More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6321 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6321  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  100 
 
 
367 aa  742    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1802  alcohol dehydrogenase  44.32 
 
 
364 aa  323  3e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.240094 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5303  alcohol dehydrogenase  43.17 
 
 
364 aa  305  9.000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803168  normal  0.725419 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11563  alcohol dehydrogenase adh  42.31 
 
 
367 aa  233  6e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4227  alcohol dehydrogenase  39.61 
 
 
344 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.463097  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5783  L-threonine 3-dehydrogenase  35.88 
 
 
367 aa  222  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3225  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.16 
 
 
366 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3287  alcohol dehydrogenase  37.16 
 
 
366 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.424185 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3236  alcohol dehydrogenase  37.16 
 
 
366 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284859  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4598  alcohol dehydrogenase  37.4 
 
 
345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4626  alcohol dehydrogenase  38.42 
 
 
365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6217  alcohol dehydrogenase  38.23 
 
 
344 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1497  alcohol dehydrogenase  37.33 
 
 
344 aa  195  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3233  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31 
 
 
365 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2593  alcohol dehydrogenase  31.08 
 
 
362 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0149814  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2554  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.08 
 
 
362 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2599  alcohol dehydrogenase  31.08 
 
 
362 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139182  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0503  alcohol dehydrogenase  29.49 
 
 
362 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472686 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2089  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.71 
 
 
385 aa  159  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3786  alcohol dehydrogenase  30.52 
 
 
369 aa  157  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0107971 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3550  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.79 
 
 
362 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4817  alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
362 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.562057  normal  0.226619 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5466  alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
362 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.0829425 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0887  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.97 
 
 
362 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4721  alcohol dehydrogenase  30.25 
 
 
362 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.36355 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4198  alcohol dehydrogenase  30.52 
 
 
362 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  35.47 
 
 
358 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4353  alcohol dehydrogenase  32.67 
 
 
385 aa  149  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0341  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
379 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.384488  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4579  alcohol dehydrogenase  31.65 
 
 
373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22030  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  31.17 
 
 
375 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255526  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.73 
 
 
366 aa  147  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2432  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.31 
 
 
363 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.79 
 
 
385 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.807634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  30.65 
 
 
345 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0860  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.03 
 
 
363 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183529  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1639  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.03 
 
 
363 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.514454  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1924  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.03 
 
 
363 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0301  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.03 
 
 
430 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0487501  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1911  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.03 
 
 
363 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.197112  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2072  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.03 
 
 
422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.055624  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1195  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.16 
 
 
353 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184304  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1166  alcohol dehydrogenase  32.96 
 
 
351 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.17 
 
 
342 aa  139  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2055  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.33 
 
 
363 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2272  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.8 
 
 
349 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  31.74 
 
 
347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1417  sorbitol dehydrogenase  31.46 
 
 
347 aa  135  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2220  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.65 
 
 
343 aa  135  9e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.135715 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1506  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  28.69 
 
 
408 aa  135  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000397792  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  31.46 
 
 
347 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1610  alcohol dehydrogenase  28.69 
 
 
408 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.46 
 
 
347 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1762  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  28.69 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0108342  hitchhiker  0.000113364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  31.46 
 
 
347 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1998  sorbitol dehydrogenase  31.46 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.329256  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29840  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  28.92 
 
 
362 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1858  alcohol dehydrogenase  31.46 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.368595  hitchhiker  0.0000214432 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2445  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.2 
 
 
347 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.682207  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03240  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  27.64 
 
 
358 aa  133  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129511  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0970  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.14 
 
 
345 aa  132  7.999999999999999e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.83 
 
 
346 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.7 
 
 
357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2059  sorbitol dehydrogenase  30.46 
 
 
347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  hitchhiker  0.0031409 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3256  alcohol dehydrogenase  29.34 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0196  alcohol dehydrogenase  30.09 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.583804  normal  0.0665338 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.27 
 
 
371 aa  130  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.286052  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2095  L-threonine 3-dehydrogenase  29.7 
 
 
345 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3421  alcohol dehydrogenase  29.27 
 
 
371 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219023  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3288  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.27 
 
 
371 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2083  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.6 
 
 
362 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.6772  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  29.46 
 
 
359 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  28.96 
 
 
348 aa  129  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3224  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.88 
 
 
357 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2379  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.98 
 
 
364 aa  129  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3793  L-threonine 3-dehydrogenase  26.86 
 
 
341 aa  129  9.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1862  L-threonine 3-dehydrogenase  29.09 
 
 
345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01050  sorbitol dehydrogenase, putative  30.11 
 
 
379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917438  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  28.99 
 
 
337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  27.83 
 
 
341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  27.83 
 
 
341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1783  L-threonine 3-dehydrogenase  29.09 
 
 
345 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.37 
 
 
344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2072  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.1 
 
 
378 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1810  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.1 
 
 
378 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  27.54 
 
 
341 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3219  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.95 
 
 
347 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0745  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  32 
 
 
360 aa  127  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0808  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.1 
 
 
378 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1099  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.1 
 
 
378 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.488512  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3324  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.81 
 
 
344 aa  126  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000796968  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0444  L-threonine 3-dehydrogenase  31 
 
 
344 aa  126  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3450  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  28.57 
 
 
347 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  27.54 
 
 
341 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2224  L-threonine 3-dehydrogenase  30.28 
 
 
344 aa  125  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.37 
 
 
352 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0459  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.56 
 
 
378 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.479531  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0364  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.56 
 
 
378 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1538  L-idonate 5-dehydrogenase  32.27 
 
 
347 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3616  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  28.3 
 
 
347 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>