More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1903 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1903  phosphonate catabolism associated alcohol dehydrogenase  100 
 
 
387 aa  791    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2907  alcohol dehydrogenase  41.3 
 
 
330 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0648917  normal  0.0454555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3185  phosphonate catabolism associated alcohol dehydrogenase  39.44 
 
 
367 aa  209  6e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0695592  normal  0.0163259 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.03 
 
 
365 aa  171  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000698288  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1323  alcohol dehydrogenase  36.47 
 
 
328 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.872733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0299  alcohol dehydrogenase  32.33 
 
 
368 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0308  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.33 
 
 
368 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0318  alcohol dehydrogenase  32.33 
 
 
368 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.407118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2879  alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 
371 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0472393  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4353  alcohol dehydrogenase  31.65 
 
 
385 aa  142  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2379  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.76 
 
 
364 aa  142  8e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25570  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  32.05 
 
 
381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.76 
 
 
385 aa  141  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.807634  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0201  L-threonine 3-dehydrogenase  29.77 
 
 
342 aa  136  5e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1995  L-threonine 3-dehydrogenase  29.77 
 
 
348 aa  136  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.271324  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  29.53 
 
 
345 aa  134  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3324  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.5 
 
 
344 aa  133  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000796968  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0484  alcohol dehydrogenase  28.29 
 
 
367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0049  L-threonine 3-dehydrogenase  30.3 
 
 
347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160501 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2083  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.08 
 
 
362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.6772  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0499  alcohol dehydrogenase  28.29 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00895021  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  26.35 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0050  L-threonine 3-dehydrogenase  29.97 
 
 
347 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001213  L-threonine 3-dehydrogenase  26.51 
 
 
343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05001  L-threonine 3-dehydrogenase  26.51 
 
 
360 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2095  L-threonine 3-dehydrogenase  26.36 
 
 
345 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1783  L-threonine 3-dehydrogenase  27.06 
 
 
345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7506  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.62 
 
 
369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1862  L-threonine 3-dehydrogenase  26.76 
 
 
345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0066  L-threonine 3-dehydrogenase  26.01 
 
 
341 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  26.01 
 
 
341 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2931  L-threonine 3-dehydrogenase  26.63 
 
 
343 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.217588  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  26.01 
 
 
341 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2224  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.97 
 
 
381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  26.2 
 
 
341 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  26.47 
 
 
343 aa  124  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  26.18 
 
 
343 aa  123  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  25.45 
 
 
341 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3944  L-threonine 3-dehydrogenase  26.01 
 
 
342 aa  122  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  26.18 
 
 
341 aa  122  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  28.18 
 
 
348 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2686  L-threonine 3-dehydrogenase  28.65 
 
 
345 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00603723  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0513  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.34 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4823  L-threonine 3-dehydrogenase  25.37 
 
 
341 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204753 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  25.59 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.99 
 
 
357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0353  L-threonine 3-dehydrogenase  23.95 
 
 
343 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  25.15 
 
 
341 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  25.59 
 
 
341 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  25.59 
 
 
341 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  25.15 
 
 
341 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  25.15 
 
 
341 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  25.59 
 
 
341 aa  120  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4160  L-threonine 3-dehydrogenase  27 
 
 
342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1775  putative alcohol dehydrogenase (zinc-binding)  28.65 
 
 
361 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0121  L-threonine 3-dehydrogenase  27.96 
 
 
341 aa  120  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1615  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.1 
 
 
368 aa  120  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0192054 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  26.82 
 
 
361 aa  119  7e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0530  L-threonine 3-dehydrogenase  27.22 
 
 
345 aa  119  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  25.88 
 
 
341 aa  119  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2076  L-threonine 3-dehydrogenase  29.97 
 
 
342 aa  118  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0654334  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  25 
 
 
341 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3616  L-threonine 3-dehydrogenase  25.36 
 
 
342 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00121447  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7003  L-threonine 3-dehydrogenase  27 
 
 
343 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.27 
 
 
357 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5303  alcohol dehydrogenase  29.62 
 
 
364 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803168  normal  0.725419 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0106  L-threonine 3-dehydrogenase  25.36 
 
 
341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588963  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1802  alcohol dehydrogenase  26.96 
 
 
364 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.240094 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03474  L-threonine 3-dehydrogenase  24.57 
 
 
341 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0601715  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  24.57 
 
 
341 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4044  L-threonine 3-dehydrogenase  24.57 
 
 
341 aa  117  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0092  L-threonine 3-dehydrogenase  24.57 
 
 
341 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212636  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2101  alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 
340 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3953  L-threonine 3-dehydrogenase  24.57 
 
 
341 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0503034  normal  0.824331 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  25 
 
 
341 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03425  hypothetical protein  24.57 
 
 
341 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3828  L-threonine 3-dehydrogenase  24.57 
 
 
341 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0338  alcohol dehydrogenase  32.24 
 
 
351 aa  117  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0576668  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2469  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.12 
 
 
375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.43107  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0739  L-threonine 3-dehydrogenase  26.88 
 
 
340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0100  L-threonine 3-dehydrogenase  25.88 
 
 
341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.173553 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4989  L-threonine 3-dehydrogenase  24.57 
 
 
341 aa  117  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.014  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3020  L-threonine 3-dehydrogenase  26.71 
 
 
343 aa  116  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4033  L-threonine 3-dehydrogenase  24.57 
 
 
341 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0837  L-threonine 3-dehydrogenase  25.91 
 
 
343 aa  116  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178921  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3907  L-threonine 3-dehydrogenase  24.57 
 
 
341 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3988  L-threonine 3-dehydrogenase  24.57 
 
 
341 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3926  L-threonine 3-dehydrogenase  24.57 
 
 
341 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  24.57 
 
 
341 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2661  L-threonine 3-dehydrogenase  29.28 
 
 
346 aa  116  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0119  L-threonine 3-dehydrogenase  24.86 
 
 
341 aa  116  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4535  L-threonine 3-dehydrogenase  27.22 
 
 
342 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5157  L-threonine 3-dehydrogenase  27.22 
 
 
342 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5702  L-threonine 3-dehydrogenase  27.22 
 
 
342 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495023 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2700  L-threonine 3-dehydrogenase  24.57 
 
 
345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1512  L-threonine 3-dehydrogenase  26.55 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  26.55 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.4 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0007  L-threonine 3-dehydrogenase  26.55 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.237262  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1152  L-threonine 3-dehydrogenase  26.55 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>