More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2379 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2379  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
364 aa  723    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0299  alcohol dehydrogenase  42.94 
 
 
368 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0318  alcohol dehydrogenase  42.94 
 
 
368 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.407118 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0308  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.94 
 
 
368 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2879  alcohol dehydrogenase  42.25 
 
 
371 aa  258  9e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0472393  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0513  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.96 
 
 
360 aa  175  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7506  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.48 
 
 
369 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4353  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
385 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.61 
 
 
360 aa  155  9e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209599  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.55 
 
 
385 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.807634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2083  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.74 
 
 
362 aa  149  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.6772  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1170  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.37 
 
 
349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1903  phosphonate catabolism associated alcohol dehydrogenase  29.76 
 
 
387 aa  142  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2347  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.41 
 
 
341 aa  139  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.174722  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2116  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.14 
 
 
373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796302 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1007  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  30.35 
 
 
351 aa  136  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5303  alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 
364 aa  132  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803168  normal  0.725419 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3048  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.15 
 
 
355 aa  132  7.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1016  alcohol dehydrogenase  27.82 
 
 
390 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0698  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.84 
 
 
349 aa  130  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1615  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.69 
 
 
368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0192054 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  31.01 
 
 
327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0764  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.82 
 
 
390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  33.55 
 
 
341 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0041  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.55 
 
 
341 aa  129  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000412094  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2089  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.02 
 
 
385 aa  129  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.18 
 
 
348 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.41 
 
 
365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000698288  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1078  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.9 
 
 
345 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1802  alcohol dehydrogenase  26.8 
 
 
364 aa  127  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.240094 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2220  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.15 
 
 
343 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.135715 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1328  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.27 
 
 
390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975088  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3881  alcohol dehydrogenase  27.2 
 
 
391 aa  126  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0212673 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3075  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.65 
 
 
347 aa  126  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1166  alcohol dehydrogenase  34.55 
 
 
351 aa  126  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  28.65 
 
 
336 aa  126  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3944  L-threonine 3-dehydrogenase  32.91 
 
 
342 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1808  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.31 
 
 
357 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  30.15 
 
 
341 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  32.7 
 
 
343 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  30.15 
 
 
341 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0499  alcohol dehydrogenase  28.33 
 
 
367 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00895021  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  30.13 
 
 
341 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0484  alcohol dehydrogenase  27.84 
 
 
367 aa  124  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3920  L-threonine 3-dehydrogenase  28.53 
 
 
350 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344166  normal  0.087716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2907  alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 
330 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0648917  normal  0.0454555 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  29.85 
 
 
341 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.62 
 
 
342 aa  123  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  32.67 
 
 
345 aa  124  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05001  L-threonine 3-dehydrogenase  29.7 
 
 
360 aa  123  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  30.45 
 
 
341 aa  123  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  28.79 
 
 
341 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4352  alcohol dehydrogenase  29.57 
 
 
354 aa  122  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  31.41 
 
 
352 aa  122  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  36.71 
 
 
364 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0293  L-threonine 3-dehydrogenase  29.34 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1308  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.6 
 
 
353 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277534  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  30.13 
 
 
341 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1862  L-threonine 3-dehydrogenase  32.27 
 
 
345 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  31.19 
 
 
359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  28.48 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  30.45 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  30.82 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0119  L-threonine 3-dehydrogenase  30.13 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  36.71 
 
 
354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2137  alcohol dehydrogenase  33.92 
 
 
351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0423941 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.44 
 
 
337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  36.01 
 
 
365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4033  L-threonine 3-dehydrogenase  30.45 
 
 
341 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3988  L-threonine 3-dehydrogenase  30.45 
 
 
341 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001213  L-threonine 3-dehydrogenase  29.23 
 
 
343 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3907  L-threonine 3-dehydrogenase  30.45 
 
 
341 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2473  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.18 
 
 
344 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000066055  normal  0.0147407 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.01 
 
 
354 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  30.08 
 
 
341 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  36.01 
 
 
354 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  30.45 
 
 
341 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3926  L-threonine 3-dehydrogenase  30.45 
 
 
341 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1783  L-threonine 3-dehydrogenase  31.95 
 
 
345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3219  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.1 
 
 
347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0106  L-threonine 3-dehydrogenase  30.13 
 
 
341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588963  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.19 
 
 
382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 
354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6852  alcohol dehydrogenase  31.1 
 
 
340 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0062  L-threonine 3-dehydrogenase  28.62 
 
 
340 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  29.17 
 
 
341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  29.17 
 
 
341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.07 
 
 
346 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.78 
 
 
352 aa  119  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2240  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.97 
 
 
355 aa  119  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0360217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2786  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.81 
 
 
341 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  29.17 
 
 
341 aa  119  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  30.13 
 
 
341 aa  119  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2830  alcohol dehydrogenase  29.81 
 
 
341 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.782331  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3185  phosphonate catabolism associated alcohol dehydrogenase  34.08 
 
 
367 aa  119  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0695592  normal  0.0163259 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  30.45 
 
 
341 aa  119  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  30.13 
 
 
341 aa  119  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  30.13 
 
 
341 aa  119  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22030  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  30.64 
 
 
375 aa  119  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255526  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.24 
 
 
341 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>