More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1802 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1802  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
364 aa  750    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.240094 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5303  alcohol dehydrogenase  79.95 
 
 
364 aa  620  1e-176  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803168  normal  0.725419 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6321  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.32 
 
 
367 aa  305  6e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11563  alcohol dehydrogenase adh  43.09 
 
 
367 aa  281  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3236  alcohol dehydrogenase  37.22 
 
 
366 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284859  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3225  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.22 
 
 
366 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3287  alcohol dehydrogenase  37.22 
 
 
366 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.424185 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4626  alcohol dehydrogenase  42.51 
 
 
365 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5783  L-threonine 3-dehydrogenase  36.36 
 
 
367 aa  223  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4227  alcohol dehydrogenase  35.56 
 
 
344 aa  213  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.463097  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1497  alcohol dehydrogenase  36.03 
 
 
344 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4598  alcohol dehydrogenase  36.97 
 
 
345 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6217  alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
344 aa  195  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2554  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.6 
 
 
362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2599  alcohol dehydrogenase  33.6 
 
 
362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139182  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2593  alcohol dehydrogenase  33.6 
 
 
362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0149814  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.18 
 
 
366 aa  160  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22030  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  31.18 
 
 
375 aa  156  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255526  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03240  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  28.95 
 
 
358 aa  152  8.999999999999999e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129511  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0887  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.44 
 
 
362 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2089  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.54 
 
 
385 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5466  alcohol dehydrogenase  31.88 
 
 
362 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.0829425 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3550  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.88 
 
 
362 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4817  alcohol dehydrogenase  31.88 
 
 
362 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.562057  normal  0.226619 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2272  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.27 
 
 
349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2055  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.45 
 
 
363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0341  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.92 
 
 
379 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.384488  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3786  alcohol dehydrogenase  31.06 
 
 
369 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0107971 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3288  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.42 
 
 
371 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3421  alcohol dehydrogenase  28.42 
 
 
371 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219023  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  29.86 
 
 
345 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.42 
 
 
371 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.286052  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3233  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.01 
 
 
365 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4721  alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 
362 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.36355 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4198  alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 
362 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0503  alcohol dehydrogenase  31.23 
 
 
362 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472686 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29840  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  29.97 
 
 
362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0364  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.3 
 
 
378 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1810  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.3 
 
 
378 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2072  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.3 
 
 
378 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0808  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.3 
 
 
378 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1099  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.3 
 
 
378 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.488512  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.71 
 
 
343 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0459  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.03 
 
 
378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.479531  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1795  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.03 
 
 
378 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1506  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  30 
 
 
408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000397792  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1762  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  30 
 
 
355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0108342  hitchhiker  0.000113364 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1610  alcohol dehydrogenase  30 
 
 
408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4579  alcohol dehydrogenase  29.62 
 
 
373 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2083  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.65 
 
 
362 aa  130  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.6772  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2567  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.14 
 
 
371 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134706  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  28.49 
 
 
358 aa  129  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0860  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.8 
 
 
363 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183529  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1639  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.8 
 
 
363 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.514454  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4353  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
385 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1195  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.06 
 
 
353 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184304  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0499  alcohol dehydrogenase  30.08 
 
 
367 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00895021  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2072  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.8 
 
 
422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.055624  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2432  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.23 
 
 
363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0301  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.8 
 
 
430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0487501  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1911  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.8 
 
 
363 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.197112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1924  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.8 
 
 
363 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.91 
 
 
385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.807634  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  27.44 
 
 
348 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0484  alcohol dehydrogenase  30.08 
 
 
367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2379  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.8 
 
 
364 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.98 
 
 
342 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.15 
 
 
346 aa  126  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3793  L-threonine 3-dehydrogenase  25.92 
 
 
341 aa  126  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.36 
 
 
356 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  28.49 
 
 
355 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.55 
 
 
352 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  28.12 
 
 
351 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  28.21 
 
 
341 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.07 
 
 
335 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  28.12 
 
 
351 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0698  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.29 
 
 
349 aa  125  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2864  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.09 
 
 
359 aa  123  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0970  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.67 
 
 
345 aa  123  6e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.55 
 
 
354 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  30.55 
 
 
365 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.43 
 
 
352 aa  122  9e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  30.55 
 
 
354 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  28.32 
 
 
337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 
354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3224  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.4 
 
 
357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3334  alcohol dehydrogenase  27.84 
 
 
364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.12 
 
 
344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2013  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.19 
 
 
344 aa  120  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.238084  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  29.93 
 
 
364 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5066  alcohol dehydrogenase  29.31 
 
 
366 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0364575 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  28.1 
 
 
336 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 
354 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0293  L-threonine 3-dehydrogenase  28.81 
 
 
347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1347  alcohol dehydrogenase  28.32 
 
 
343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.71457  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.51 
 
 
346 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.06 
 
 
365 aa  119  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000698288  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.68 
 
 
357 aa  119  7.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.23 
 
 
354 aa  119  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6852  alcohol dehydrogenase  30.5 
 
 
340 aa  119  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>