More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5783 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5783  L-threonine 3-dehydrogenase  100 
 
 
367 aa  754    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1802  alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 
364 aa  223  6e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.240094 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6321  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.88 
 
 
367 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5303  alcohol dehydrogenase  35.31 
 
 
364 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803168  normal  0.725419 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3236  alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 
366 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284859  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3225  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.15 
 
 
366 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3287  alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 
366 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.424185 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1497  alcohol dehydrogenase  33.78 
 
 
344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4626  alcohol dehydrogenase  38.17 
 
 
365 aa  153  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2089  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.47 
 
 
385 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4227  alcohol dehydrogenase  30.86 
 
 
344 aa  146  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.463097  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11563  alcohol dehydrogenase adh  38 
 
 
367 aa  143  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2554  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.35 
 
 
362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2599  alcohol dehydrogenase  30.35 
 
 
362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139182  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2593  alcohol dehydrogenase  30.35 
 
 
362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0149814  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2055  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.46 
 
 
363 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  28.29 
 
 
348 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6217  alcohol dehydrogenase  30.62 
 
 
344 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.69 
 
 
366 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03240  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  25.14 
 
 
358 aa  119  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129511  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4598  alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
345 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.86 
 
 
346 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22030  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  26.7 
 
 
375 aa  116  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  28.42 
 
 
342 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2272  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.24 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2567  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.96 
 
 
371 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134706  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29840  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  28.53 
 
 
362 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1530  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.18 
 
 
367 aa  113  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540116  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1795  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.6 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2379  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.23 
 
 
364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2864  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.72 
 
 
359 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0459  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.6 
 
 
378 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.479531  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2013  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.02 
 
 
344 aa  110  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.238084  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5213  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.69 
 
 
354 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000291101  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1810  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.33 
 
 
378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  27.42 
 
 
358 aa  110  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4221  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.77 
 
 
346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.41128  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2072  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.33 
 
 
378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0808  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.33 
 
 
378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1099  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.33 
 
 
378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.488512  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3219  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.36 
 
 
347 aa  110  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0364  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.33 
 
 
378 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.86 
 
 
347 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.45 
 
 
344 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.61 
 
 
352 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1170  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.35 
 
 
349 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.15 
 
 
350 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5268  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.33 
 
 
346 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0154  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.58 
 
 
356 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  29.27 
 
 
346 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.34 
 
 
356 aa  103  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.2 
 
 
344 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7070  alcohol dehydrogenase  26.78 
 
 
346 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3288  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  24.06 
 
 
371 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3421  alcohol dehydrogenase  24.06 
 
 
371 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219023  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  24.06 
 
 
371 aa  102  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.286052  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1347  alcohol dehydrogenase  26.57 
 
 
343 aa  102  9e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.71457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  30.77 
 
 
350 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  30.77 
 
 
350 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
350 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0341  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.47 
 
 
379 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.384488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.38 
 
 
350 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3786  alcohol dehydrogenase  25.07 
 
 
369 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0107971 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4479  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.83 
 
 
347 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.522798  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.77 
 
 
350 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2145  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  30.58 
 
 
346 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552645  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.38 
 
 
350 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7304  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.99 
 
 
356 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554386  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0780  L-threonine 3-dehydrogenase  27.79 
 
 
348 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2432  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  25.21 
 
 
363 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3224  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.81 
 
 
357 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  25.07 
 
 
347 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  28.06 
 
 
349 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4579  alcohol dehydrogenase  26.3 
 
 
373 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.04 
 
 
356 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  26.33 
 
 
336 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2059  sorbitol dehydrogenase  25.67 
 
 
347 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  hitchhiker  0.0031409 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3165  alcohol dehydrogenase  27.76 
 
 
352 aa  101  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.38 
 
 
350 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0887  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  24.79 
 
 
362 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  30.38 
 
 
350 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.38 
 
 
350 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  24.57 
 
 
347 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.57 
 
 
347 aa  100  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  24.57 
 
 
347 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1417  sorbitol dehydrogenase  24.57 
 
 
347 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1998  sorbitol dehydrogenase  24.57 
 
 
347 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.329256  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4721  alcohol dehydrogenase  24.79 
 
 
362 aa  99.8  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.36355 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3550  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.91 
 
 
362 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4817  alcohol dehydrogenase  26.91 
 
 
362 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.562057  normal  0.226619 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0503  alcohol dehydrogenase  25.98 
 
 
362 aa  99.8  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472686 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5466  alcohol dehydrogenase  26.91 
 
 
362 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.0829425 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.28 
 
 
351 aa  99.8  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4198  alcohol dehydrogenase  26.91 
 
 
362 aa  99.8  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1858  alcohol dehydrogenase  24.57 
 
 
347 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.368595  hitchhiker  0.0000214432 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2083  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.87 
 
 
362 aa  99.4  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.6772  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01050  sorbitol dehydrogenase, putative  25.9 
 
 
379 aa  99  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917438  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2347  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.76 
 
 
341 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.174722  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2224  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.19 
 
 
381 aa  99.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3233  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.68 
 
 
365 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>