 
 
341 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  28.41 
 
 
341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1615  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.63 
 
 
368 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0192054 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3953  L-threonine 3-dehydrogenase  28.41 
 
 
341 aa  110  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0503034  normal  0.824331 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  26.87 
 
 
359 aa  109  7.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  27.62 
 
 
341 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  26.3 
 
 
341 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05001  L-threonine 3-dehydrogenase  28.18 
 
 
360 aa  109  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0739  L-threonine 3-dehydrogenase  25.73 
 
 
340 aa  109  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1028  L-threonine 3-dehydrogenase  27.87 
 
 
347 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.18 
 
 
357 aa  109  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1762  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  26.86 
 
 
355 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0108342  hitchhiker  0.000113364 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0513  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.18 
 
 
360 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1506  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  26.86 
 
 
408 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000397792  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2055  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.08 
 
 
363 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0305  alcohol dehydrogenase  27.82 
 
 
358 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0851572 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1610  alcohol dehydrogenase  26.86 
 
 
408 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3988  L-threonine 3-dehydrogenase  28.12 
 
 
341 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3926  L-threonine 3-dehydrogenase  28.12 
 
 
341 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7003  L-threonine 3-dehydrogenase  27.12 
 
 
343 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  28.12 
 
 
341 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3907  L-threonine 3-dehydrogenase  28.12 
 
 
341 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4033  L-threonine 3-dehydrogenase  28.12 
 
 
341 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1306  alcohol dehydrogenase  28.78 
 
 
348 aa  107  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.37 
 
 
352 aa  107  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5157  L-threonine 3-dehydrogenase  27.67 
 
 
342 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4535  L-threonine 3-dehydrogenase  27.67 
 
 
342 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5702  L-threonine 3-dehydrogenase  27.67 
 
 
342 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495023 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1512  L-threonine 3-dehydrogenase  26.54 
 
 
343 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>