233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2051 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2051  chlorophyll synthesis pathway, BchC  100 
 
 
315 aa  622  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0614897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2981  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide  65.2 
 
 
317 aa  412  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383171  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4002  chlorophyll synthesis pathway protein BchC  63.14 
 
 
312 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.232331  decreased coverage  0.000580255 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3696  chlorophyll synthesis pathway, BchC  65.71 
 
 
312 aa  388  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  hitchhiker  0.00324331 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1709  chlorophyll synthesis pathway, BchC  62.5 
 
 
312 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3757  chlorophyll synthesis pathway protein BchC  62.82 
 
 
312 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485804 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2956  chlorophyll synthesis pathway, BchC  63.17 
 
 
312 aa  385  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.106767 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2729  chlorophyll synthesis pathway, BchC  62.86 
 
 
312 aa  381  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195631  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2851  chlorophyll synthesis pathway, BchC  63.81 
 
 
312 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.754242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6438  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide A dehydrogenase  63.69 
 
 
313 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1292  chlorophyll synthesis pathway protein BchC  63.78 
 
 
312 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1611  chlorophyll synthesis pathway, BchC  62.46 
 
 
327 aa  365  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2819  chlorophyll synthesis pathway, BchC  63.58 
 
 
312 aa  352  5e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370469  normal  0.373141 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0263  chlorophyll synthesis pathway, bchC  55.84 
 
 
318 aa  330  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1907  chlorophyll synthesis pathway, BchC  55.84 
 
 
318 aa  330  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274753  normal  0.343747 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2037  chlorophyll synthesis pathway, BchC  55.52 
 
 
318 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.228307  normal  0.0545701 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0180  chlorophyll synthesis pathway, bchC  58.2 
 
 
325 aa  315  6e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3516  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide A dehydrogenase  54.34 
 
 
312 aa  298  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.549552 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3261  alcohol dehydrogenase  38.44 
 
 
327 aa  169  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0255944 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1534  chlorophyll synthesis pathway, BchC  30.28 
 
 
321 aa  153  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910743 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3128  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.05 
 
 
328 aa  152  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3747  alcohol dehydrogenase  36.88 
 
 
323 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00165792  hitchhiker  0.00000793402 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0898  chlorophyll synthesis pathway, BchC  29.91 
 
 
334 aa  149  9e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.714457  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0980  chlorophyll synthesis pathway, BchC  28.66 
 
 
334 aa  145  6e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0401  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide  30.37 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.632471  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1791  chlorophyll synthesis pathway, BchC  28.79 
 
 
334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.916125  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0938  chlorophyll synthesis pathway, BchC  31.97 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1422  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide  29.45 
 
 
334 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3133  alcohol dehydrogenase  29.7 
 
 
329 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0994  alcohol dehydrogenase  22.88 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  24.5 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  24.5 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.43 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  24.22 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  24.22 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1109  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.75 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1445  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.68 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  23.93 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  23.93 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.93 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  23.93 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.09 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  23.65 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1181  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.81 
 
 
319 aa  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.531712 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.78 
 
 
335 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  24.92 
 
 
356 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0923  chlorobiumquinone synthase BchC related protein  25.16 
 
 
318 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.125274  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0577  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.72 
 
 
342 aa  63.2  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.105265  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  23.77 
 
 
337 aa  62.4  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05001  L-threonine 3-dehydrogenase  24.48 
 
 
360 aa  62  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1497  chlorobiumquinone synthase BchC related protein  23.81 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.132648  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001213  L-threonine 3-dehydrogenase  24.12 
 
 
343 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1545  alcohol dehydrogenase  27.11 
 
 
322 aa  59.3  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0146504 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1528  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.27 
 
 
320 aa  58.9  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.46 
 
 
323 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  24.92 
 
 
348 aa  57  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0178  alcohol dehydrogenase  23.97 
 
 
336 aa  57  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1421  alcohol dehydrogenase  25.85 
 
 
343 aa  57  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06260  zinc-binding dehydrogenase, putative  25.16 
 
 
349 aa  56.2  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.040279  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  23.46 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0121  L-threonine 3-dehydrogenase  23.41 
 
 
341 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.22 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2028  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.43 
 
 
349 aa  53.9  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37466  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.64 
 
 
340 aa  54.3  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4706  alcohol dehydrogenase  25.8 
 
 
341 aa  54.3  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01050  sorbitol dehydrogenase, putative  23.66 
 
 
379 aa  53.5  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917438  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.28 
 
 
337 aa  53.5  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0353  L-threonine 3-dehydrogenase  22.42 
 
 
343 aa  53.9  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  25.35 
 
 
352 aa  53.5  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1853  L-threonine 3-dehydrogenase  24.16 
 
 
344 aa  53.1  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.981388  normal  0.0441816 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5128  zinc-binding dehydrogenase  24.62 
 
 
337 aa  52.8  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1003  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.9 
 
 
342 aa  52.8  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.124693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2786  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25.08 
 
 
341 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2830  alcohol dehydrogenase  25.08 
 
 
341 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.782331  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  23.31 
 
 
343 aa  52.4  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.25 
 
 
333 aa  52.8  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3598  putative dehydrogenase  36.91 
 
 
337 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927271  hitchhiker  0.00450633 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2076  L-threonine 3-dehydrogenase  24.69 
 
 
342 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0654334  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6310  alcohol dehydrogenase  25.32 
 
 
345 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0837  L-threonine 3-dehydrogenase  22.49 
 
 
343 aa  52.4  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178921  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  23.7 
 
 
338 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0731443 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4931  alcohol dehydrogenase  27.64 
 
 
337 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.46 
 
 
343 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386855  normal  0.701371 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.8 
 
 
341 aa  51.2  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  26.38 
 
 
349 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  25.08 
 
 
341 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.51 
 
 
340 aa  51.6  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4823  L-threonine 3-dehydrogenase  23.53 
 
 
341 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204753 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  20.06 
 
 
346 aa  50.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6469  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  24.68 
 
 
345 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6704  alcohol dehydrogenase  24.68 
 
 
345 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710863  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0429  alcohol dehydrogenase  27.44 
 
 
336 aa  50.8  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0511556  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11563  alcohol dehydrogenase adh  39.77 
 
 
367 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  23.48 
 
 
343 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0639  alcohol dehydrogenase  24.18 
 
 
322 aa  50.4  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000239851  hitchhiker  0.000149204 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  23.31 
 
 
343 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  23.48 
 
 
341 aa  49.7  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  23.48 
 
 
341 aa  49.7  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1823  alcohol dehydrogenase  26.5 
 
 
350 aa  49.3  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00496203  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2686  L-threonine 3-dehydrogenase  22.15 
 
 
345 aa  49.3  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00603723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>